seq1 = pF1KB5919.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KB5919/gi568815592r_115842417.tfa (gi568815592r:115842417_116160311), 317895 bp

>pF1KB5919 1515
>gi568815592r:115842417_116160311 (Chr6)

(complement)

1-344  (100001-100344)   100% ->
345-466  (156314-156435)   100% ->
467-630  (191573-191736)   100% ->
631-799  (192593-192761)   100% ->
800-958  (203702-203860)   100% ->
959-1140  (215887-216068)   100% ->
1141-1306  (217127-217292)   100% ->
1307-1515  (217687-217895)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCAACATCTGTCAGAGGCTCTGGGAGTACCTAGAACCCTATCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCAACATCTGTCAGAGGCTCTGGGAGTACCTAGAACCCTATCTCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTTTGTCCACGGAGGCAGACAAGTCAACCGTGATTGAAAATCCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTTTGTCCACGGAGGCAGACAAGTCAACCGTGATTGAAAATCCAGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTTTGCTCTCCCCAGTCACAGAGGCATGGCCACTACTTTGTGGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTTTGCTCTCCCCAGTCACAGAGGCATGGCCACTACTTTGTGGCTTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGATTACCAGGCTCGGACTGCTGAGGACTTGAGCTTCCGAGCAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGATTACCAGGCTCGGACTGCTGAGGACTTGAGCTTCCGAGCAGGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAACTTCAAGTTCTGGACACTTTGCATGAGGGCTGGTGGTTTGCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAACTTCAAGTTCTGGACACTTTGCATGAGGGCTGGTGGTTTGCCAGAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTGGAGAAAAGACGAGATGGCTCCAGTCAGCAACTACAAGGCTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTGGAGAAAAGACGAGATGGCTCCAGTCAGCAACTACAAGGCTATATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTTCTAACTACGTGGCTGAGGACAGAAGCCTACAGGCAGAGCC      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100301 CCTTCTAACTACGTGGCTGAGGACAGAAGCCTACAGGCAGAGCCGTG...

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345    GTGGTTCTTTGGAGCAATCGGAAGATCAGATGCAGAGAAACAACTAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156311 TAGGTGGTTCTTTGGAGCAATCGGAAGATCAGATGCAGAGAAACAACTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TATATTCAGAAAACAAGACCGGTTCCTTTCTAATCAGAGAAAGTGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156361 TATATTCAGAAAACAAGACCGGTTCCTTTCTAATCAGAGAAAGTGAAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAAAAAGGAGAATTCTCTCTTTCAG         TTTTAGATGGAGCAGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 156411 CAAAAAGGAGAATTCTCTCTTTCAGGTA...CAGTTTTAGATGGAGCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGTAAAACACTACAGAATTAAAAGACTGGATGAAGGGGGATTTTTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191589 TGTAAAACACTACAGAATTAAAAGACTGGATGAAGGGGGATTTTTTCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CGCGAAGAAGAATCTTTTCAACACTGAACGAATTTGTGAGCCACTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191639 CGCGAAGAAGAATCTTTTCAACACTGAACGAATTTGTGAGCCACTACACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAGACAAGTGACGGCCTGTGTGTCAAGCTGGGGAAACCATGCTTAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 191689 AAGACAAGTGACGGCCTGTGTGTCAAGCTGGGGAAACCATGCTTAAAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    631        ATCCAGGTCCCAGCTCCATTTGATTTGTCGTATAAAACCGTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191739 G...CAGATCCAGGTCCCAGCTCCATTTGATTTGTCGTATAAAACCGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACCAATGGGAGATAGACCGCAACTCCATACAGCTTCTGAAGCGATTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192636 ACCAATGGGAGATAGACCGCAACTCCATACAGCTTCTGAAGCGATTGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCTGGTCAGTTTGGCGAAGTATGGGAAGGTCTGTGGAACAATACCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192686 TCTGGTCAGTTTGGCGAAGTATGGGAAGGTCTGTGGAACAATACCACTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGTAGCAGTGAAAACATTAAAACCAG         GTTCAATGGATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 192736 AGTAGCAGTGAAAACATTAAAACCAGGTG...CAGGTTCAATGGATCCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGACTTCCTGAGGGAGGCACAGATAATGAAGAACCTAAGACATCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203717 ATGACTTCCTGAGGGAGGCACAGATAATGAAGAACCTAAGACATCCAAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTTATCCAGCTTTATGCTGTTTGCACTTTAGAAGATCCAATTTATATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203767 CTTATCCAGCTTTATGCTGTTTGCACTTTAGAAGATCCAATTTATATTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TACAGAGTTGATGAGACATGGAAGTCTGCAAGAATATCTCCAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 203817 TACAGAGTTGATGAGACATGGAAGTCTGCAAGAATATCTCCAAAGTA...

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    959    ATGACACTGGATCAAAAATCCATCTGACTCAACAGGTAGACATGGCG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215884 TAGATGACACTGGATCAAAAATCCATCTGACTCAACAGGTAGACATGGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GCACAGGTTGCCTCTGGAATGGCCTATCTGGAGTCTCGGAACTACATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215934 GCACAGGTTGCCTCTGGAATGGCCTATCTGGAGTCTCGGAACTACATTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAGAGATCTGGCTGCCAGAAATGTCCTCGTTGGTGAACATAATATCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215984 CAGAGATCTGGCTGCCAGAAATGTCCTCGTTGGTGAACATAATATCTACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AAGTAGCAGATTTTGGACTTGCCAGAGTTTTTAAG         GTAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 216034 AAGTAGCAGATTTTGGACTTGCCAGAGTTTTTAAGGTG...CAGGTAGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AATGAAGACATCTATGAATCTAGACACGAAATAAAGCTGCCGGTGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217133 AATGAAGACATCTATGAATCTAGACACGAAATAAAGCTGCCGGTGAAGTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GACTGCGCCCGAAGCCATTCGTAGTAATAAATTCAGCATTAAGTCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217183 GACTGCGCCCGAAGCCATTCGTAGTAATAAATTCAGCATTAAGTCCGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TATGGTCATTTGGAATCCTTCTTTATGAAATCATTACTTATGGCAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217233 TATGGTCATTTGGAATCCTTCTTTATGAAATCATTACTTATGGCAAAATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CCTTACAGTG         GTATGACAGGTGCCCAGGTAATCCAGATGTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 217283 CCTTACAGTGGTG...AAGGTATGACAGGTGCCCAGGTAATCCAGATGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGCTCAAAACTATAGACTTCCGCAACCATCCAACTGTCCACAGCAATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217718 GGCTCAAAACTATAGACTTCCGCAACCATCCAACTGTCCACAGCAATTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ACAACATCATGTTGGAGTGCTGGAATGCAGAGCCTAAGGAACGACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217768 ACAACATCATGTTGGAGTGCTGGAATGCAGAGCCTAAGGAACGACCTACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TTTGAGACACTGCGTTGGAAACTTGAAGACTATTTTGAAACAGACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217818 TTTGAGACACTGCGTTGGAAACTTGAAGACTATTTTGAAACAGACTCTTC

   1550     .    :    .    :    .
   1488 ATATTCAGATGCAAATAACTTCATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 217868 ATATTCAGATGCAAATAACTTCATAAGA