seq1 = pF1KB5897.tfa, 2511 bp
seq2 = pF1KB5897/gi568815581r_42013652.tfa (gi568815581r:42013652_42221227), 207576 bp

>pF1KB5897 2511
>gi568815581r:42013652_42221227 (Chr17)

(complement)

1-339  (99924-100262)   100% ->
340-463  (100399-100522)   100% ->
464-609  (100858-101003)   100% ->
610-699  (101109-101198)   100% ->
700-881  (101510-101691)   100% ->
882-1073  (101792-101983)   100% ->
1074-1180  (102825-102931)   100% ->
1181-1291  (103211-103321)   100% ->
1292-1428  (103414-103550)   100% ->
1429-1637  (103632-103840)   100% ->
1638-1764  (104067-104193)   100% ->
1765-1875  (105395-105505)   100% ->
1876-2019  (106193-106336)   100% ->
2020-2134  (106624-106738)   100% ->
2135-2171  (106834-106870)   100% ->
2172-2235  (106946-107009)   100% ->
2236-2320  (107144-107228)   100% ->
2321-2511  (107386-107576)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAACCTTCCCAGGCCCCGACCCCGGCCCCGGCTGCGCAGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99924 ATGGCGGAACCTTCCCAGGCCCCGACCCCGGCCCCGGCTGCGCAGCCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCCTTCAGTCCCCAGCCCCTGCCCCAACTCCGACTCCTGCACCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99974 GCCCCTTCAGTCCCCAGCCCCTGCCCCAACTCCGACTCCTGCACCCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCTTCAGCCCCGATTCCGACTCCCACCCCGGCACCAGCCCCTGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100024 CGGCTTCAGCCCCGATTCCGACTCCCACCCCGGCACCAGCCCCTGCCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGCAGCCCCAGCCGGCAGCACAGGGACTGGGGGGCCCGGGGTAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100074 GCTGCAGCCCCAGCCGGCAGCACAGGGACTGGGGGGCCCGGGGTAGGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGGGGGCCGGGAGCGGGGGGGATCCGGCTCGACCTGGCCTGAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100124 TGGGGGGGCCGGGAGCGGGGGGGATCCGGCTCGACCTGGCCTGAGCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAGCGCGCCAGTCAGAGGAAGGCGCAAGTCCGGGGGCTGCCGCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100174 AGCAGCGCGCCAGTCAGAGGAAGGCGCAAGTCCGGGGGCTGCCGCGCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGAAGCTTGAGAAGCTAGGGGTCTTCTCGGCTTGCAAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100224 AAGAAGCTTGAGAAGCTAGGGGTCTTCTCGGCTTGCAAGGTG...CAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAATGAAACCTGTAAGTGTAATGGCTGGAAAAACCCCAAGCCCCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAATGAAACCTGTAAGTGTAATGGCTGGAAAAACCCCAAGCCCCCCACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CACCCCGCATGGATCTGCAGCAGCCAGCTGCCAACCTGAGTGAGCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACCCCGCATGGATCTGCAGCAGCCAGCTGCCAACCTGAGTGAGCTGTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGCAGTTGTGAGCACCCCTTGG         CTGACCACGTATCCCACTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100501 CGCAGTTGTGAGCACCCCTTGGGTA...CAGCTGACCACGTATCCCACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGAATGTGTCAGAGGATGAGATAAACCGACTGCTGGGGATGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100877 GGAGAATGTGTCAGAGGATGAGATAAACCGACTGCTGGGGATGGTGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGTGGAGAATCTCTTCATGTCTGTTCACAAGGAAGAGGACACAGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100927 ATGTGGAGAATCTCTTCATGTCTGTTCACAAGGAAGAGGACACAGACACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAGCAGGTCTATTTCTACCTCTTCAAG         CTACTGCGGAAATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100977 AAGCAGGTCTATTTCTACCTCTTCAAGGTG...TAGCTACTGCGGAAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CATCCTGCAGATGACCCGGCCTGTGGTGGAGGGGTCCCTGGGCAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101123 CATCCTGCAGATGACCCGGCCTGTGGTGGAGGGGTCCCTGGGCAGCCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CATTTGAGAAACCTAATATTGAGCAG         GGTGTGCTGAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101173 CATTTGAGAAACCTAATATTGAGCAGGTG...CAGGGTGTGCTGAACTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTGCAGTACAAGTTTAGTCACCTGGCTCCCCGGGAGCGGCAGACGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101525 GTGCAGTACAAGTTTAGTCACCTGGCTCCCCGGGAGCGGCAGACGATGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGAGCTCTCAAAGATGTTCTTGCTCTGCCTTAACTACTGGAAGCTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101575 CGAGCTCTCAAAGATGTTCTTGCTCTGCCTTAACTACTGGAAGCTTGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CACCTGCCCAGTTTCGGCAGAGGTCTCAGGCTGAGGACGTGGCTACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101625 CACCTGCCCAGTTTCGGCAGAGGTCTCAGGCTGAGGACGTGGCTACCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAGGTCAATTACACCAG         ATGGCTCTGTTACTGCCACGTGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101675 AAGGTCAATTACACCAGGTA...CAGATGGCTCTGTTACTGCCACGTGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCAGAGCTGTGATAGCCTCCCCCGCTACGAAACCACTCATGTCTTTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101816 CCAGAGCTGTGATAGCCTCCCCCGCTACGAAACCACTCATGTCTTTGGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GAAGCCTTCTCCGGTCCATTTTCACCGTTACCCGCCGGCAGCTGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101866 GAAGCCTTCTCCGGTCCATTTTCACCGTTACCCGCCGGCAGCTGCTGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AAGTTCCGAGTGGAGAAGGACAAATTGGTGCCCGAGAAGAGGACCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101916 AAGTTCCGAGTGGAGAAGGACAAATTGGTGCCCGAGAAGAGGACCCTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCTCACTCACTTCCCCAA         ATTCCTGTCCATGCTGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101966 CCTCACTCACTTCCCCAAGTA...CAGATTCCTGTCCATGCTGGAGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AGATCTATGGGGCAAACTCTCCAATCTGGGAGTCAGGCTTCACCATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102848 AGATCTATGGGGCAAACTCTCCAATCTGGGAGTCAGGCTTCACCATGCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CCCTCAGAGGGGACACAGCTGGTTCCCCGGCCAG         CTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102898 CCCTCAGAGGGGACACAGCTGGTTCCCCGGCCAGGTA...CAGCTTCAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CAGTGCAGCGGTTGTTCCCAGCACCCCCATCTTCAGCCCCAGCATGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103218 CAGTGCAGCGGTTGTTCCCAGCACCCCCATCTTCAGCCCCAGCATGGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GGGGCAGCAACAGCTCCCTGAGTCTGGATTCTGCAGGGGCCGAGCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103268 GGGGCAGCAACAGCTCCCTGAGTCTGGATTCTGCAGGGGCCGAGCCTATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCAG         GCGAGAAGAGGACGCTCCCAGAGAACCTGACCCTGGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103318 CCAGGTG...TAGGCGAGAAGAGGACGCTCCCAGAGAACCTGACCCTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGATGCCAAGCGGCTCCGTGTGATGGGTGACATCCCCATGGAGCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103451 GGATGCCAAGCGGCTCCGTGTGATGGGTGACATCCCCATGGAGCTGGTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ATGAGGTCATGCTGACCATCACTGACCCTGCTGCCATGCTGGGGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103501 ATGAGGTCATGCTGACCATCACTGACCCTGCTGCCATGCTGGGGCCTGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429          ACGAGCCTGCTTTCGGCCAATGCGGCCCGGGATGAGACAGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103551 GTG...CAGACGAGCCTGCTTTCGGCCAATGCGGCCCGGGATGAGACAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CCGCCTGGAGGAGCGCCGCGGCATCATCGAGTTCCATGTCATCGGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103673 CCGCCTGGAGGAGCGCCGCGGCATCATCGAGTTCCATGTCATCGGCAACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CACTGACGCCCAAGGCCAACCGGCGGGTGTTGCTGTGGCTCGTGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103723 CACTGACGCCCAAGGCCAACCGGCGGGTGTTGCTGTGGCTCGTGGGGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAGAATGTCTTTTCCCACCAGCTGCCGCGCATGCCTAAGGAGTATATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103773 CAGAATGTCTTTTCCCACCAGCTGCCGCGCATGCCTAAGGAGTATATCGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CCGCCTCGTCTTTGACCC         GAAGCACAAGACTCTGGCCTTGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103823 CCGCCTCGTCTTTGACCCGTG...TAGGAAGCACAAGACTCTGGCCTTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TCAAGGATGGGCGGGTCATCGGTGGCATCTGCTTCCGCATGTTTCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104090 TCAAGGATGGGCGGGTCATCGGTGGCATCTGCTTCCGCATGTTTCCCACC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CAGGGCTTCACGGAGATTGTCTTCTGTGCTGTCACCTCGAATGAGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104140 CAGGGCTTCACGGAGATTGTCTTCTGTGCTGTCACCTCGAATGAGCAGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CAAG         GGTTATGGGACCCACCTGATGAACCACCTGAAGGAGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104190 CAAGGTG...CAGGGTTATGGGACCCACCTGATGAACCACCTGAAGGAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ATCACATCAAGCACAACATTCTCTACTTCCTCACCTACGCCGACGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105432 ATCACATCAAGCACAACATTCTCTACTTCCTCACCTACGCCGACGAGTAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GCCATCGGCTACTTCAAAAAGCAG         GGTTTCTCCAAGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105482 GCCATCGGCTACTTCAAAAAGCAGGTG...CAGGGTTTCTCCAAGGACAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CAAGGTGCCCAAGAGCCGCTACCTGGGCTACATCAAGGACTACGAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106210 CAAGGTGCCCAAGAGCCGCTACCTGGGCTACATCAAGGACTACGAGGGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CGACGCTGATGGAGTGTGAGCTGAATCCCCGCATCCCCTACACGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106260 CGACGCTGATGGAGTGTGAGCTGAATCCCCGCATCCCCTACACGGAGCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 TCCCACATCATCAAGAAGCAGAAAGAG         ATCATCAAGAAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106310 TCCCACATCATCAAGAAGCAGAAAGAGGTG...CAGATCATCAAGAAGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GATTGAGCGCAAACAGGCCCAGATCCGCAAGGTCTACCCGGGGCTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106638 GATTGAGCGCAAACAGGCCCAGATCCGCAAGGTCTACCCGGGGCTCAGCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GCTTCAAGGAGGGCGTGAGGCAGATCCCTGTGGAGAGCGTTCCTGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106688 GCTTCAAGGAGGGCGTGAGGCAGATCCCTGTGGAGAGCGTTCCTGGCATT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 C         GAGAGACAGGCTGGAAGCCATTGGGGAAGGAGAAGGG   
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 106738 CGTA...CAGGAGAGACAGGCTGGAAGCCATTGGGGAAGGAGAAGGGGTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2172       GAAGGAGCTGAAGGACCCCGACCAGCTCTACACAACCCTCAAAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106874 ...CAGGAAGGAGCTGAAGGACCCCGACCAGCTCTACACAACCCTCAAAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ACCTGCTGGCCCAAATCAAG         TCTCACCCCAGTGCCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106990 ACCTGCTGGCCCAAATCAAGGTG...CAGTCTCACCCCAGTGCCTGGCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 TTCATGGAGCCTGTGAAGAAGTCGGAGGCCCCTGACTACTACGAGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107165 TTCATGGAGCCTGTGAAGAAGTCGGAGGCCCCTGACTACTACGAGGTCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CCGCTTCCCCATTG         ACCTGAAGACCATGACTGAGCGGCTGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107215 CCGCTTCCCCATTGGTG...CAGACCTGAAGACCATGACTGAGCGGCTGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 GAAGCCGCTACTACGTGACCCGGAAGCTCTTTGTGGCCGACCTGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107413 GAAGCCGCTACTACGTGACCCGGAAGCTCTTTGTGGCCGACCTGCAGCGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 GTCATCGCCAACTGTCGCGAGTACAACCCCCCGGACAGCGAGTACTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107463 GTCATCGCCAACTGTCGCGAGTACAACCCCCCGGACAGCGAGTACTGCCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 CTGTGCCAGCGCCCTGGAGAAGTTCTTCTACTTCAAGCTCAAGGAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107513 CTGTGCCAGCGCCCTGGAGAAGTTCTTCTACTTCAAGCTCAAGGAGGGAG

   2650     .    :
   2498 GCCTCATTGACAAG
        ||||||||||||||
 107563 GCCTCATTGACAAG