seq1 = pF1KB5883.tfa, 1401 bp
seq2 = pF1KB5883/gi568815587r_8821319.tfa (gi568815587r:8821319_9032308), 210990 bp

>pF1KB5883 1401
>gi568815587r:8821319_9032308 (Chr11)

(complement)

1-167  (100001-100167)   100% ->
168-324  (102776-102932)   100% ->
325-559  (105135-105369)   100% ->
560-1204  (106202-106846)   99% ->
1205-1401  (110794-110990)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATCCTCCACGGGGCCCAGGATGCCTTTGCTCAAATACTGCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATCCTCCACGGGGCCCAGGATGCCTTTGCTCAAATACTGCAGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCACAAGCCTGAAGGCCCCTGGCTGGGACGGTGCTGCTCCACCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCACAAGCCTGAAGGCCCCTGGCTGGGACGGTGCTGCTCCACCTTGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTCTCCTTCACCTACCCCTTTGCCCTCCAAGCACCCTGGCTCACCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTCTCCTTCACCTACCCCTTTGCCCTCCAAGCACCCTGGCTCACCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACAAGCCCCTTGCAAG         GCATGCCTCTTCTTGCCCATGTCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100151 CACAAGCCCCTTGCAAGGTA...CAGGCATGCCTCTTCTTGCCCATGTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCACGTTGCCGACCCAGCATGGCAGGGGCCTGGCTGGCTGGGAAGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102800 CCACGTTGCCGACCCAGCATGGCAGGGGCCTGGCTGGCTGGGAAGAGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAGATGCTGCCAACACATGGGTCCTAGCAAGAAGGGAAGCAGATGGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102850 GAGATGCTGCCAACACATGGGTCCTAGCAAGAAGGGAAGCAGATGGTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACTACCGGGCCCAAATAAAGGCCACTCCCGAG         CTGGAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102900 TACTACCGGGCCCAAATAAAGGCCACTCCCGAGGCA...CAGCTGGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACAGGGGGTCCTGCTTGTGGAATTCGAGGCTCCTCTTGTCGCAGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105143 ACAGGGGGTCCTGCTTGTGGAATTCGAGGCTCCTCTTGTCGCAGGCCCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCTGCCAGCCCAGCAGCAGAGAGTGGTCTTAGAAGAGGATGTCATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105193 AGCTGCCAGCCCAGCAGCAGAGAGTGGTCTTAGAAGAGGATGTCATTCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCTCACCATCTGTAGGATACTCACTGAGACCAGGGGATAAGGTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105243 CTCTCACCATCTGTAGGATACTCACTGAGACCAGGGGATAAGGTGCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACTCTGGGAGCCAGGCCAACAGCAGTATGGCCCTGGCACTGTTCTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105293 ACTCTGGGAGCCAGGCCAACAGCAGTATGGCCCTGGCACTGTTCTTTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCTTGGAGATGAGAGATCCCCAGAGAG         CATCAAAGGAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105343 GCTTGGAGATGAGAGATCCCCAGAGAGGTA...TAGCATCAAAGGAAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAATCACTGTTCATTTCTGGAATGGCAAAGCTGCTAAAGTGCCCCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106216 GAAATCACTGTTCATTTCTGGAATGGCAAAGCTGCTAAAGTGCCCCTAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGGGGTCCAGTCGGTGTCCCTGACCATCTGGAAGAAGGCTGTGGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106266 TGGGGTCCAGTCGGTGTCCCTGACCATCTGGAAGAAGGCTGTGGAGAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCACAAGTCTTTCACCAGGGAGCACCCCAGGCCCCTTCACTGGGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106316 TGCACAAGTCTTTCACCAGGGAGCACCCCAGGCCCCTTCACTGGGCCCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TGCTGCTCTCTGCTAGGGCCAATCACTGGGCGCATCACTAATGAGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106366 TGCTGCTCTCTGCTAGGGCCAATCACTGGGCGCATCACTAATGAGCTTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCCGGATGCTCCATTCCTGTGCCCTCTCTGCCACCATCATGCCTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106416 TCCGGATGCTCCATTCCTGTGCCCTCTCTGCCACCATCATGCCTGCTGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGCTACTGTGCCAGGGCTGCCTCTGTGGCTGCCCGCCATGTGGCACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106466 AGCTACTGTGCCAGGGCTGCCTCTGTGGCTGCCCGCCATGTGGCACGACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TGGTGGCCTCTAACCAGGACCTCAGAAGTCATGGCCAGAGAACTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106516 TGGTGGCCTCTAACCAGGACCTCAGAAGTCATGGCCAGAGAACTTCCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GTTGGAGCCCACAGCACAGCTTTTGCCCCTGGAAGGTCCTAAAGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106566 GTTGGAGCCCACAGCACAGCTTTTGCCCCTGGAAGGTCCTAAAGAGGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AAGTAGCAATGCACGCTCCCCTGGCTGTTTCTTCCTCCTCATCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106616 AAGTAGCAATGCACGCTCCCCTGGCTGTTTCTTCCTCCTCATCCTCCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TGTGAACAAGATGGTGTGGAGAATGATCTGGAGATGGGCCCTCCCCAGAG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106666 TGTGAACAAGACGGTGTGGAGAATGATCTGGAGATGGGCCCTCCCCAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 ACTGATGGTGAACAGTGCAGTCAACACAGATCCCATCTTTCTTGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106716 ACTGATGGTGAACAGTGCAGTCAACACAGATCCCATCTTTCTTGAGATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CTCTGAGACAGAGTGGCCTCTGCCAGCCTGAGTGGAGGTATTGGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106766 CTCTGAGACAGAGTGGCCTCTGCCAGCCTGAGTGGAGGTATTGGAAGAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AACGGGCCTGAGCCATGCCCTGGGAAGCCAG         GAACAAGATA
        ||||||||||||||||||| |||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106816 AACGGGCCTGAGCCATGCCTTGGGAAGCCAGGTA...TAGGAACAAGATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TTCCAACATCTGCAAAGAAGAAAAGGATCACAAACAGCAGAGAGCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110804 TTCCAACATCTGCAAAGAAGAAAAGGATCACAAACAGCAGAGAGCACAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CTGTAGTAGTGGGGACTACCAAGGAGCTGGTCTCGAAAGCAACCCACATG
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110854 CTGCAGTAGTGGGGACTACCAAGGAGCTGGTCTCGAAAGCAACCCACATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AAGCCACCGCAGACCCCGCCAGGGGAAGCTGAACACAGAAAGCGGAGTCA
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110904 AAGCCACCGCGGACCCCGCCAGGGGAAGCTGAACACAGAAAGCGGAGTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .
   1365 GAGCCTTGCAATATGTCAGTGGAACAAGAATTCCCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110954 GAGCCTTGCAATATGTCAGTGGAACAAGAATTCCCGT