seq1 = pF1KB5878.tfa, 1485 bp
seq2 = pF1KB5878/gi568815583r_56329104.tfa (gi568815583r:56329104_56564248), 235145 bp

>pF1KB5878 1485
>gi568815583r:56329104_56564248 (Chr15)

(complement)

1-225  (100000-100223)   99% ->
226-353  (107728-107855)   100% ->
354-456  (117306-117408)   100% ->
457-686  (119576-119805)   100% ->
687-903  (120395-120611)   100% ->
904-1011  (120712-120819)   100% ->
1012-1269  (129854-130111)   100% ->
1270-1395  (132751-132876)   99% ->
1396-1485  (135056-135145)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTTCCAAAAGGAGAAATTTGAGCTGTAGTGAAAGGCATCAGAAATT
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGGTTCCAAAAGGAGAAATTTGAGCTGTAGTGAAAGGCATCAGAAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTAGATGAAAACTACTGCAAAAAATTACATGTCCAAGCTCTAAAAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 AGTAGATGAAAACTACTGCAAAAAATTACATGTCCAAGCTCTAAAAAACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAACAGTCAAATCAGGAATCAAATGGTGCAGAATGAAAATGATAACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 TCAACAGTCAAATCAGGAATCAAATGGTGCAGAATGAAAATGATAACCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTCAGCGCAAGCAATTTCTCAGATTATTACAAAATGAACAATTTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 GTTCAGCGCAAGCAATTTCTCAGATTATTACAAAATGAACAATTTGAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGATATGGAAGAGGCCATTCAAAAG         GCAGAAGAAAACAAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100199 GGATATGGAAGAGGCCATTCAAAAGGTA...CAGGCAGAAGAAAACAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATTGAAAGAACTCCAGCTCAAACAAGAAGAAAAACTGGCTATGGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107744 GATTGAAAGAACTCCAGCTCAAACAAGAAGAAAAACTGGCTATGGAATTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCAAAACTGAAACATGAAAGTCTAAAGGACGAAAAGATGAGGCAACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107794 GCAAAACTGAAACATGAAAGTCTAAAGGACGAAAAGATGAGGCAACAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAGAGAAAACAG         CATTGAGCTTAGAGAATTGGAGAAGAAAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107844 AAGAGAAAACAGGTA...CAGCATTGAGCTTAGAGAATTGGAGAAGAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TAAAAGCAGCTTACATGAATAAAGAAAGGGCAGCTCAGATTGCTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117335 TAAAAGCAGCTTACATGAATAAAGAAAGGGCAGCTCAGATTGCTGAAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATGCCATTAAATATGAACAAATG         AAACGTGATGCTGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 117385 GATGCCATTAAATATGAACAAATGGTA...CAGAAACGTGATGCTGAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCCAAAACCATGATGGAAGAACACAAGAGAATAATAAAGGAAGAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119593 AGCCAAAACCATGATGGAAGAACACAAGAGAATAATAAAGGAAGAGAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGCAGAAGACAAACGAAACAAAGCGAAAGCACAGTACTATCTTGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119643 CTGCAGAAGACAAACGAAACAAAGCGAAAGCACAGTACTATCTTGACTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGAAACAACTTGAAGAACAAGAAAAAAAAAAGCAGGAAGCTTATGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119693 GAGAAACAACTTGAAGAACAAGAAAAAAAAAAGCAGGAAGCTTATGAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCTGCTAAAAGAGAAACTCATGATTGATGAAATTGTTAGGAAGATCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119743 GCTGCTAAAAGAGAAACTCATGATTGATGAAATTGTTAGGAAGATCTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AAGAAGATCAGTT         GGAAAAACAACAAAAGTTAGAAAAAATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 119793 AAGAAGATCAGTTGTA...CAGGGAAAAACAACAAAAGTTAGAAAAAATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AATGCAATGCGAAGGTATATAGAAGAGTTTCAGAAAGAGCAGGCTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120423 AATGCAATGCGAAGGTATATAGAAGAGTTTCAGAAAGAGCAGGCTCTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAGAAAAAAGAAACGTGAGGAGATGGAAGAAGAAAACAGAAAAATCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120473 GAGAAAAAAGAAACGTGAGGAGATGGAAGAAGAAAACAGAAAAATCATAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGTTTGCTAACATGCAGCAGCAAAGAGAAGAAGATCGGATGGCAAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120523 AGTTTGCTAACATGCAGCAGCAAAGAGAAGAAGATCGGATGGCAAAAGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CAAGAAAATGAGGAGAAAAGGCTACAGCTTCAGAATGCG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 120573 CAAGAAAATGAGGAGAAAAGGCTACAGCTTCAGAATGCGGTA...TAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GACACAGAAATTAGAAGAAATGCTGCGGCAACGTGAAGATTTGGAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120714 GACACAGAAATTAGAAGAAATGCTGCGGCAACGTGAAGATTTGGAACAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGCGACAAGAATTATACCAGGAAGAACAAGCTGAAATATATAAGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120764 TGCGACAAGAATTATACCAGGAAGAACAAGCTGAAATATATAAGAGCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTAAAA         GAAGAAGCAGAAAAGAAATTGAGAAAGCAAAAAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120814 CTAAAAGTA...TAGGAAGAAGCAGAAAAGAAATTGAGAAAGCAAAAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GATGAAGCAAGATTTTGAAGAACAAATGGCCTTGAAGGAATTAGTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129889 GATGAAGCAAGATTTTGAAGAACAAATGGCCTTGAAGGAATTAGTGCTAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AGGCTGCAAAAGAGGAAGAGGAGAACTTTAGAAAAACTATGCTAGCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129939 AGGCTGCAAAAGAGGAAGAGGAGAACTTTAGAAAAACTATGCTAGCTAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TTTGCTGAGGATGATCGAATAGAATTAATGAATGCTCAGAAACAAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129989 TTTGCTGAGGATGATCGAATAGAATTAATGAATGCTCAGAAACAAAGAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GAAGCAGCTGGAACACAGGAGGGCTGTGGAAAAACTTATTGAAGAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130039 GAAGCAGCTGGAACACAGGAGGGCTGTGGAAAAACTTATTGAAGAGCGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GCCAACAATTCCTTGCAGACAAA         CAACGTGGACTAGAAGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| ||||||||||
 130089 GCCAACAATTCCTTGCAGACAAAGTA...CAGCAACGTGAACTAGAAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TGGCAGTTGCAGCAAAGGCGGCAAGGATTTATTAATGCAATTATTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132769 TGGCAGTTGCAGCAAAGGCGGCAAGGATTTATTAATGCAATTATTGAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AGAAAGGCTAAAACTTCTTAAAGAGCATGCTACAAACTTACTAGGCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132819 AGAAAGGCTAAAACTTCTTAAAGAGCATGCTACAAACTTACTAGGCTATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TCCCTAAA         GGAGTATTTAAAAAAGAGGATGATATTGATCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 132869 TCCCTAAAGTA...TAGGGAGTATTTAAAAAAGAGGATGATATTGATCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CTTGGTGAAGAGTTCAGGAAAGTATATCAACAAAGGAGTGAAATTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135089 CTTGGTGAAGAGTTCAGGAAAGTATATCAACAAAGGAGTGAAATTTGTGA

   1550     .
   1479 AGAGAAA
        |||||||
 135139 AGAGAAA