seq1 = pF1KB5868.tfa, 1479 bp
seq2 = pF1KB5868/gi568815596r_55767076.tfa (gi568815596r:55767076_56022440), 255365 bp

>pF1KB5868 1479
>gi568815596r:55767076_56022440 (Chr2)

(complement)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-130  (104174-104222)   100% ->
131-517  (104390-104776)   100% ->
518-640  (140707-140829)   100% ->
641-760  (144576-144695)   100% ->
761-880  (145699-145818)   100% ->
881-1000  (147376-147495)   99% ->
1001-1124  (151318-151441)   100% ->
1125-1320  (151526-151721)   100% ->
1321-1479  (155207-155365)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGAAAGCCCTTTTCCTAACTATGCTGACTCTGGCGCTGGTCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGAAAGCCCTTTTCCTAACTATGCTGACTCTGGCGCTGGTCAAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGGACACCGAAGAAACCATCACGTACACG         CAATGCACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 ACAGGACACCGAAGAAACCATCACGTACACGGTA...CAGCAATGCACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGGATATGAGTGGGATCCTGTGAGACAGCAATGCAAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104184 ACGGATATGAGTGGGATCCTGTGAGACAGCAATGCAAAGGTG...CAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATTGATGAATGTGACATTGTCCCAGACGCTTGTAAAGGTGGAATGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104392 ATTGATGAATGTGACATTGTCCCAGACGCTTGTAAAGGTGGAATGAAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTCAACCACTATGGAGGATACCTCTGCCTTCCGAAAACAGCCCAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104442 TGTCAACCACTATGGAGGATACCTCTGCCTTCCGAAAACAGCCCAGATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGTCAATAATGAACAGCCTCAGCAGGAAACACAACCAGCAGAAGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104492 TTGTCAATAATGAACAGCCTCAGCAGGAAACACAACCAGCAGAAGGAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCAGGGGCAACCACCGGGGTTGTAGCTGCCAGCAGCATGGCAACCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104542 TCAGGGGCAACCACCGGGGTTGTAGCTGCCAGCAGCATGGCAACCAGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGTGTTGCCCGGGGGTGGTTTTGTGGCCAGTGCTGCTGCAGTCGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104592 AGTGTTGCCCGGGGGTGGTTTTGTGGCCAGTGCTGCTGCAGTCGCAGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGAAATGCAGACTGGCCGAAATAACTTTGTCATCCGGCGGAACCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104642 CTGAAATGCAGACTGGCCGAAATAACTTTGTCATCCGGCGGAACCCAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACCCTCAGCGCATTCCCTCCAACCCTTCCCACCGTATCCAGTGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104692 GACCCTCAGCGCATTCCCTCCAACCCTTCCCACCGTATCCAGTGTGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGGCTACGAGCAAAGTGAACACAACGTGTGCCAAG         ACATAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104742 AGGCTACGAGCAAAGTGAACACAACGTGTGCCAAGGTA...CAGACATAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACGAGTGCACTGCAGGGACGCACAACTGTAGAGCAGACCAAGTGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140713 ACGAGTGCACTGCAGGGACGCACAACTGTAGAGCAGACCAAGTGTGCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AATTTACGGGGATCCTTTGCATGTCAGTGCCCTCCTGGATATCAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140763 AATTTACGGGGATCCTTTGCATGTCAGTGCCCTCCTGGATATCAGAAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGGGGAGCAGTGCGTAG         ACATAGATGAATGTACCATCCCTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 140813 AGGGGAGCAGTGCGTAGGTA...TAGACATAGATGAATGTACCATCCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CATATTGCCACCAAAGATGCGTGAATACACCAGGCTCATTTTATTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144600 CATATTGCCACCAAAGATGCGTGAATACACCAGGCTCATTTTATTGCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGCAGTCCTGGGTTTCAATTGGCAGCAAACAACTATACCTGCGTAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 144650 TGCAGTCCTGGGTTTCAATTGGCAGCAAACAACTATACCTGCGTAGGTA.

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761      ATATAAATGAATGTGATGCCAGCAATCAATGTGCTCAGCAGTGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144700 ..CAGATATAAATGAATGTGATGCCAGCAATCAATGTGCTCAGCAGTGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACAACATTCTTGGTTCATTCATCTGTCAGTGCAATCAAGGATATGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145744 ACAACATTCTTGGTTCATTCATCTGTCAGTGCAATCAAGGATATGAGCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGCAGTGACAGGCTCAACTGTGAAG         ACATTGATGAATGCAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 145794 AGCAGTGACAGGCTCAACTGTGAAGGTA...CAGACATTGATGAATGCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AACCTCAAGTTACCTGTGTCAATATCAATGTGTCAATGAACCTGGGAAAT
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147392 AACCTCAAGCTACCTGTGTCAATATCAATGTGTCAATGAACCTGGGAAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCTCATGTATGTGCCCCCAGGGATACCAAGTGGTGAGAAGTAGAACATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147442 TCTCATGTATGTGCCCCCAGGGATACCAAGTGGTGAGAAGTAGAACATGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAAG         ATATAAATGAGTGTGAGACCACAAATGAATGCCGGGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147492 CAAGGTA...CAGATATAAATGAGTGTGAGACCACAAATGAATGCCGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGATGAAATGTGTTGGAATTATCATGGCGGCTTCCGTTGTTATCCACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151355 GGATGAAATGTGTTGGAATTATCATGGCGGCTTCCGTTGTTATCCACGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATCCTTGTCAAGATCCCTACATTCTAACACCAGAGAA         CCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 151405 ATCCTTGTCAAGATCCCTACATTCTAACACCAGAGAAGTA...CAGCCGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TGTGTTTGCCCAGTCTCAAATGCCATGTGCCGAGAACTGCCCCAGTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151530 TGTGTTTGCCCAGTCTCAAATGCCATGTGCCGAGAACTGCCCCAGTCAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGTCTACAAATACATGAGCATCCGATCTGATAGGTCTGTGCCATCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151580 AGTCTACAAATACATGAGCATCCGATCTGATAGGTCTGTGCCATCAGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCTTCCAGATACAGGCCACAACTATTTATGCCAACACCATCAATACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151630 TCTTCCAGATACAGGCCACAACTATTTATGCCAACACCATCAATACTTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGGATTAAATCTGGAAATGAAAATGGAGAGTTCTACCTACGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 151680 CGGATTAAATCTGGAAATGAAAATGGAGAGTTCTACCTACGAGTA...TA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1321  CAAACAAGTCCTGTAAGTGCAATGCTTGTGCTCGTGAAGTCATTATCAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155206 GCAAACAAGTCCTGTAAGTGCAATGCTTGTGCTCGTGAAGTCATTATCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GACCAAGAGAACATATCGTGGACCTGGAGATGCTGACAGTCAGCAGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155256 GACCAAGAGAACATATCGTGGACCTGGAGATGCTGACAGTCAGCAGTATA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GGGACCTTCCGCACAAGCTCTGTGTTAAGATTGACAATAATAGTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155306 GGGACCTTCCGCACAAGCTCTGTGTTAAGATTGACAATAATAGTGGGGCC

   1550     .    :
   1470 ATTTTCATTT
        ||||||||||
 155356 ATTTTCATTT