seq1 = pF1KB5867.tfa, 1386 bp
seq2 = pF1KB5867/gi568815597r_7913213.tfa (gi568815597r:7913213_8115619), 202407 bp

>pF1KB5867 1386
>gi568815597r:7913213_8115619 (Chr1)

(complement)

1-125  (100001-100125)   100% ->
126-202  (100236-100312)   100% ->
203-1386  (101224-102407)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAATAGCAGGAGTTGCTGCTCAGGAGATCAGAGTCCCATTAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAATAGCAGGAGTTGCTGCTCAGGAGATCAGAGTCCCATTAAAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGATTTCTACATAATGGCCGAGCCATGGGGAATATGAGGAAGACCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGATTTCTACATAATGGCCGAGCCATGGGGAATATGAGGAAGACCTACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAGCAGTCGCAGTGAGTTTAAAAA         CAACTTTTTAAATATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100101 GGAGCAGTCGCAGTGAGTTTAAAAAGTA...CAGCAACTTTTTAAATATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCCGATAACCATGGCCTACAGTCTGAACTCTTCTGCTCAGGAGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100252 GACCCGATAACCATGGCCTACAGTCTGAACTCTTCTGCTCAGGAGCGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATACCACTTG         GGCATGCTTCCAAATCTGCTCCGATGAATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100302 AATACCACTTGGTA...CAGGGCATGCTTCCAAATCTGCTCCGATGAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCACTGCTTTGCAGAAAATGGTCCATCTCAAAAGTCCAGCTTGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101254 GCCACTGCTTTGCAGAAAATGGTCCATCTCAAAAGTCCAGCTTGCCCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTCTTATTCCCCCAAGTGAAAACTTGGGACCACATGAAGAGGATCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101304 CTTCTTATTCCCCCAAGTGAAAACTTGGGACCACATGAAGAGGATCAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTATGTGGTTTTAAGAAACTCACAGTGAATGGGGTTTGTGCTTCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101354 TGTATGTGGTTTTAAGAAACTCACAGTGAATGGGGTTTGTGCTTCCACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTCCACTGACACCCATAAAAAACTCCCCTTCCCTTTTCCCCTGTGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101404 CTCCACTGACACCCATAAAAAACTCCCCTTCCCTTTTCCCCTGTGCCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTTTGTGAACGGGGTTCTAGGCCTCTTCCACCGTTGCCAATCTCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101454 CTTTGTGAACGGGGTTCTAGGCCTCTTCCACCGTTGCCAATCTCTGAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTCTCTCTGGATGACACAGACTGTGAGGTGGAATTCCTAACTAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101504 CCTCTCTCTGGATGACACAGACTGTGAGGTGGAATTCCTAACTAGCTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATACAGACTTCCTTTTAGAAGACTCTACACTTTCTGATTTCAAATATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101554 ATACAGACTTCCTTTTAGAAGACTCTACACTTTCTGATTTCAAATATGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTTCCTGGCAGGCGAAGCTTCCGTGGGTGTGGACAAATCAACTATGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101604 GTTCCTGGCAGGCGAAGCTTCCGTGGGTGTGGACAAATCAACTATGCATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTTTGATACCCCAGCTGTTTCTGCAGCAGATCTCAGCTATGTGTCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101654 TTTTGATACCCCAGCTGTTTCTGCAGCAGATCTCAGCTATGTGTCTGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AAAATGGAGGTGTCCCAGATCCAAATCCTCCTCCACCTCAGACCCACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101704 AAAATGGAGGTGTCCCAGATCCAAATCCTCCTCCACCTCAGACCCACCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGATTAAGAAGGTCTCATTCGGGACCAGCTGGCTCCTTTAACAAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101754 AGATTAAGAAGGTCTCATTCGGGACCAGCTGGCTCCTTTAACAAGCCAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CATAAGGATATCCAACTGTTGTATACACAGAGCTTCTCCTAACTCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101804 CATAAGGATATCCAACTGTTGTATACACAGAGCTTCTCCTAACTCCGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AAGACAAACCTGAGGTTCCCCCCAGAGTTCCCATACCTCCTAGACCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101854 AAGACAAACCTGAGGTTCCCCCCAGAGTTCCCATACCTCCTAGACCAGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AAGCCAGATTATAGAAGATGGTCAGCAGAAGTTACTTCGAGCACCTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101904 AAGCCAGATTATAGAAGATGGTCAGCAGAAGTTACTTCGAGCACCTATAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGATGAAGACAGGCCTCCCAAAGTACCGCCAAGAGAACCTTTGTCACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101954 TGATGAAGACAGGCCTCCCAAAGTACCGCCAAGAGAACCTTTGTCACCGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GTAACTCGCGCACACCGAGTCCCAAAAGCCTTCCGTCTTACCTCAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102004 GTAACTCGCGCACACCGAGTCCCAAAAGCCTTCCGTCTTACCTCAATGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GTCATGCCCCCGACACAGAGCTTTGCCCCTGATCCCAAGTATGTCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102054 GTCATGCCCCCGACACAGAGCTTTGCCCCTGATCCCAAGTATGTCAGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CAAAGCACTGCAAAGACAGAACAGCGAAGGATCTGCCAGTAAGGTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102104 CAAAGCACTGCAAAGACAGAACAGCGAAGGATCTGCCAGTAAGGTTCCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GCATTCTGCCCATTATTGAAAATGGGAAGAAGGTTAGTTCAACACATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102154 GCATTCTGCCCATTATTGAAAATGGGAAGAAGGTTAGTTCAACACATTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TACCTACTACCTGAACGACCACCATACCTGGACAAATATGAAAAATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102204 TACCTACTACCTGAACGACCACCATACCTGGACAAATATGAAAAATTTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TAGGGAAGCAGAAGAAACAAATGGAGGCGCCCAAATCCAGCCATTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102254 TAGGGAAGCAGAAGAAACAAATGGAGGCGCCCAAATCCAGCCATTACCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CTGACTGCGGTATATCTTCAGCCACAGAAAAGCCAGACTCAAAAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102304 CTGACTGCGGTATATCTTCAGCCACAGAAAAGCCAGACTCAAAAACAAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 ATGGATCTGGGTGGCCACGTGAAGCGTAAACATTTATCCTATGTGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102354 ATGGATCTGGGTGGCCACGTGAAGCGTAAACATTTATCCTATGTGGTTTC

   1400 
   1383 TCCT
        ||||
 102404 TCCT