seq1 = pF1KB5853.tfa, 966 bp
seq2 = pF1KB5853/gi568815587r_63018776.tfa (gi568815587r:63018776_63243779), 225004 bp

>pF1KB5853 966
>gi568815587r:63018776_63243779 (Chr11)

(complement)

1-402  (100001-100402)   99% ->
403-506  (109012-109115)   99% ->
507-661  (124445-124599)   100% ->
662-966  (124700-125004)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTTTGATGTGCTCCTGGATCAAGTGGGTGGCATGGGGAGATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTTTGATGTGCTCCTGGATCAAGTGGGTGGCATGGGGAGATTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATTTGTCTGATAGCTTTCTTTTGCATCACCAACATCCTACTGTTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATTTGTCTGATAGCTTTCTTTTGCATCACCAACATCCTACTGTTCCCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATATTGTGTTGGAGAACTTCACTGCATTCACCCCTAGTCATCGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATATTGTGTTGGAGAACTTCACTGCATTCACCCCTAGTCATCGCTGCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCCCCTCCTGGACAATGACAGTGTGTCTGACAATGATACCGGGACCCT
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCCCCCTCCTGGACAATGACACTGTGTCTGACAATGATACCGGGACCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCAAGGATGACCTCCTGAGAATCTCCATCCCACTGGACTCAAACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCAAGGATGACCTCCTGAGAATCTCCATCCCACTGGACTCAAACCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCCACAGAAGTGTCAGCGCTTTATCCATCCCCAGTGGCAGCTCCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCCACAGAAGTGTCAGCGCTTTATCCATCCCCAGTGGCAGCTCCTTCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGAACGGGACCTTCCCCAACACAAATGAGCCAGACACGGAGCCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGAACGGGACCTTCCCCAACACAAATGAGCCAGACACGGAGCCCTGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATGGCTGGGTGTACGACAGAAGCTCTTTCCTCTCCACCATCGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGATGGCTGGGTGTACGACAGAAGCTCTTTCCTCTCCACCATCGTGACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AG         TGGGACCTGGTATGTGAATCTCAGTCACTAAAATCAATG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGTA...CAGTGGGACCTGGTATGTGAATCTCAGTCACTAAAATCAATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTTCAATCCCTATTTATGGCTGGGTCACTGCTGGGAGGTCTAATATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 109051 GTTCAATCCCTATTTATGGCTGGGTCACTTCTGGGAGGTCTAATATATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCATCTTTCAGACAG         GGTTGGACGGAAGATCATATGCAAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109101 CCATCTTTCAGACAGGTG...TAGGGTTGGACGGAAGATCATATGCAAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGTGTTTCCTCCAGCTGGCCATCTCTAACACCTGTGCGGCCTTCGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124471 TGTGTTTCCTCCAGCTGGCCATCTCTAACACCTGTGCGGCCTTCGCTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACCTTCCTTGTTTACTGCATACTGCGCTTCTTGGCAGGGTTCTCCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124521 ACCTTCCTTGTTTACTGCATACTGCGCTTCTTGGCAGGGTTCTCCACCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GACTATTTTGGGAAACACTTTTATTCTCA         GCTTAGAGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 124571 GACTATTTTGGGAAACACTTTTATTCTCAGTA...CAGGCTTAGAGTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CATTGCCCCGGTCACGATCTATGACAATAATGGTGCTATTATGTTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124712 CATTGCCCCGGTCACGATCTATGACAATAATGGTGCTATTATGTTCCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGTGTTGGGCAGATGCTCCTAGGAGGGCTGGCTTTTGCCATTCAGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124762 AGTGTTGGGCAGATGCTCCTAGGAGGGCTGGCTTTTGCCATTCAGGACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCACATATTGCAACTGACTGTGTCTACACCCATAATTGTCCTCTTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124812 GCACATATTGCAACTGACTGTGTCTACACCCATAATTGTCCTCTTCTTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCTCTTGGTATGAACAATCTCCACATTCTTTGCCTGTAAGCGAGGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124862 CCTCTTGGTATGAACAATCTCCACATTCTTTGCCTGTAAGCGAGGCTATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GTAGACATAGAAAGGAAAATTGTGACACCTGGGATCTGTTCGGTCTCTGG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 124912 GTAGACATAGAAAGGAAAATTCTGACACCTGGGATCTGTTCGGTCTCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCTAGTCCTGAGCCATGATGTCCATAGTACCTATTGTGTCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124962 CCTAGTCCTGAGCCATGATGTCCATAGTACCTATTGTGTCACC