seq1 = pF1KB5845.tfa, 417 bp
seq2 = pF1KB5845/gi568815579r_19101928.tfa (gi568815579r:19101928_19303060), 201133 bp

>pF1KB5845 417
>gi568815579r:19101928_19303060 (Chr19)

(complement)

1-38  (100001-100038)   100% ->
39-129  (100180-100270)   100% ->
130-235  (100486-100591)   100% ->
236-305  (100663-100732)   98% ->
306-417  (101022-101133)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCACTCTTTGGTTTGTCCAGAGACAGTGAGCAG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100001 ATGACCCACTCTTTGGTTTGTCCAGAGACAGTGAGCAGGTA...CAGGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAGTTCAGTGCTGAATCGCAACACTCGGCAGTTTGGAAAAAAACATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100183 GAGTTCAGTGCTGAATCGCAACACTCGGCAGTTTGGAAAAAAACATCTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCGACCAGGATGAGGAGACATGTTGGAACTCAGACCAG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100233 TCGACCAGGATGAGGAGACATGTTGGAACTCAGACCAGGTG...CAGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCCTCCCAGTGGGTGACGCTGGAGTTTCCCCAGCTCATCCGTGTCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100489 CCCTCCCAGTGGGTGACGCTGGAGTTTCCCCAGCTCATCCGTGTCTCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGCAGATCCAGTTTCAGGGTGGCTTCTCCAGTCGCCGGGGCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100539 GCTGCAGATCCAGTTTCAGGGTGGCTTCTCCAGTCGCCGGGGCTGCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAG         GTTCACAGGGCACTCAGGCTCTCCACAAGATTGTAGAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100589 AAGGTA...AAGGTTCACAGGGCACTCAGGCTCTCCACAAGATTGTAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTCTACCCTGAGGACAACAACTCGCTTCAGAC         TTTCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| >>>...>>>|||||||||
 100701 TTCTACCCTGAGGACAACAACTCGCTTCAGATATC...CACTTTCCCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ACCAGCTGCTGAAGTGGACCGGCTGAAGGTGACGTTTGAGGATGCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101031 ACCAGCTGCTGAAGTGGACCGGCTGAAGGTGACGTTTGAGGATGCCACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACTTTTTTGGCCGTGTGGTCATCTACCACCTGCGGGTGCTTGGGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101081 ACTTTTTTGGCCGTGTGGTCATCTACCACCTGCGGGTGCTTGGGGAGAAG

    450 
    415 GTG
        |||
 101131 GTG