seq1 = pF1KB5838.tfa, 1443 bp
seq2 = pF1KB5838/gi568815596r_231008520.tfa (gi568815596r:231008520_231223764), 215245 bp

>pF1KB5838 1443
>gi568815596r:231008520_231223764 (Chr2)

(complement)

1-352  (100001-100352)   100% ->
353-553  (109836-110036)   100% ->
554-1443  (114356-115245)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCTCTCTTACAGAGTGTCTGAACTTCAAAGCACAATTCCTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCTCTCTTACAGAGTGTCTGAACTTCAAAGCACAATTCCTGAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTTTGCAGAGCACCTTTGTTCACGTTATCTCTTCTAACTGGTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTTTGCAGAGCACCTTTGTTCACGTTATCTCTTCTAACTGGTCTGGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACAGACAGAATCAATACCAGAGGAAATGAAACAGATTGTTGAGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TACAGACAGAATCAATACCAGAGGAAATGAAACAGATTGTTGAGGAACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAAATAAACTGCACTGGGCAGCTCTTCTGATACTCATGGTGATAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGAAATAAACTGCACTGGGCAGCTCTTCTGATACTCATGGTGATAATACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACAATTGGTGGAAATACCCTTGTTATTCTGGCTGTTTCACTGGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACAATTGGTGGAAATACCCTTGTTATTCTGGCTGTTTCACTGGAGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTGCAGTATGCTACTAATTACTTTCTAATGTCCTTGGCGGTGGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTGCAGTATGCTACTAATTACTTTCTAATGTCCTTGGCGGTGGCTGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGCTGGTTGGATTGTTTGTGATGCCAATTGCCCTCTTGACAATAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGCTGGTTGGATTGTTTGTGATGCCAATTGCCCTCTTGACAATAATGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TG         AGGCTATGTGGCCCCTCCCACTTGTTCTATGTCCTGCCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGTA...CAGAGGCTATGTGGCCCCTCCCACTTGTTCTATGTCCTGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGTTATTTCTTGACGTTCTCTTTTCAACCGCATCCATCATGCATCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109875 GGTTATTTCTTGACGTTCTCTTTTCAACCGCATCCATCATGCATCTCTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCATTTCAGTGGATCGTTACATAGCCATCAAAAAGCCAATCCAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109925 GCCATTTCAGTGGATCGTTACATAGCCATCAAAAAGCCAATCCAGGCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TCAATATAACTCACGGGCTACAGCATTCATCAAGATTACAGTGGTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109975 TCAATATAACTCACGGGCTACAGCATTCATCAAGATTACAGTGGTGTGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TAATTTCAATAG         GCATTGCCATTCCAGTCCCTATTAAAGGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 110025 TAATTTCAATAGGTA...TAGGCATTGCCATTCCAGTCCCTATTAAAGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATAGAGACTGATGTGGACAACCCAAACAATATCACTTGTGTGCTGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114385 ATAGAGACTGATGTGGACAACCCAAACAATATCACTTGTGTGCTGACAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGAACGTTTTGGCGATTTCATGCTCTTTGGCTCACTGGCTGCCTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114435 GGAACGTTTTGGCGATTTCATGCTCTTTGGCTCACTGGCTGCCTTCTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CACCTCTTGCAATTATGATTGTCACCTACTTTCTCACTATCCATGCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114485 CACCTCTTGCAATTATGATTGTCACCTACTTTCTCACTATCCATGCTTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CAGAAGAAGGCTTACTTAGTCAAAAACAAGCCACCTCAACGCCTAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114535 CAGAAGAAGGCTTACTTAGTCAAAAACAAGCCACCTCAACGCCTAACATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GTTGACTGTGTCTACAGTTTTCCAAAGGGATGAAACACCTTGCTCGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114585 GTTGACTGTGTCTACAGTTTTCCAAAGGGATGAAACACCTTGCTCGTCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CGGAAAAGGTGGCAATGCTGGATGGTTCTCGAAAGGACAAGGCTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114635 CGGAAAAGGTGGCAATGCTGGATGGTTCTCGAAAGGACAAGGCTCTGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AACTCAGGTGATGAAACACTTATGCGAAGAACATCCACAATTGGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114685 AACTCAGGTGATGAAACACTTATGCGAAGAACATCCACAATTGGGAAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GTCAGTGCAGACCATTTCCAACGAACAGAGAGCCTCAAAGGTCCTAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114735 GTCAGTGCAGACCATTTCCAACGAACAGAGAGCCTCAAAGGTCCTAGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TTGTGTTTTTCCTCTTTTTGCTTATGTGGTGTCCCTTCTTTATTACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114785 TTGTGTTTTTCCTCTTTTTGCTTATGTGGTGTCCCTTCTTTATTACAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATAACTTTAGTTTTATGTGATTCCTGTAACCAAACTACTCTCCAAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114835 ATAACTTTAGTTTTATGTGATTCCTGTAACCAAACTACTCTCCAAATGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CCTGGAGATATTTGTGTGGATAGGCTATGTTTCCTCAGGAGTGAATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114885 CCTGGAGATATTTGTGTGGATAGGCTATGTTTCCTCAGGAGTGAATCCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TGGTCTACACCCTCTTCAATAAGACATTTCGGGATGCATTTGGCCGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114935 TGGTCTACACCCTCTTCAATAAGACATTTCGGGATGCATTTGGCCGATAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 ATCACCTGCAATTACCGGGCCACAAAGTCAGTAAAAACTCTCAGAAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114985 ATCACCTGCAATTACCGGGCCACAAAGTCAGTAAAAACTCTCAGAAAACG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CTCCAGTAAGATCTACTTCCGGAATCCAATGGCAGAGAACTCTAAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115035 CTCCAGTAAGATCTACTTCCGGAATCCAATGGCAGAGAACTCTAAGTTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TCAAGAAACATGGAATTCGAAATGGGATTAACCCTGCCATGTACCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115085 TCAAGAAACATGGAATTCGAAATGGGATTAACCCTGCCATGTACCAGAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 CCAATGAGGCTCCGAAGTTCAACCATTCAGTCTTCATCAATCATTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115135 CCAATGAGGCTCCGAAGTTCAACCATTCAGTCTTCATCAATCATTCTACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 AGATACGCTTCTCCTCACTGAAAATGAAGGTGACAAAACTGAAGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115185 AGATACGCTTCTCCTCACTGAAAATGAAGGTGACAAAACTGAAGAGCAAG

   1450     .    :
   1433 TTAGTTATGTA
        |||||||||||
 115235 TTAGTTATGTA