seq1 = pF1KB5833.tfa, 525 bp
seq2 = pF1KB5833/gi568815583f_43700493.tfa (gi568815583f:43700493_43901803), 201311 bp

>pF1KB5833 525
>gi568815583f:43700493_43901803 (Chr15)

1-34  (92558-92591)   100% ->
35-324  (100003-100292)   100% ->
325-380  (100640-100695)   100% ->
381-432  (101026-101077)   100% ->
433-525  (101219-101311)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGGCTTTCTGCTGCCGCCCGCAAGCAGAG         CTTCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  92558 ATGACGGGCTTTCTGCTGCCGCCCGCAAGCAGAGGTA...AAGCTTCTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AACTGGAGCAGAAAGAAGGTGTGGCCCAGGGCCAGCCCCGCCTCCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 AACTGGAGCAGAAAGAAGGTGTGGCCCAGGGCCAGCCCCGCCTCCTCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGCGGAAGCTGTGTCAGTTGCCGGAAGTCGGCGTGAGGTGGGGCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100060 GGGCGGAAGCTGTGTCAGTTGCCGGAAGTCGGCGTGAGGTGGGGCTTATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGCGGCGTGGTGAAATAGATATGGCGACCGAGGGGGATGTGGAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100110 CGGCGGCGTGGTGAAATAGATATGGCGACCGAGGGGGATGTGGAGCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTGGAGACTGAGACCAGTGGACCAGAGCGGCCTCCGGAGAAGCCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100160 GTTGGAGACTGAGACCAGTGGACCAGAGCGGCCTCCGGAGAAGCCACGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACATGACAGCGGTGCGGCGGACTTGGAGCGGGTCACCGACTATGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100210 AACATGACAGCGGTGCGGCGGACTTGGAGCGGGTCACCGACTATGCAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGAAGGAGATCCAGAGTTCCAATCTGGAGACG         GCCATGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100260 GAGAAGGAGATCCAGAGTTCCAATCTGGAGACGGTA...TAGGCCATGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGATTGGAGACAGAAGGTCCCGGGAGCAGAAAGCCAAACAGGAGCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100648 TGTGATTGGAGACAGAAGGTCCCGGGAGCAGAAAGCCAAACAGGAGCGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381        GGAGAAAGAACTGGCAAAAGTCACTATCAAGAAGGAAGATCTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100698 A...CAGGGAGAAAGAACTGGCAAAAGTCACTATCAAGAAGGAAGATCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGCTAATA         ATGACTGAGATGGAGATATCTCGAGCAGCAGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101069 GAGCTAATAGTG...CAGATGACTGAGATGGAGATATCTCGAGCAGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGAACGCAGTTTGCGGGAACACATGGGCAACGTGGTAGAGGCGCTTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGAACGCAGTTTGCGGGAACACATGGGCAACGTGGTAGAGGCGCTTATTG

    550     .    :
    515 CCCTAACCAAC
        |||||||||||
 101301 CCCTAACCAAC