seq1 = pF1KB5830.tfa, 1443 bp
seq2 = pF1KB5830/gi568815579r_40133875.tfa (gi568815579r:40133875_40365267), 231393 bp

>pF1KB5830 1443
>gi568815579r:40133875_40365267 (Chr19)

(complement)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-175  (108214-108342)   100% ->
176-287  (109999-110110)   100% ->
288-441  (122581-122734)   100% ->
442-573  (123199-123330)   100% ->
574-639  (125158-125223)   100% ->
640-708  (126295-126363)   100% ->
709-831  (127177-127299)   100% ->
832-960  (128883-129011)   100% ->
961-1175  (129164-129378)   100% ->
1176-1263  (129918-130005)   100% ->
1264-1366  (130121-130223)   100% ->
1367-1443  (131317-131393)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGAGGTGTCTGTCATCAAAGAAGGCTGGCTCCACAAGCGTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGAATGAGGTGTCTGTCATCAAAGAAGGCTGGCTCCACAAGCGTGGTA.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      GTGAATACATCAAGACCTGGAGGCCACGGTACTTCCTGCTGAAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGGTGAATACATCAAGACCTGGAGGCCACGGTACTTCCTGCTGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCGACGGCTCCTTCATTGGGTACAAGGAGAGGCCCGAGGCCCCTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108259 GCGACGGCTCCTTCATTGGGTACAAGGAGAGGCCCGAGGCCCCTGATCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTCTACCCCCCTTAAACAACTTCTCCGTAGCAG         AATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108309 ACTCTACCCCCCTTAAACAACTTCTCCGTAGCAGGTG...CAGAATGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGATGAAGACCGAGAGGCCGCGACCCAACACCTTTGTCATACGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110006 GCTGATGAAGACCGAGAGGCCGCGACCCAACACCTTTGTCATACGCTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCAGTGGACCACAGTCATCGAGAGGACCTTCCACGTGGATTCTCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110056 TGCAGTGGACCACAGTCATCGAGAGGACCTTCCACGTGGATTCTCCAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGAG         GGAGGAGTGGATGCGGGCCATCCAGATGGTCGCCAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110106 GAGAGGTC...CAGGGAGGAGTGGATGCGGGCCATCCAGATGGTCGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAGCCTCAAGCAGCGGGCCCCAGGCGAGGACCCCATGGACTACAAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122617 CAGCCTCAAGCAGCGGGCCCCAGGCGAGGACCCCATGGACTACAAGTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCTCCCCCAGTGACTCCTCCACGACTGAGGAGATGGAAGTGGCGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122667 GCTCCCCCAGTGACTCCTCCACGACTGAGGAGATGGAAGTGGCGGTCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGCACGGGCTAAAGTG         ACCATGAATGACTTCGACTATCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 122717 AAGGCACGGGCTAAAGTGGTA...CAGACCATGAATGACTTCGACTATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAAACTCCTTGGCAAGGGAACCTTTGGCAAAGTCATCCTGGTGCGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123222 CAAACTCCTTGGCAAGGGAACCTTTGGCAAAGTCATCCTGGTGCGGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGCCACTGGCCGCTACTACGCCATGAAGATCCTGCGGAAGGAAGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123272 AGGCCACTGGCCGCTACTACGCCATGAAGATCCTGCGGAAGGAAGTCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATTGCCAAG         GATGAAGTCGCTCACACAGTCACCGAGAGCCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 123322 ATTGCCAAGGTG...CAGGATGAAGTCGCTCACACAGTCACCGAGAGCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGTCCTCCAGAACACCAGGCACCCGTTCCTCACT         GCGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 125190 GGTCCTCCAGAACACCAGGCACCCGTTCCTCACTGTG...CAGGCGCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGTATGCCTTCCAGACCCACGACCGCCTGTGCTTTGTGATGGAGTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126302 AGTATGCCTTCCAGACCCACGACCGCCTGTGCTTTGTGATGGAGTATGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AACGGGGGTGAG         CTGTTCTTCCACCTGTCCCGGGAGCGTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 126352 AACGGGGGTGAGGTG...CAGCTGTTCTTCCACCTGTCCCGGGAGCGTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CTTCACAGAGGAGCGGGCCCGGTTTTATGGTGCAGAGATTGTCTCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127206 CTTCACAGAGGAGCGGGCCCGGTTTTATGGTGCAGAGATTGTCTCGGCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTGAGTACTTGCACTCGCGGGACGTGGTATACCGCGACATCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 127256 TTGAGTACTTGCACTCGCGGGACGTGGTATACCGCGACATCAAGGTT...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832    CTGGAAAACCTCATGCTGGACAAAGATGGCCACATCAAGATCACTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128880 CAGCTGGAAAACCTCATGCTGGACAAAGATGGCCACATCAAGATCACTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CTTTGGCCTCTGCAAAGAGGGCATCAGTGACGGGGCCACCATGAAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128930 CTTTGGCCTCTGCAAAGAGGGCATCAGTGACGGGGCCACCATGAAAACCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCTGTGGGACCCCGGAGTACCTGGCGCCTGAG         GTGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 128980 TCTGTGGGACCCCGGAGTACCTGGCGCCTGAGGTG...CAGGTGCTGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GACAATGACTATGGCCGGGCCGTGGACTGGTGGGGGCTGGGTGTGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129173 GACAATGACTATGGCCGGGCCGTGGACTGGTGGGGGCTGGGTGTGGTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GTACGAGATGATGTGCGGCCGCCTGCCCTTCTACAACCAGGACCACGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129223 GTACGAGATGATGTGCGGCCGCCTGCCCTTCTACAACCAGGACCACGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCCTCTTCGAGCTCATCCTCATGGAAGAGATCCGCTTCCCGCGCACGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129273 GCCTCTTCGAGCTCATCCTCATGGAAGAGATCCGCTTCCCGCGCACGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AGCCCCGAGGCCAAGTCCCTGCTTGCTGGGCTGCTTAAGAAGGACCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129323 AGCCCCGAGGCCAAGTCCCTGCTTGCTGGGCTGCTTAAGAAGGACCCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCAGAG         GCTTGGTGGGGGGCCCAGCGATGCCAAGGAGGTCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129373 GCAGAGGTG...CAGGCTTGGTGGGGGGCCCAGCGATGCCAAGGAGGTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TGGAGCACAGGTTCTTCCTCAGCATCAACTGGCAGGACGTGGTCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129953 TGGAGCACAGGTTCTTCCTCAGCATCAACTGGCAGGACGTGGTCCAGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAG         CTCCTGCCACCCTTCAAACCTCAGGTCACGTCCGAGGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130003 AAGGTG...TAGCTCCTGCCACCCTTCAAACCTCAGGTCACGTCCGAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CGACACAAGGTACTTCGATGATGAATTTACCGCCCAGTCCATCACAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130159 CGACACAAGGTACTTCGATGATGAATTTACCGCCCAGTCCATCACAATCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CACCCCCTGACCGCT         ATGACAGCCTGGGCTTACTGGAGCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 130209 CACCCCCTGACCGCTGTG...CAGATGACAGCCTGGGCTTACTGGAGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GACCAGCGGACCCACTTCCCCCAGTTCTCCTACTCGGCCAGCATCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131343 GACCAGCGGACCCACTTCCCCCAGTTCTCCTACTCGGCCAGCATCCGCGA

   1550 
   1443 G
        |
 131393 G