seq1 = pF1KB5829.tfa, 372 bp
seq2 = pF1KB5829/gi568815587r_128835594.tfa (gi568815587r:128835594_129037818), 202225 bp

>pF1KB5829 372
>gi568815587r:128835594_129037818 (Chr11)

(complement)

1-141  (100001-100141)   100% ->
142-253  (101170-101281)   100% ->
254-372  (102107-102225)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGATCTTCCTCTGAGGCGAGCTTCAGATCTGCTCAAGCTTCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGATCTTCCTCTGAGGCGAGCTTCAGATCTGCTCAAGCTTCCTGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGGCCAGGAGGCAGGGCCTGGGCAGGGGAGACCAGAACCTCTCGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGGCCAGGAGGCAGGGCCTGGGCAGGGGAGACCAGAACCTCTCGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCTCCGAATGGCAGGGCTCAGACACACACACCTGGCTGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100101 TGCCTCCGAATGGCAGGGCTCAGACACACACACCTGGCTGGGTA...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTTCAGATCCCTTAGTTTTGGGTGCCCAAGTTCACGGAGGGTGCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101170 GTTTCAGATCCCTTAGTTTTGGGTGCCCAAGTTCACGGAGGGTGCCGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATAGAAGCTCTGTCAGTCTCGTCTGGATCTTGGTCCTCAGCAACTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101220 AATAGAAGCTCTGTCAGTCTCGTCTGGATCTTGGTCCTCAGCAACTGTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGATCCTGACAG         GCCTTGGTCTAGGTCTCTCCAGGCCTTTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101270 GGATCCTGACAGGTG...GAGGCCTTGGTCTAGGTCTCTCCAGGCCTTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTCCTGGAGCCACAGTGCTTGGAGACAGGTCACTGGGGTCAGCATTTGA
        ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
 102136 CTTCCTGGAGCCACAGTGCTTAGAGACAGGCCACTGGGGTCAGCATTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTCAGCTATGATCAGAAAAAAGCACCGTTGAGGTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102186 GCTCAGCTATGATCAGAAAAAAGCACCGTTGAGGTTGCAG