seq1 = pF1KB5826.tfa, 1425 bp
seq2 = pF1KB5826/gi568815587r_4285288.tfa (gi568815587r:4285288_4490409), 205122 bp

>pF1KB5826 1425
>gi568815587r:4285288_4490409 (Chr11)

(complement)

1-408  (100001-100408)   100% ->
409-504  (100661-100756)   100% ->
505-735  (101880-102110)   100% ->
736-758  (103420-103442)   100% ->
759-859  (104153-104253)   100% ->
860-1425  (104557-105122)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCAGCAGCACGCTTGACAATGATGTGGGAGGAGGTCACATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCAGCAGCACGCTTGACAATGATGTGGGAGGAGGTCACATGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCTGCCTGGACCCCTTCGTGGAGCCTGTGAGCATCGAGTGTGGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATCTGCCTGGACCCCTTCGTGGAGCCTGTGAGCATCGAGTGTGGCCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCTGCCAGGAATGCATCTCTCAGGTTGGGAAAGGTGGGGGCAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCTGCCAGGAATGCATCTCTCAGGTTGGGAAAGGTGGGGGCAGCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTCCTGTGTGCCGGCAGCGCTTTCTGCTCAAGAATCTCCGGCCCAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTCCTGTGTGCCGGCAGCGCTTTCTGCTCAAGAATCTCCGGCCCAATCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAGCTAGCCAACATGGTGAACAACCTTAAAGAAATCAGCCAGGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACAGCTAGCCAACATGGTGAACAACCTTAAAGAAATCAGCCAGGAGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGAGGGCACACAGGGGGAACGGTGTGCAGTGCATGGAGAGAGACTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGAGGGCACACAGGGGGAACGGTGTGCAGTGCATGGAGAGAGACTTCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGTTCTGTGAGAAAGATGGGAAGGCCCTTTGCTGGGTATGTGCCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGTTCTGTGAGAAAGATGGGAAGGCCCTTTGCTGGGTATGTGCCCAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCGGAAACACCGTGACCACGCCATGGTCCCTCTTGAGGAGGCTGCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCGGAAACACCGTGACCACGCCATGGTCCCTCTTGAGGAGGCTGCACAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTACCAG         GAGAAGCTCCAGGTGGCATTAGGGGAACTGAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTACCAGGTG...CAGGAGAAGCTCCAGGTGGCATTAGGGGAACTGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGAAAGCAGGAGTTGGCTGAGAAGTTGGAAGTGGAAATTGCAATAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100694 AGAAAGCAGGAGTTGGCTGAGAAGTTGGAAGTGGAAATTGCAATAAAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGCAGACTGGAAG         AAAACAGTGGAAACACAGAAATCTAGGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100744 AGCAGACTGGAAGGTA...AAGAAAACAGTGGAAACACAGAAATCTAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTCACGCAGAGTTTGTGCAGCAAAAAAACTTCCTGGTTGAAGAAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101908 TTCACGCAGAGTTTGTGCAGCAAAAAAACTTCCTGGTTGAAGAAGAACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AGGCAGCTGCAGGAGCTGGAGAAGGATGAGAGGGAGCAGCTGAGAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101958 AGGCAGCTGCAGGAGCTGGAGAAGGATGAGAGGGAGCAGCTGAGAATCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGGGGAGAAAGAGGCCAAGCTGGCCCAGCAGAGCCAGGCCCTACAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102008 GGGGGAGAAAGAGGCCAAGCTGGCCCAGCAGAGCCAGGCCCTACAGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCATCTCAGAGCTAGATCGAAGGTGCCACAGCTCAGCACTGGAACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102058 TCATCTCAGAGCTAGATCGAAGGTGCCACAGCTCAGCACTGGAACTGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CAG         GAGGTGATAATTGTCCTGGAAAG         GAGTGA
        |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102108 CAGGTG...CAGGAGGTGATAATTGTCCTGGAAAGGTA...CAGGAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GTCCTGGAACCTGAAGGACCTGGATATTACCTCTCCAGAACTCAGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104159 GTCCTGGAACCTGAAGGACCTGGATATTACCTCTCCAGAACTCAGGAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGTGCCATGTGCCAGGGCTGAAGAAGATGCTGAGGACATGTGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104209 TGTGCCATGTGCCAGGGCTGAAGAAGATGCTGAGGACATGTGCAGGTG..

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    860     TCCACATCACTCTGGATCCAGACACAGCCAATCCGTGGCTGATACT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104259 .CAGTCCACATCACTCTGGATCCAGACACAGCCAATCCGTGGCTGATACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TTCAGAAGATCGGAGACAAGTGAGGCTTGGAGACACCCAGCAGAGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104603 TTCAGAAGATCGGAGACAAGTGAGGCTTGGAGACACCCAGCAGAGCATAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTGGAAATGAAGAGAGATTTGATAGTTATCCTATGGTCCTGGGTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104653 CTGGAAATGAAGAGAGATTTGATAGTTATCCTATGGTCCTGGGTGCCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CACTTTCACTCTGGAAAACATTACTGGGAGGTAGATGTGACAGGAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104703 CACTTTCACTCTGGAAAACATTACTGGGAGGTAGATGTGACAGGAAAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGCCTGGGACCTGGGTGTCTGCAGAGACTCTGTGCGCAGGAAGGGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104753 GGCCTGGGACCTGGGTGTCTGCAGAGACTCTGTGCGCAGGAAGGGGCACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TTTTGCTTAGTTCCAAGAGTGGCTTCTGGACAATTTGGTTGTGGAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104803 TTTTGCTTAGTTCCAAGAGTGGCTTCTGGACAATTTGGTTGTGGAACAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CAAAAATATGAGGCTGGCACCTACCCCCAGACTCCCCTCCACCTTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104853 CAAAAATATGAGGCTGGCACCTACCCCCAGACTCCCCTCCACCTTCAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GCCTCCATGCCAAGTTGGGATTTTCCTGGACTATGAGGCTGGCATGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104903 GCCTCCATGCCAAGTTGGGATTTTCCTGGACTATGAGGCTGGCATGGTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CCTTCTACAACATCACTGACCATGGCTCCCTCATCTACTCCTTCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104953 CCTTCTACAACATCACTGACCATGGCTCCCTCATCTACTCCTTCTCTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TGTGCCTTTACAGGACCTCTGCGGCCCTTCTTCAGTCCTGGTTTCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105003 TGTGCCTTTACAGGACCTCTGCGGCCCTTCTTCAGTCCTGGTTTCAATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TGGAGGAAAAAACACAGCCCCTCTAACCCTCTGTCCACTGAATATTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105053 TGGAGGAAAAAACACAGCCCCTCTAACCCTCTGTCCACTGAATATTGGAT

   1450     .    :    .    :
   1406 CACAAGGATCCACTGACTAT
        ||||||||||||||||||||
 105103 CACAAGGATCCACTGACTAT