seq1 = pF1KB5819.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KB5819/gi568815582r_71760021.tfa (gi568815582r:71760021_71979946), 219926 bp

>pF1KB5819 1236
>gi568815582r:71760021_71979946 (Chr16)

(complement)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-166  (111910-112035)   100% ->
167-312  (114899-115044)   100% ->
313-417  (115705-115809)   100% ->
418-584  (118005-118171)   100% ->
585-1236  (119275-119926)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCGTCGGAAACAGACAAATCCAAATAAAGTTCACT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGTCCCGTCGGAAACAGACAAATCCAAATAAAGTTCACTGTG...CAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGATCAAGTATTTGCTGGGCTAGAAGAGCAAGCCCGCCAGGCGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111911 GGATCAAGTATTTGCTGGGCTAGAAGAGCAAGCCCGCCAGGCGATGATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAACTGATTTTCCTGGAGACCTTGGCAGTCAGCGACAAGCTATCCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111961 AAACTGATTTTCCTGGAGACCTTGGCAGTCAGCGACAAGCTATCCAACAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTAAGAGATCAGGACTCCAGTAGCA         GTGACAGTGAGGGTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 112011 CTAAGAGATCAGGACTCCAGTAGCAGTG...CAGGTGACAGTGAGGGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAAGAGGAGACGACACAAGATGAAGTCTCTTCCCACACATCAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114915 TGAAGAGGAGACGACACAAGATGAAGTCTCTTCCCACACATCAGAGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGGAGGGGTGGTCAAAGTGGAGAAAGAGTTAGAAAATACAGAACAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114965 ATGGAGGGGTGGTCAAAGTGGAGAAAGAGTTAGAAAATACAGAACAGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTGGTGGGAACGAAGTGGTAGAGCACGAG         GTCACAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 115015 GTTGGTGGGAACGAAGTGGTAGAGCACGAGGCA...CAGGTCACAGGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTGAATTCTGACCCCTTGCTTGAACTCTGCCAGTGTCCCCTCTGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115716 TTTGAATTCTGACCCCTTGCTTGAACTCTGCCAGTGTCCCCTCTGCCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TAGACTGCGGGAGCCGGGAGCAGTTGATTGCTCACGTGTACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 115766 TAGACTGCGGGAGCCGGGAGCAGTTGATTGCTCACGTGTACCAGGTA...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    418    CACACTGCAGCAGTGGTGAGCGCCAAGAGCTACATGTGTCCTGTCTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118002 CAGCACACTGCAGCAGTGGTGAGCGCCAAGAGCTACATGTGTCCTGTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGCCGGGCCCTTAGCTCCCCGGGGTCATTGGGTCGCCACCTCTTAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118052 TGGCCGGGCCCTTAGCTCCCCGGGGTCATTGGGTCGCCACCTCTTAATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACTCGGAGGACCAGCGATCTAACTGTGCTGTGTGTGGAGCCCGGTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118102 ACTCGGAGGACCAGCGATCTAACTGTGCTGTGTGTGGAGCCCGGTTCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCCATGCCACTTTTAACAG         TGAGAAACTTCCTGAAGTACT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118152 AGCCATGCCACTTTTAACAGGTC...CAGTGAGAAACTTCCTGAAGTACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AAATATGGAATCCCTACCCACAGTCCACAATGAGGGTCCCTCCAGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119296 AAATATGGAATCCCTACCCACAGTCCACAATGAGGGTCCCTCCAGTGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGGGAAGGATATTGCCTTTAGTCCTCCAGTGTACCCTGCTGGAATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119346 AGGGGAAGGATATTGCCTTTAGTCCTCCAGTGTACCCTGCTGGAATTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTTGTGTGCAACAACTGTGCTGCCTACCGTAAACTGCTGGAAGCCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119396 CTTGTGTGCAACAACTGTGCTGCCTACCGTAAACTGCTGGAAGCCCAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCCCAGTGTACGCAAGTGGGCTCTACGTCGACAGAATGAGCCTTTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119446 TCCCAGTGTACGCAAGTGGGCTCTACGTCGACAGAATGAGCCTTTGGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TACGGCTGCAGCGGCTGGAACGAGAGCGCACGGCCAAGAAGAGCCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119496 TACGGCTGCAGCGGCTGGAACGAGAGCGCACGGCCAAGAAGAGCCGGCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACAATGAGACCCCCGAGGAGCGGGAGGTGAGGCGCATGAGGGACCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119546 GACAATGAGACCCCCGAGGAGCGGGAGGTGAGGCGCATGAGGGACCGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGCCAAGCGCTTGCAGCGCATGCAGGAGACAGACGAGCAGCGGGCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119596 AGCCAAGCGCTTGCAGCGCATGCAGGAGACAGACGAGCAGCGGGCACGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GGCTGCAGCGGGATCGGGAGGCCATGAGGCTGAAGCGGGCCAATGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119646 GGCTGCAGCGGGATCGGGAGGCCATGAGGCTGAAGCGGGCCAATGAAACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCGGAAAAGCGGCAGGCCCGGCTCATCCGAGAGCGAGAGGCCAAGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119696 CCGGAAAAGCGGCAGGCCCGGCTCATCCGAGAGCGAGAGGCCAAGCGGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAAGAGGAGGCTGGAGAAAATGGACATGATGTTGCGAGCTCAGTTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119746 CAAGAGGAGGCTGGAGAAAATGGACATGATGTTGCGAGCTCAGTTTGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGGACCCTTCTGCCATGGCAGCCTTAGCAGCTGAAATGAACTTCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119796 AGGACCCTTCTGCCATGGCAGCCTTAGCAGCTGAAATGAACTTCTTCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CTGCCTGTAAGTGGGGTGGAGTTGGACAGCCAGCTTCTGGGCAAGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119846 CTGCCTGTAAGTGGGGTGGAGTTGGACAGCCAGCTTCTGGGCAAGATGGC

   1250     .    :    .    :    .    :
   1206 CTTTGAAGAGCAGAACAGCAGCTCTCTGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 119896 CTTTGAAGAGCAGAACAGCAGCTCTCTGCAC