seq1 = pF1KB5811.tfa, 1422 bp
seq2 = pF1KB5811/gi568815582f_19073428.tfa (gi568815582f:19073428_19367073), 293646 bp

>pF1KB5811 1422
>gi568815582f:19073428_19367073 (Chr16)

13-33  (99330-99350)   100% ->
34-182  (100003-100151)   100% ->
183-331  (106964-107112)   100% ->
332-951  (110101-110720)   100% ->
952-1072  (149618-149738)   100% ->
1073-1228  (151256-151411)   100% ->
1229-1422  (193453-193646)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     13 CAGTTGGAACCATTAAACGAG         GGTTTTCTTTCTAGAATCTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  99330 CAGTTGGAACCATTAAACGAGGTG...CAGGGTTTTCTTTCTAGAATCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     54 TGGTCTGCTGCTGTGCAGATGGACCTGCCGGCACTGCTGTCAGAAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100023 TGGTCTGCTGCTGTGCAGATGGACCTGCCGGCACTGCTGTCAGAAGTGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    104 ACGAGTCCAGCTGTTGCCAGTCAAGTGAGGATGAAGTTGAAATTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100073 ACGAGTCCAGCTGTTGCCAGTCAAGTGAGGATGAAGTTGAAATTCTGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    154 CCTTTCCCTGCTCAGACCCCTCCCTGGCT         GATGGCCAGCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100123 CCTTTCCCTGCTCAGACCCCTCCCTGGCTGTA...TAGGATGGCCAGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195 GAGCAGTGACAAGGATGGTGACTCTGTCCACACGGCCAGCGAAGTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106976 GAGCAGTGACAAGGATGGTGACTCTGTCCACACGGCCAGCGAAGTCCCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 TGACCCCACGGACCAATTCCCCGGATGGAAGACGCTCGTCCTCAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107026 TGACCCCACGGACCAATTCCCCGGATGGAAGACGCTCGTCCTCAGACACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 TCCAAGTCTACATACAGCCTGACGCGGAGGATTTCGA         GTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 107076 TCCAAGTCTACATACAGCCTGACGCGGAGGATTTCGAGTA...CAGGTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    336 TGAGTCAAGACGTCCCAGCTCTCCACTCATCGATATTAAACCCATCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110105 TGAGTCAAGACGTCCCAGCTCTCCACTCATCGATATTAAACCCATCGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386 TTGGCGTTCTCAGCGCCAAGAAGGAGCCCATCCAACCTTCGGTGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110155 TTGGCGTTCTCAGCGCCAAGAAGGAGCCCATCCAACCTTCGGTGCTCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    436 CGGACCTATAACCCCGACGACTATTTCAGGAAGTTCGAACCCCACCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110205 CGGACCTATAACCCCGACGACTATTTCAGGAAGTTCGAACCCCACCTGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    486 CTCCCTCGACTCCAACAGCGACGATGTGGACTCTCTGACAGACGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110255 CTCCCTCGACTCCAACAGCGACGATGTGGACTCTCTGACAGACGAGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    536 TCCTGTCCAAGTACCAGCTGGGCATGCTGCACTTCAGCACTCAGTACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110305 TCCTGTCCAAGTACCAGCTGGGCATGCTGCACTTCAGCACTCAGTACGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    586 CTGCTGCACAACCACCTCACCGTGCGCGTGATCGAGGCCAGGGACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110355 CTGCTGCACAACCACCTCACCGTGCGCGTGATCGAGGCCAGGGACCTGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    636 ACCTCCCATCTCCCACGATGGCTCGCGCCAGGACATGGCGCACTCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110405 ACCTCCCATCTCCCACGATGGCTCGCGCCAGGACATGGCGCACTCCAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    686 CCTACGTCAAGATCTGTCTCCTGCCAGACCAGAAGAACTCAAAGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110455 CCTACGTCAAGATCTGTCTCCTGCCAGACCAGAAGAACTCAAAGCAGACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    736 GGGGTCAAACGCAAGACCCAGAAGCCCGTGTTTGAGGAGCGCTACACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110505 GGGGTCAAACGCAAGACCCAGAAGCCCGTGTTTGAGGAGCGCTACACCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    786 CGAGATCCCCTTCCTGGAGGCCCAGAGGAGGACCCTGCTCCTGACCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110555 CGAGATCCCCTTCCTGGAGGCCCAGAGGAGGACCCTGCTCCTGACCGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    836 TGGATTTTGATAAGTTCTCCCGCCACTGTGTCATTGGGAAAGTTTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110605 TGGATTTTGATAAGTTCTCCCGCCACTGTGTCATTGGGAAAGTTTCTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    886 CCTTTGTGTGAAGTTGACCTGGTCAAGGGCGGGCACTGGTGGAAGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110655 CCTTTGTGTGAAGTTGACCTGGTCAAGGGCGGGCACTGGTGGAAGGCGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    936 GATTCCCAGTTCTCAG         AATGAAGTGGAGCTGGGGGAGCTGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 110705 GATTCCCAGTTCTCAGGTA...CAGAATGAAGTGGAGCTGGGGGAGCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    977 TTCTGTCACTGAATTATCTCCCAAGTGCTGGCAGACTGAATGTTGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149643 TTCTGTCACTGAATTATCTCCCAAGTGCTGGCAGACTGAATGTTGATGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1027 ATTCGAGCCAAGCAACTTCTTCAGACAGATGTGAGCCAAGGTTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 149693 ATTCGAGCCAAGCAACTTCTTCAGACAGATGTGAGCCAAGGTTCAGGTA.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1073      ACCCCTTTGTGAAAATCCAGCTGGTGCATGGACTCAAACTTGTGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149743 ..CAGACCCCTTTGTGAAAATCCAGCTGGTGCATGGACTCAAACTTGTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1118 AAACCAAGAAGACGTCCTTCTTAAGGGGCACAATTGATCCTTTCTACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151301 AAACCAAGAAGACGTCCTTCTTAAGGGGCACAATTGATCCTTTCTACAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1168 GAATCCTTCAGCTTCAAAGTTCCCCAAGAAGAACTGGAAAATGCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151351 GAATCCTTCAGCTTCAAAGTTCCCCAAGAAGAACTGGAAAATGCCAGCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1218 AGTGTTTACAG         TTTTCGGCCACAACATGAAGAGCAGCAATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 151401 AGTGTTTACAGGTA...TAGTTTTCGGCCACAACATGAAGAGCAGCAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1259 ACTTCATCGGGAGGATCGTCATTGGCCAGTACTCTTCAGGCCCCTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193483 ACTTCATCGGGAGGATCGTCATTGGCCAGTACTCTTCAGGCCCCTCTGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1309 ACCAACCACTGGAGGCGCATGCTCAACACGCACCGCACAGCCGTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193533 ACCAACCACTGGAGGCGCATGCTCAACACGCACCGCACAGCCGTGGAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1359 GTGGCATAGCCTGAGGTCCCGAGCTGAGTGTGACCGCGTGTCTCCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193583 GTGGCATAGCCTGAGGTCCCGAGCTGAGTGTGACCGCGTGTCTCCTGCCT

   1450     .    :
   1409 CCCTGGAGGTGACC
        ||||||||||||||
 193633 CCCTGGAGGTGACC