seq1 = pF1KB5808.tfa, 1362 bp
seq2 = pF1KB5808/gi568815586r_53111679.tfa (gi568815586r:53111679_53327545), 215867 bp

>pF1KB5808 1362
>gi568815586r:53111679_53327545 (Chr12)

(complement)

1-184  (100001-100184)   100% ->
185-333  (111752-111900)   100% ->
334-475  (112112-112253)   100% ->
476-636  (112940-113100)   100% ->
637-813  (113311-113487)   100% ->
814-1018  (113846-114050)   100% ->
1019-1177  (114303-114461)   100% ->
1178-1362  (115683-115867)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCAATAAGGAGCGACTCTTTGCGGCTGGTGCCCTGGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACCAATAAGGAGCGACTCTTTGCGGCTGGTGCCCTGGGGCCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTGGCTACCCAGGGGCAGGTTTCCCCTTCGCCTTCCCAGGGGCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCTGGCTACCCAGGGGCAGGTTTCCCCTTCGCCTTCCCAGGGGCACTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGGTCTCCGCCTTTCGAGATGCTGAGCCCTAGCTTCCGGGGCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGGTCTCCGCCTTTCGAGATGCTGAGCCCTAGCTTCCGGGGCCTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCCTGACCTCCCCAAGGAGATGGCCTCTCTGT         CGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100151 CAGCCTGACCTCCCCAAGGAGATGGCCTCTCTGTGTG...CAGCGGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACACAGAGCACCAGCTCAGAGGAGATGGTGCCCAGCTCGCCCTCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111759 GACACAGAGCACCAGCTCAGAGGAGATGGTGCCCAGCTCGCCCTCGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCCGCCTCCTCGGGTCTACAAGCCATGCTTCGTGTGCAATGACAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111809 CTCCGCCTCCTCGGGTCTACAAGCCATGCTTCGTGTGCAATGACAAGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTGGCTACCACTATGGGGTCAGCTCTTGTGAAGGCTGCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 111859 TCTGGCTACCACTATGGGGTCAGCTCTTGTGAAGGCTGCAAGGTG...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    334  GGCTTCTTTCGCCGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112111 GGGCTTCTTTCGCCGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCGACAAAAACTGTATCATCAACAAGGTGACCAGGAATCGCTGCCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112161 GCGACAAAAACTGTATCATCAACAAGGTGACCAGGAATCGCTGCCAGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGCCGGCTACAGAAGTGCTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 112211 TGCCGGCTACAGAAGTGCTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGGTA...A

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    476   CTGTGCGAAATGACCGGAACAAGAAGAAGAAAGAGGTGAAGGAAGAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112938 AGCTGTGCGAAATGACCGGAACAAGAAGAAGAAAGAGGTGAAGGAAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGTCACCTGACAGCTATGAGCTGAGCCCTCAGTTAGAAGAGCTCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112988 GGTCACCTGACAGCTATGAGCTGAGCCCTCAGTTAGAAGAGCTCATCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGGTCAGCAAAGCCCATCAGGAGACTTTCCCCTCGCTCTGCCAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113038 AAGGTCAGCAAAGCCCATCAGGAGACTTTCCCCTCGCTCTGCCAGCTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAAGTATACCACG         AACTCCAGTGCAGACCACCGCGTGCAGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 113088 CAAGTATACCACGGTG...CAGAACTCCAGTGCAGACCACCGCGTGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGATCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGTGAGCTGGCTACCAAGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113339 TGGATCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGTGAGCTGGCTACCAAGTGCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATCAAGATCGTGGAGTTTGCCAAGCGGTTGCCTGGCTTTACAGGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113389 ATCAAGATCGTGGAGTTTGCCAAGCGGTTGCCTGGCTTTACAGGGCTCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CATTGCTGACCAGATCACTCTGCTCAAAGCTGCCTGCCTAGATATCCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 113439 CATTGCTGACCAGATCACTCTGCTCAAAGCTGCCTGCCTAGATATCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    814         ATGCTGCGTATCTGCACAAGGTACACCCCAGAGCAGGACACC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113489 TA...CAGATGCTGCGTATCTGCACAAGGTACACCCCAGAGCAGGACACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATGACCTTCTCCGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113888 ATGACCTTCTCCGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CGGCTTCGGGCCCCTCACAGACCTTGTCTTTGCCTTTGCTGGGCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113938 CGGCTTCGGGCCCCTCACAGACCTTGTCTTTGCCTTTGCTGGGCAGCTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGCCCCTGGAGATGGATGACACCGAGACAGGGCTGCTCAGCGCCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113988 TGCCCCTGGAGATGGATGACACCGAGACAGGGCTGCTCAGCGCCATCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTCATCTGCGGAG         ACCGCATGGACCTGGAGGAGCCCGAAAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 114038 CTCATCTGCGGAGGTG...TAGACCGCATGGACCTGGAGGAGCCCGAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGTGGACAAGCTGCAGGAGCCACTGCTGGAAGCCCTGAGGCTGTACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114331 AGTGGACAAGCTGCAGGAGCCACTGCTGGAAGCCCTGAGGCTGTACGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GGCGCCGGCGGCCCAGCCAGCCCTACATGTTCCCAAGGATGCTAATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114381 GGCGCCGGCGGCCCAGCCAGCCCTACATGTTCCCAAGGATGCTAATGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATCACCGACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGG         GAGCTGAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 114431 ATCACCGACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGTG...TAGGAGCTGAAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGCCATTACTCTGAAGATGGAGATTCCAGGCCCGATGCCTCCCTTAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115693 GGCCATTACTCTGAAGATGGAGATTCCAGGCCCGATGCCTCCCTTAATCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GAGAGATGCTGGAGAACCCTGAAATGTTTGAGGATGACTCCTCGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115743 GAGAGATGCTGGAGAACCCTGAAATGTTTGAGGATGACTCCTCGCAGCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GGTCCCCACCCCAATGCCTCTAGCGAGGATGAGGTTCCTGGGGGCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115793 GGTCCCCACCCCAATGCCTCTAGCGAGGATGAGGTTCCTGGGGGCCAGGG

   1400     .    :    .    :    .
   1338 CAAAGGGGGCCTGAAGTCCCCAGCC
        |||||||||||||||||||||||||
 115843 CAAAGGGGGCCTGAAGTCCCCAGCC