seq1 = pF1KB5798.tfa, 2343 bp
seq2 = pF1KB5798/gi568815582r_3143144.tfa (gi568815582r:3143144_3356587), 213444 bp

>pF1KB5798 2343
>gi568815582r:3143144_3356587 (Chr16)

(complement)

1-277  (100001-100277)   100% ->
278-910  (101798-102430)   100% ->
911-1260  (106808-107157)   100% ->
1261-1356  (107584-107679)   100% ->
1357-1587  (109342-109572)   100% ->
1588-1610  (110041-110063)   100% ->
1611-1726  (112000-112115)   100% ->
1727-1759  (112302-112334)   100% ->
1760-1792  (112696-112728)   96% ->
1793-2343  (112894-113444)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAAGACCCCTAGTGACCATCTGCTGTCCACCCTGGAGGAGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAAGACCCCTAGTGACCATCTGCTGTCCACCCTGGAGGAGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCTATGACTTCGAGAAGTTCAAGTTCAAGCTGCAGAACACCAGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCTATGACTTCGAGAAGTTCAAGTTCAAGCTGCAGAACACCAGTGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAGGAGCACTCCAGGATCCCCCGGAGCCAGATCCAGAGAGCCAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAGGAGCACTCCAGGATCCCCCGGAGCCAGATCCAGAGAGCCAGGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGAAGATGGCCACTCTGCTGGTCACCTACTATGGGGAAGAGTACGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGAAGATGGCCACTCTGCTGGTCACCTACTATGGGGAAGAGTACGCCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGCTCACCCTGCAGGTCCTGCGGGCCATCAACCAGCGCCTGCTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGCTCACCCTGCAGGTCCTGCGGGCCATCAACCAGCGCCTGCTGGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGCTCCACAGGGCAGCCATTCAGG         AATATTCCACACAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100251 AGGAGCTCCACAGGGCAGCCATTCAGGGTA...CAGAATATTCCACACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAAAACGGCACAGATGATTCCGCAGCGTCCAGCTCCCTGGGGGAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101812 GAAAACGGCACAGATGATTCCGCAGCGTCCAGCTCCCTGGGGGAGAACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCCAGGAGCCTGAAGACTCCAGACCACCCCGAGGGGAACGAGGGGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101862 GCCCAGGAGCCTGAAGACTCCAGACCACCCCGAGGGGAACGAGGGGAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCCCTCGGCCGTACGGGGGCGGAGCTGCCAGCCTGCGGTGCAGCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101912 GCCCTCGGCCGTACGGGGGCGGAGCTGCCAGCCTGCGGTGCAGCCAGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGGCCGGGAGGGGGCTGTCGAGGAAGCCCCTGAGCAAACGCAGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101962 GAGGCCGGGAGGGGGCTGTCGAGGAAGCCCCTGAGCAAACGCAGAGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGCCTCGGAGGGCCTGGACGCGCAGGGCAAGCCTCGGACCCGGAGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102012 GGCCTCGGAGGGCCTGGACGCGCAGGGCAAGCCTCGGACCCGGAGCCCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCCTGCCGGGCGGGAGAAGCCCCGGCCCCTGCAGGGCGCTAGAGGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102062 CCCTGCCGGGCGGGAGAAGCCCCGGCCCCTGCAGGGCGCTAGAGGGGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGGCCGAGGTCCGGCTGCGCAGAAACGCCAGCTCCGCGGGGAGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102112 CAGGCCGAGGTCCGGCTGCGCAGAAACGCCAGCTCCGCGGGGAGGCTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGGGCTGGCGGGGGGCGCCCCGGGGCAGAAGGAGTGCAGGCCCTTCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102162 GGGGCTGGCGGGGGGCGCCCCGGGGCAGAAGGAGTGCAGGCCCTTCGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGTACCTGCCCTCGGGAAAGATGCGACCTAGAAGCCTTGAGGTCACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102212 TGTACCTGCCCTCGGGAAAGATGCGACCTAGAAGCCTTGAGGTCACCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TCTACAGGGGAGAAGGCGCCCGCAAATCCAGAAATTCTCCTGACTCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102262 TCTACAGGGGAGAAGGCGCCCGCAAATCCAGAAATTCTCCTGACTCTAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGAAAAGACAGCTGCGAATCTGGACTCGGCAACAGAACCCCGGGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102312 GGAAAAGACAGCTGCGAATCTGGACTCGGCAACAGAACCCCGGGCAAGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCACTCCGGATGGAGGGGCATCTGCGGACCTGAAGGAAGGCCCTGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102362 CCACTCCGGATGGAGGGGCATCTGCGGACCTGAAGGAAGGCCCTGGAAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CCAGAACATTCGGTCACCG         GAAGGCCACCAGACACGGCTGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102412 CCAGAACATTCGGTCACCGGTA...CAGGAAGGCCACCAGACACGGCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GAGTCCCCGCTGCCACGCCCAGGAAGGAGACCCAGTTGACGGTACCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106830 GAGTCCCCGCTGCCACGCCCAGGAAGGAGACCCAGTTGACGGTACCTGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGCGTGATTCCTGCAGCTTCCCCGAGGCAGTTTCTGGGCACCCCCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106880 TGCGTGATTCCTGCAGCTTCCCCGAGGCAGTTTCTGGGCACCCCCAGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCAGGCAGCCGCTCACCTGGCTGCCCCCGGTGCCAGGACTCCCATGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106930 TCAGGCAGCCGCTCACCTGGCTGCCCCCGGTGCCAGGACTCCCATGAAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GAAGAGCCCGGGAAGCCTAAGCCCCCAGCCCCTGCCACAGTGTAAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106980 GAAGAGCCCGGGAAGCCTAAGCCCCCAGCCCCTGCCACAGTGTAAGCGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ACCTGAAGCAGGTCCAGCTGCTCTTCTGTGAGGATCACGATGAGCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107030 ACCTGAAGCAGGTCCAGCTGCTCTTCTGTGAGGATCACGATGAGCCCATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TGCCTCATCTGCAGTCTGAGTCAGGAGCACCAAGGCCACCGGGTGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107080 TGCCTCATCTGCAGTCTGAGTCAGGAGCACCAAGGCCACCGGGTGCGCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CATTGAGGAGGTCGCCCTGGAACACAAG         AAGAAAATTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 107130 CATTGAGGAGGTCGCCCTGGAACACAAGGTA...CAGAAGAAAATTCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 AGCAGCTGGAGCATCTGAAGAAGCTGAGAAAATCAGGGGAGGAGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107597 AGCAGCTGGAGCATCTGAAGAAGCTGAGAAAATCAGGGGAGGAGCAGCGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TCCTATGGGGAGGAGAAGGCAGTGAGCTTTCTG         AAACAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107647 TCCTATGGGGAGGAGAAGGCAGTGAGCTTTCTGGTA...CAGAAACAAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TGAAGCGCTGAAGCAGCGGGTGCAGAGGAAGCTGGAGCAGGTGTACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109350 TGAAGCGCTGAAGCAGCGGGTGCAGAGGAAGCTGGAGCAGGTGTACTACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 TCCTGGAGCAGCAAGAGCATTTCTTTGTGGCCTCACTGGAGGACGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109400 TCCTGGAGCAGCAAGAGCATTTCTTTGTGGCCTCACTGGAGGACGTGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 CAGATGGTTGGGCAGATCAGGAAGGCATATGACACCCGCGTATCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109450 CAGATGGTTGGGCAGATCAGGAAGGCATATGACACCCGCGTATCCCAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CATCGCCCTGCTCGATGCGCTGATTGGGGAACTGGAGGCCAAGGAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109500 CATCGCCCTGCTCGATGCGCTGATTGGGGAACTGGAGGCCAAGGAGTGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 AGTCAGAATGGGAACTTCTGCAG         GACATTGGAGACATCTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109550 AGTCAGAATGGGAACTTCTGCAGGTG...TAGGACATTGGAGACATCTTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 CACAG         GGCTAAGACAGTGCCTGTCCCTGAAAAGTGGACCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110059 CACAGGTA...TAGGGCTAAGACAGTGCCTGTCCCTGAAAAGTGGACCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 TCCTCAAGAGATAAAACAAAAGATCCAACTCCTCCACCAGAAGTCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112036 TCCTCAAGAGATAAAACAAAAGATCCAACTCCTCCACCAGAAGTCAGAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 TTGTGGAGAAGAGCACAAAGTACTTCTCAG         AAACCCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112086 TTGTGGAGAAGAGCACAAAGTACTTCTCAGGTA...TAGAAACCCTGCGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TCAGAAATGGAAATGTTCAATG         TTCCAGAGCTGATTGGCGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| ||||||||||||||
 112313 TCAGAAATGGAAATGTTCAATGGTG...TAGTTCCGGAGCTGATTGGCGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 TCAGGCACATGCTG         TTAATGTGATTCTGGATGCAGAAACCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 112715 TCAGGCACATGCTGGTA...CAGTTAATGTGATTCTGGATGCAGAAACCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 CTTACCCCAACCTCATCTTCTCTGATGATCTGAAGAGTGTTAGACTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112921 CTTACCCCAACCTCATCTTCTCTGATGATCTGAAGAGTGTTAGACTTGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 AACAAGTGGGAGAGGCTGCCTGATGGCCCGCAAAGATTTGACAGCTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112971 AACAAGTGGGAGAGGCTGCCTGATGGCCCGCAAAGATTTGACAGCTGTAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 CATTGTTCTGGGCTCTCCGAGTTTCCTCTCTGGCCGCCGTTACTGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113021 CATTGTTCTGGGCTCTCCGAGTTTCCTCTCTGGCCGCCGTTACTGGGAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 TGGAGGTTGGAGACAAGACAGCATGGATCCTGGGAGCCTGCAAGACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113071 TGGAGGTTGGAGACAAGACAGCATGGATCCTGGGAGCCTGCAAGACATCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 ATAAGCAGGAAAGGGAACATGACTCTGTCGCCAGAGAATGGCTACTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113121 ATAAGCAGGAAAGGGAACATGACTCTGTCGCCAGAGAATGGCTACTGGGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 GGTGATAATGATGAAGGAAAATGAGTACCAGGCGTCCAGCGTTCCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113171 GGTGATAATGATGAAGGAAAATGAGTACCAGGCGTCCAGCGTTCCCCCGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 CCCGCCTGCTAATAAAGGAGCCTCCCAAGCGTGTGGGCATCTTCGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113221 CCCGCCTGCTAATAAAGGAGCCTCCCAAGCGTGTGGGCATCTTCGTGGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 TACAGAGTTGGAAGCATCTCCTTTTACAATGTGACAGCCAGATCCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113271 TACAGAGTTGGAAGCATCTCCTTTTACAATGTGACAGCCAGATCCCACAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 CTATACATTCGCCAGCTGCTCTTTCTCTGGGCCCCTTCAACCTATCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113321 CTATACATTCGCCAGCTGCTCTTTCTCTGGGCCCCTTCAACCTATCTTCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 GCCCTGGGACACGTGATGGAGGGAAGAACACAGCTCCTCTGACTATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113371 GCCCTGGGACACGTGATGGAGGGAAGAACACAGCTCCTCTGACTATCTGT

   2400     .    :    .    :
   2320 CCAGTGGGTGGTCAGGGGCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||
 113421 CCAGTGGGTGGTCAGGGGCCTGAC