seq1 = pF1KB5793.tfa, 2493 bp
seq2 = pF1KB5793/gi568815597r_109214260.tfa (gi568815597r:109214260_109497892), 283633 bp

>pF1KB5793 2493
>gi568815597r:109214260_109497892 (Chr1)

(complement)

1-306  (100001-100306)   100% ->
307-366  (128304-128363)   100% ->
367-440  (130412-130485)   100% ->
441-543  (142424-142526)   100% ->
544-708  (143362-143526)   99% ->
709-782  (146891-146964)   100% ->
783-832  (150361-150410)   100% ->
833-963  (152012-152142)   100% ->
964-1108  (155735-155879)   99% ->
1109-1264  (157014-157169)   100% ->
1265-1371  (161547-161653)   100% ->
1372-1474  (170292-170394)   100% ->
1475-1643  (170733-170901)   100% ->
1644-1834  (172804-172994)   100% ->
1835-2024  (174772-174961)   100% ->
2025-2141  (179924-180040)   100% ->
2142-2250  (180935-181043)   100% ->
2251-2357  (183115-183221)   100% ->
2358-2482  (183509-183633)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGGCCCTGGGGAGCTGCGGACGGCCTCTCGCGCTGGCCCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGGCCCTGGGGAGCTGCGGACGGCCTCTCGCGCTGGCCCCATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCGGCCTCCTCCTCCTCCTGCAGCTGCTGCCGCCGTCGACCCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCGGCCTCCTCCTCCTCCTGCAGCTGCTGCCGCCGTCGACCCTCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGACCGGCTGGACGCGCCGCCGCCGCCCGCTGCGCCGCTGCCGCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGACCGGCTGGACGCGCCGCCGCCGCCCGCTGCGCCGCTGCCGCGCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGGCCCCATCGGGGTGAGCTGGGGGCTGCGGGCGGCCGCAGCCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGGCCCCATCGGGGTGAGCTGGGGGCTGCGGGCGGCCGCAGCCGGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCGTTTCCCCGCGGCGGCCGTTGGCGTCGCAGCGCGCCGGGCGAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCGTTTCCCCGCGGCGGCCGTTGGCGTCGCAGCGCGCCGGGCGAGGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGTGCGGCCGGGTCCGGGACTTCGTCGCCAAGCTGGCCAACAACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGTGCGGCCGGGTCCGGGACTTCGTCGCCAAGCTGGCCAACAACACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACCAG         CATGTGTTTGATGATCTCAGAGGCTCAGTATCCTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CACCAGGTG...TAGCATGTGTTTGATGATCTCAGAGGCTCAGTATCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTCCTGGGTTGGAGATAGCACTGGG         GTCATTCTAGTCTTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 128339 GTCCTGGGTTGGAGATAGCACTGGGGTA...CAGGTCATTCTAGTCTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTACCTTCCATGTACCACTGGTAATTATGACTTTTGGACAGTCCAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130428 CTACCTTCCATGTACCACTGGTAATTATGACTTTTGGACAGTCCAAGCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TATCGAAG         TGAGGATTATGGGAAGAACTTTAAGGATATTAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 130478 TATCGAAGGTG...CAGTGAGGATTATGGGAAGAACTTTAAGGATATTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGATCTCATCAATAACACCTTTATTCGGACTGAATTTGGCATGGCTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142457 AGATCTCATCAATAACACCTTTATTCGGACTGAATTTGGCATGGCTATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTCCTGAGAACTCTGGAAAG         GTGGTGTTAACAGCAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 142507 GTCCTGAGAACTCTGGAAAGGTG...CAGGTGGTGTTAACAGCAGAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTGGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCTTCAGATCATCAGATTTTGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 143383 TCTGGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCTTTAGATCATCAGATTTTGCGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAATTTTGTGCAAACAGATCTCCCTTTTCATCCTCTCACTCAGATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143433 GAATTTTGTGCAAACAGATCTCCCTTTTCATCCTCTCACTCAGATGATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATAGCCCTCAGAATTCTGATTATCTTTTAGCTCTCAGCACTGAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 143483 ATAGCCCTCAGAATTCTGATTATCTTTTAGCTCTCAGCACTGAAGTA...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    709    AATGGCCTGTGGGTGTCCAAGAATTTTGGGGGAAAATGGGAAGAAAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146888 CAGAATGGCCTGTGGGTGTCCAAGAATTTTGGGGGAAAATGGGAAGAAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCACAAAGCAGTATGTTTGGCCAAATG         GGGATCAGACAACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 146938 CCACAAAGCAGTATGTTTGGCCAAATGGTG...TAGGGGATCAGACAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCATCTTCTTTACAACCTATGCAAATGGCTCCTGCA         AAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 150375 CCATCTTCTTTACAACCTATGCAAATGGCTCCTGCAGTA...AAGAAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GACCTTGGGGCTCTGGAATTATGGAGAACTTCAGACTTGGGAAAAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152017 GACCTTGGGGCTCTGGAATTATGGAGAACTTCAGACTTGGGAAAAAGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAAAACTATTGGTGTGAAAATCTACTCATTTGGTCTTGGGGGACGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152067 CAAAACTATTGGTGTGAAAATCTACTCATTTGGTCTTGGGGGACGTTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTTTTGCCTCTGTGATGGCTGATAAG         GATACCACAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| |||||||||
 152117 TTTTTGCCTCTGTGATGGCTGATAAGGTA...TAGGATACAACAAGAAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ATCCACGTTTCAACAGATCAAGGGGACACATGGAGCATGGCCCAGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155750 ATCCACGTTTCAACAGATCAAGGGGACACATGGAGCATGGCCCAGCTCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CTCCGTGGGACAGGAACAGTTCTATTCTATTCTGGCAGCAAATGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155800 CTCCGTGGGACAGGAACAGTTCTATTCTATTCTGGCAGCAAATGATGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGTATTCATGCATGTAGATGAACCTGGAG         ACACTGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 155850 TGGTATTCATGCATGTAGATGAACCTGGAGGTA...CAGACACTGGGTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GGCACAATCTTTACCTCAGATGATCGAGGCATTGTCTATTCCAAGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157025 GGCACAATCTTTACCTCAGATGATCGAGGCATTGTCTATTCCAAGTCTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGACCGACATCTCTACACTACCACAGGCGGAGAGACGGACTTTACCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157075 GGACCGACATCTCTACACTACCACAGGCGGAGAGACGGACTTTACCAACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TGACCTCCCTCCGCGGCGTCTACATAACAAGCGTGCTCTCCGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 157125 TGACCTCCCTCCGCGGCGTCTACATAACAAGCGTGCTCTCCGAAGGTG..

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265     ATAATTCTATCCAGACCATGATCACTTTTGACCAAGGAGGAAGGTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157175 .CAGATAATTCTATCCAGACCATGATCACTTTTGACCAAGGAGGAAGGTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GACGCACCTGAGGAAGCCTGAAAACAGTGAATGTGATGCTACAGCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161593 GACGCACCTGAGGAAGCCTGAAAACAGTGAATGTGATGCTACAGCAAAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ACAAGAATGAG         TGCAGCCTTCATATTCATGCTTCCTACAGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 161643 ACAAGAATGAGGTT...CAGTGCAGCCTTCATATTCATGCTTCCTACAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ATCTCCCAGAAACTGAATGTTCCAATGGCCCCACTCTCAGAGCCGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170322 ATCTCCCAGAAACTGAATGTTCCAATGGCCCCACTCTCAGAGCCGAATGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CGTAGGCATTGTCATTGCTCATG         GTAGCGTGGGGGATGCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 170372 CGTAGGCATTGTCATTGCTCATGGTA...CAGGTAGCGTGGGGGATGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TCTCAGTGATGGTTCCAGATGTGTACATCTCAGATGATGGGGGTTACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170751 TCTCAGTGATGGTTCCAGATGTGTACATCTCAGATGATGGGGGTTACTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TGGACAAAGATGCTGGAAGGACCCCACTATTACACCATCCTGGATTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170801 TGGACAAAGATGCTGGAAGGACCCCACTATTACACCATCCTGGATTCTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AGGCATCATTGTGGCCATTGAGCACAGCAGCCGTCCTATCAATGTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170851 AGGCATCATTGTGGCCATTGAGCACAGCAGCCGTCCTATCAATGTGATTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 A         GTTCTCCACAGACGAAGGTCAATGCTGGCAAACCTACACG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170901 AGTA...CAGGTTCTCCACAGACGAAGGTCAATGCTGGCAAACCTACACG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TTCACCAGGGACCCCATCTATTTCACTGGCCTAGCTTCAGAACCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172844 TTCACCAGGGACCCCATCTATTTCACTGGCCTAGCTTCAGAACCTGGAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TAGGTCCATGAATATCAGCATTTGGGGCTTCACAGAATCTTTCCTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172894 TAGGTCCATGAATATCAGCATTTGGGGCTTCACAGAATCTTTCCTGACCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GCCAGTGGGTCTCCTACACCATTGATTTTAAAGATATCCTTGAAAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172944 GCCAGTGGGTCTCCTACACCATTGATTTTAAAGATATCCTTGAAAGGAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 T         GTGAAGAGAAGGACTATACCATATGGCTGGCACACTCCAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172994 TGTG...TAGGTGAAGAGAAGGACTATACCATATGGCTGGCACACTCCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 AGACCCTGAAGATTATGAAGATGGCTGCATTTTGGGCTACAAAGAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174812 AGACCCTGAAGATTATGAAGATGGCTGCATTTTGGGCTACAAAGAACAGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TTCTGCGGCTACGCAAGTCATCCGTGTGTCAGAATGGTCGAGACTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174862 TTCTGCGGCTACGCAAGTCATCCGTGTGTCAGAATGGTCGAGACTATGTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GTGACCAAGCAGCCCTCCATCTGCCTCTGTTCCCTGGAGGACTTTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174912 GTGACCAAGCAGCCCTCCATCTGCCTCTGTTCCCTGGAGGACTTTCTCTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025          TGATTTTGGCTACTACCGTCCAGAAAATGACTCCAAGTGTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174962 GTA...CAGTGATTTTGGCTACTACCGTCCAGAAAATGACTCCAAGTGTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TGGAACAGCCAGAACTGAAGGGCCACGACCTGGAGTTTTGTCTGTACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179965 TGGAACAGCCAGAACTGAAGGGCCACGACCTGGAGTTTTGTCTGTACGGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AGAGAAGAACACCTAACAACAAATGG         GTACCGGAAAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 180015 AGAGAAGAACACCTAACAACAAATGGGTG...TAGGTACCGGAAAATTCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 AGGGGACAAATGCCAGGGTGGGGTAAATCCAGTTCGAGAAGTAAAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180950 AGGGGACAAATGCCAGGGTGGGGTAAATCCAGTTCGAGAAGTAAAAGACT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TGAAAAAGAAATGCACAAGCAACTTTTTGAGTCCGGAAAAACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 181000 TGAAAAAGAAATGCACAAGCAACTTTTTGAGTCCGGAAAAACAGGTA...

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251    AATTCCAAGTCAAATTCTGTTCCAATTATCCTGGCCATCGTGGGATT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183112 AAGAATTCCAAGTCAAATTCTGTTCCAATTATCCTGGCCATCGTGGGATT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GATGCTGGTCACAGTCGTAGCAGGAGTGCTCATTGTGAAGAAATATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183162 GATGCTGGTCACAGTCGTAGCAGGAGTGCTCATTGTGAAGAAATATGTCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 GTGGGGGAAG         GTTCCTGGTGCATCGATACTCTGTGCTGCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 183212 GTGGGGGAAGGTA...CAGGTTCCTGGTGCATCGATACTCTGTGCTGCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 CAGCATGCAGAGGCCAATGGTGTGGATGGTGTGGATGCTTTGGACACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183540 CAGCATGCAGAGGCCAATGGTGTGGATGGTGTGGATGCTTTGGACACAGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CTCCCACACTAATAAAAGTGGTTATCATGATGACTCAGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183590 CTCCCACACTAATAAAAGTGGTTATCATGATGACTCAGATGAGG