seq1 = pF1KB5790.tfa, 2331 bp
seq2 = pF1KB5790/gi568815596r_214628679.tfa (gi568815596r:214628679_214909569), 280891 bp

>pF1KB5790 2331
>gi568815596r:214628679_214909569 (Chr2)

(complement)

1-158  (100001-100158)   99% ->
159-215  (112453-112509)   100% ->
216-364  (117125-117273)   100% ->
365-1314  (128061-129010)   99% ->
1315-1395  (140258-140338)   100% ->
1396-1568  (141916-142088)   100% ->
1569-1677  (157015-157123)   100% ->
1678-1810  (163716-163848)   100% ->
1811-1903  (164411-164503)   100% ->
1904-2001  (179062-179159)   100% ->
2002-2331  (180562-180891)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGATAATCGGCAGCCGAGGAACCGGCAGCCGAGGATCCGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGATAATCGGCAGCCGAGGAACCGGCAGCCGAGGATCCGCTCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACGAGCCTCGTTCCGCGTCCGCCATGGAACCGGATGGTCGCGGTGCCT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACGAGCCTCGTTCCGCGCCCGCCATGGAACCGGATGGTCGCGGTGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCCCACAGTCGCGCCGCGCTCGACCGCCTGGAGAAGCTGCTGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGCCCACAGTCGCGCCGCGCTCGACCGCCTGGAGAAGCTGCTGCGCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGCGTTG         TACTAACATTCTGAGAGAGCCTGTGTGTTTAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGCGTTGGTA...CAGTACTAACATTCTGAGAGAGCCTGTGTGTTTAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGATGTGAGCACATCTTCTGTAG         TAATTGTGTAAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112486 AGGATGTGAGCACATCTTCTGTAGGTA...AAGTAATTGTGTAAGTGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCATTGGAACTGGATGTCCAGTGTGTTACACCCCGGCCTGGATACAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117142 GCATTGGAACTGGATGTCCAGTGTGTTACACCCCGGCCTGGATACAAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGAAGATAAATAGACAACTGGACAGCATGATTCAACTTTGTAGTAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117192 TTGAAGATAAATAGACAACTGGACAGCATGATTCAACTTTGTAGTAAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCGAAATTTGCTACATGACAATGAGCTGTCAG         ATTTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 117242 TCGAAATTTGCTACATGACAATGAGCTGTCAGGTA...CAGATTTGAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGATAAACCTAGGAAAAGTTTGTTTAATGATGCAGGAAACAAGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128070 AAGATAAACCTAGGAAAAGTTTGTTTAATGATGCAGGAAACAAGAAGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCAATTAAAATGTGGTTTAGCCCTCGAAGTAAGAAAGTCAGATATGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128120 TCAATTAAAATGTGGTTTAGCCCTCGAAGTAAGAAAGTCAGATATGTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGTAAAGCTTCAGTGCAAACCCAGCCTGCAATAAAAAAAGATGCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128170 GAGTAAAGCTTCAGTGCAAACCCAGCCTGCAATAAAAAAAGATGCAAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCAGCAAGACTCATATGAATTTGTTTCCCCAAGTCCTCCTGCAGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128220 CTCAGCAAGACTCATATGAATTTGTTTCCCCAAGTCCTCCTGCAGATGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCTGAGAGGGCTAAAAAGGCTTCTGCAAGATCTGGAAAAAAGCAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128270 TCTGAGAGGGCTAAAAAGGCTTCTGCAAGATCTGGAAAAAAGCAAAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAAACTTTAGCTGAAATCAACCAAAAATGGAATTTAGAGGCAGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128320 GAAAACTTTAGCTGAAATCAACCAAAAATGGAATTTAGAGGCAGAAAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AAGATGGTGAATTTGACTCCAAAGAGGAATCTAAGCAAAAGCTGGTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128370 AAGATGGTGAATTTGACTCCAAAGAGGAATCTAAGCAAAAGCTGGTATCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTCTGTAGCCAACCATCTGTTATCTCCAGTCCTCAGATAAATGGTGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128420 TTCTGTAGCCAACCATCTGTTATCTCCAGTCCTCAGATAAATGGTGAAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGACTTACTAGCAAGTGGCTCCTTGACAGAATCTGAATGTTTTGGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128470 AGACTTACTAGCAAGTGGCTCCTTGACAGAATCTGAATGTTTTGGAAGTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TAACTGAAGTCTCTTTACCATTGGCTGAGCAAATAGAGTCTCCAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128520 TAACTGAAGTCTCTTTACCATTGGCTGAGCAAATAGAGTCTCCAGACACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAGAGCAGGAATGAAGTAGTGACTCCTGAGAAGGTCTGCAAAAATTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128570 AAGAGCAGGAATGAAGTAGTGACTCCTGAGAAGGTCTGCAAAAATTATCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TACATCTAAGAAATCTTTGCCATTAGAAAATAATGGAAAACGTGGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128620 TACATCTAAGAAATCTTTGCCATTAGAAAATAATGGAAAACGTGGCCATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ACAATAGACTTTCCAGTCCCATTTCTAAGAGATGTAGAACCAGCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128670 ACAATAGACTTTCCAGTCCCATTTCTAAGAGATGTAGAACCAGCATTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AGCACCAGTGGAGATTTTGTTAAGCAAACGGTGCCCTCAGAAAATATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128720 AGCACCAGTGGAGATTTTGTTAAGCAAACGGTGCCCTCAGAAAATATACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 ATTGCCTGAATGTTCTTCACCACCTTCATGCAAACGTAAAGTTGGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128770 ATTGCCTGAATGTTCTTCACCACCTTCATGCAAACGTAAAGTTGGTGGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CATCAGGGAGCAAAAACAGTAACATGTCCGATGAATTCATTAGTCTTTCA
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128820 CATCAGGGAGGAAAAACAGTAACATGTCCGATGAATTCATTAGTCTTTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CCAGGTACACCACCTTCTACATTAAGTAGTTCAAGTTACAGGCGAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128870 CCAGGTACACCACCTTCTACATTAAGTAGTTCAAGTTACAGGCGAGTGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GTCTAGTCCCTCAGCAATGAAGCTGTTGCCCAATATGGCTGTGAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128920 GTCTAGTCCCTCAGCAATGAAGCTGTTGCCCAATATGGCTGTGAAAAGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 ATCATAGAGGAGAGACTTTGCTCCATATTGCTTCTATTAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 128970 ATCATAGAGGAGAGACTTTGCTCCATATTGCTTCTATTAAGGTA...TAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGCGACATACCTTCTGTTGAATACCTTTTACAAAATGGAAGTGATCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140258 GGCGACATACCTTCTGTTGAATACCTTTTACAAAATGGAAGTGATCCAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TGTTAAAGACCATGCTGGATGGACACCATTG         CATGAAGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 140308 TGTTAAAGACCATGCTGGATGGACACCATTGGTA...TAGCATGAAGCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GCAATCATGGGCACCTGAAGGTAGTGGAATTATTGCTCCAGCATAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141926 GCAATCATGGGCACCTGAAGGTAGTGGAATTATTGCTCCAGCATAAGGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TTGGTGAACACCACCGGGTATCAAAATGACTCACCACTTCACGATGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141976 TTGGTGAACACCACCGGGTATCAAAATGACTCACCACTTCACGATGCAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CAAGAATGGGCATGTGGATATAGTCAAGCTGTTACTTTCCTATGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142026 CAAGAATGGGCATGTGGATATAGTCAAGCTGTTACTTTCCTATGGAGCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 CCAGAAATGCTGT         TAATATATTTGGTCTGCGGCCTGTCGAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 142076 CCAGAAATGCTGTGTA...CAGTAATATATTTGGTCTGCGGCCTGTCGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 TATACAGATGATGAAAGTATGAAATCGCTATTGCTGCTACCAGAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157043 TATACAGATGATGAAAGTATGAAATCGCTATTGCTGCTACCAGAGAAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 TGAATCATCCTCAGCTAGCCACTGCTCAGTA         ATGAACACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 157093 TGAATCATCCTCAGCTAGCCACTGCTCAGTAGTA...CAGATGAACACTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 GGCAGCGTAGGGATGGACCTCTTGTACTTATAGGCAGTGGGCTGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163726 GGCAGCGTAGGGATGGACCTCTTGTACTTATAGGCAGTGGGCTGTCTTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GAACAACAGAAAATGCTCAGTGAGCTTGCAGTAATTCTTAAGGCTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163776 GAACAACAGAAAATGCTCAGTGAGCTTGCAGTAATTCTTAAGGCTAAAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 ATATACTGAGTTTGACAGTACAG         TAACTCATGTTGTTGTTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 163826 ATATACTGAGTTTGACAGTACAGGTG...TAGTAACTCATGTTGTTGTTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 CTGGTGATGCAGTTCAAAGTACCTTGAAGTGTATGCTTGGGATTCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164429 CTGGTGATGCAGTTCAAAGTACCTTGAAGTGTATGCTTGGGATTCTCAAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GGATGCTGGATTCTAAAATTTGAAT         GGGTAAAAGCATGTCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 164479 GGATGCTGGATTCTAAAATTTGAATGTA...CAGGGGTAAAAGCATGTCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 ACGAAGAAAAGTATGTGAACAGGAAGAAAAGTATGAAATTCCTGAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179078 ACGAAGAAAAGTATGTGAACAGGAAGAAAAGTATGAAATTCCTGAAGGTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 CACGCAGAAGCAGGCTCAACAGAGAACAGCTG         TTGCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 179128 CACGCAGAAGCAGGCTCAACAGAGAACAGCTGGTA...CAGTTGCCAAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 CTGTTTGATGGATGCTACTTCTATTTGTGGGGAACCTTCAAACACCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180571 CTGTTTGATGGATGCTACTTCTATTTGTGGGGAACCTTCAAACACCATCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 AAAGGACAACCTTATTAAGCTCGTCACTGCAGGTGGGGGCCAGATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180621 AAAGGACAACCTTATTAAGCTCGTCACTGCAGGTGGGGGCCAGATCCTCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 GTAGAAAGCCCAAGCCAGACAGTGACGTGACTCAGACCATCAATACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180671 GTAGAAAGCCCAAGCCAGACAGTGACGTGACTCAGACCATCAATACAGTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 GCATACCATGCGAGACCCGATTCTGATCAGCGCTTCTGCACACAGTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180721 GCATACCATGCGAGACCCGATTCTGATCAGCGCTTCTGCACACAGTATAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 CATCTATGAAGATTTGTGTAATTATCACCCAGAGAGGGTTCGGCAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180771 CATCTATGAAGATTTGTGTAATTATCACCCAGAGAGGGTTCGGCAGGGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 AAGTCTGGAAGGCTCCTTCGAGCTGGTTTATAGACTGTGTGATGTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180821 AAGTCTGGAAGGCTCCTTCGAGCTGGTTTATAGACTGTGTGATGTCCTTT

   2400     .    :    .    :
   2311 GAGTTGCTTCCTCTTGACAGC
        |||||||||||||||||||||
 180871 GAGTTGCTTCCTCTTGACAGC