seq1 = pF1KB5789.tfa, 2487 bp
seq2 = pF1KB5789/gi568815582r_66808395.tfa (gi568815582r:66808395_67018065), 209671 bp

>pF1KB5789 2487
>gi568815582r:66808395_67018065 (Chr16)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-129  (100341-100424)   100% ->
130-285  (101637-101792)   100% ->
286-424  (101863-102001)   100% ->
425-583  (102688-102846)   100% ->
584-780  (103654-103850)   100% ->
781-903  (104453-104575)   100% ->
904-1054  (104785-104935)   100% ->
1055-1282  (105175-105402)   100% ->
1283-1359  (105486-105562)   100% ->
1360-1548  (105636-105824)   100% ->
1549-1790  (105926-106167)   100% ->
1791-1924  (106751-106884)   100% ->
1925-2167  (107564-107806)   100% ->
2168-2275  (107973-108080)   100% ->
2276-2392  (108683-108799)   100% ->
2393-2487  (109577-109671)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGTG..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     GCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCTGTCTGTGGAAGTTCCAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .CAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCTGTCTGTGGAAGTTCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAG         TTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100387 AAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGGTG...CAGTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCGCTGCCCCGTGAGGGGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101640 CCGCTGCCCCGTGAGGGGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGATTCTGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101690 AGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGATTCTGGCTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101740 TGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAG         GTCACCCTGGAGATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101790 CAGGTA...CAGGTCACCCTGGAGATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 ATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 G         GCATCCCCTTCCTCTTCCTTGAGGCTTCAGACCGGGATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GGTG...CAGGCATCCCCTTCCTCTTCCTTGAGGCTTCAGACCGGGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102728 GCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAGCCCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102778 CAGCCCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGCCCTCAGCCCCAAGG         GGAGCACCAGCCTTGACCACGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102828 CTGGCCCTCAGCCCCAAGGGTA...TAGGGAGCACCAGCCTTGACCACGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103676 CCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGCCTCAGGCCACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103726 AGGCCTCAGGCCACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGCAGAGAATCTCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103776 AGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGCAGAGAATCTCAAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTATACCCGCACCACATGGCCCAG         GTACACTGGAGTGGGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103826 CCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTG...CAGGTACACTGGAGTGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTGATGTGCACTATCACCTGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104469 GTGATGTGCACTATCACCTGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGAGAAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104519 AATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGAGAAGCCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGCTGAG         TACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104569 GGCTGAGGTG...CAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGAGCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104819 GCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGAGCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104869 AATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGAGCTCAGTCCACCAG         GTACTGAAGTGACTAGACTGTCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104919 TGAGCTCAGTCCACCAGGTG...CAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAATTCCCACGTTGTGTATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105199 CAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAATTCCCACGTTGTGTATCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105249 CTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GGACCCCACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105299 GGACCCCACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCATGGACCTGGCAGGCGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105349 GCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCATGGACCTGGCAGGCGCAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GGTG         GCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105399 GGTGGTA...TAGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGATATCAATGATCACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 105523 AGATATCAATGATCACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGGTA...CAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105637 TTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGTGGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105687 ATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TTTTGCCATTGAGAGGGGAGACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105737 TTTTGCCATTGAGAGGGGAGACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAG         AAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105787 AGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGGTG...CAGAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTCAGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105929 CTCAGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCCAGGCCCTGGAGCCACCGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105979 TGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCCAGGCCCTGGAGCCACCGCCACGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106029 TGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AGCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106079 AGCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GACCATCCAGCCCTCCGACCCCATCAGCCGAACCCTCAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106129 GACCATCCAGCCCTCCGACCCCATCAGCCGAACCCTCAGGTG...CAGGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106753 TCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GGGGAGGTGCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106803 GGGGAGGTGCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG         ATGAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 106853 CTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAGGTA...CAGATGAGCCGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107573 GACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GCCCCAGCCCTGACTCTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107623 GCCCCAGCCCTGACTCTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAAGGACCCCGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107673 CCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAAGGACCCCGATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 TGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107723 TGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GTGCAACGGGATTGGCGCCTCCAGACTCTCAATG         GTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107773 GTGCAACGGGATTGGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTG...AAGGTTCCCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 TGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACACATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107980 TGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACACATAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 TCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108030 TCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 G         TGATCGTGTGTCGCTGCAACGTGGAGGGGCAGTGCATGCG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108080 GGTG...CAGTGATCGTGTGTCGCTGCAACGTGGAGGGGCAGTGCATGCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108723 CAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TCCTTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAG         GAATCTTCCTCATC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108773 TCCTTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGTA...CAGGAATCTTCCTCATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAGGACCCGGATCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109591 CTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAGGACCCGGATCAACC

   2600     .    :    .    :    .    :
   2457 AGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 109641 AGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC