seq1 = pF1KB5787.tfa, 2487 bp
seq2 = pF1KB5787/gi568815582f_68545380.tfa (gi568815582f:68545380_68798397), 253018 bp

>pF1KB5787 2487
>gi568815582f:68545380_68798397 (Chr16)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-160  (100257-100371)   100% ->
161-246  (131006-131091)   100% ->
247-390  (132755-132898)   100% ->
391-546  (133122-133277)   100% ->
547-691  (133383-133527)   100% ->
692-867  (134420-134595)   100% ->
868-996  (135589-135717)   100% ->
997-1182  (136923-137108)   100% ->
1183-1424  (139204-139445)   100% ->
1425-1570  (139826-139971)   100% ->
1571-1795  (142133-142357)   100% ->
1796-2002  (146341-146547)   100% ->
2003-2133  (149876-150006)   100% ->
2134-2280  (150398-150544)   100% ->
2281-2487  (152812-153018)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTCCCTCGTGGACCTCTCGCGTCTCTCCTCCTTCTCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGGGGCTCCCTCGTGGACCTCTCGCGTCTCTCCTCCTTCTCCAGGTA..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     GTTTGCTGGCTGCAGTGCGCGGCCTCCGAGCCGTGCCGGGCGGTCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .CAGGTTTGCTGGCTGCAGTGCGCGGCCTCCGAGCCGTGCCGGGCGGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAGGGAGGCTGAAGTGACCTTGGAGGCGGGAGGCGCGGAGCAGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100303 TCAGGGAGGCTGAAGTGACCTTGGAGGCGGGAGGCGCGGAGCAGGAGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCCAGGCGCTGGGGAAAG         TATTCATGGGCTGCCCTGGGCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100353 GGCCAGGCGCTGGGGAAAGGTA...CAGTATTCATGGGCTGCCCTGGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAGCCAGCTCTGTTTAGCACTGATAATGATGACTTCACTGTGCGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131028 AGAGCCAGCTCTGTTTAGCACTGATAATGATGACTTCACTGTGCGGAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCGAGACAGTCCAG         GAAAGAAGGTCACTGAAGGAAAGGAAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 131078 GCGAGACAGTCCAGGTA...CAGGAAAGAAGGTCACTGAAGGAAAGGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCATTGAAGATCTTCCCATCCAAACGTATCTTACGAAGACACAAGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132782 CCATTGAAGATCTTCCCATCCAAACGTATCTTACGAAGACACAAGAGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTGGGTGGTTGCTCCAATATCTGTCCCTGAAAATGGCAAGGGTCCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132832 TTGGGTGGTTGCTCCAATATCTGTCCCTGAAAATGGCAAGGGTCCCTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCAGAGACTGAATCAG         CTCAAGTCTAATAAAGATAGAGAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 132882 CCCAGAGACTGAATCAGGTA...CAGCTCAAGTCTAATAAAGATAGAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACCAAGATTTTCTACAGCATCACGGGGCCGGGGGCAGACAGCCCCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133146 ACCAAGATTTTCTACAGCATCACGGGGCCGGGGGCAGACAGCCCCCCTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGTGTCTTCGCTGTAGAGAAGGAGACAGGCTGGTTGTTGTTGAATAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133196 GGGTGTCTTCGCTGTAGAGAAGGAGACAGGCTGGTTGTTGTTGAATAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CACTGGACCGGGAGGAGATTGCCAAGTATGAG         CTCTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 133246 CACTGGACCGGGAGGAGATTGCCAAGTATGAGGCA...CAGCTCTTTGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CACGCTGTGTCAGAGAATGGTGCCTCAGTGGAGGACCCCATGAACATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133392 CACGCTGTGTCAGAGAATGGTGCCTCAGTGGAGGACCCCATGAACATCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CATCATCGTGACCGACCAGAATGACCACAAGCCCAAGTTTACCCAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133442 CATCATCGTGACCGACCAGAATGACCACAAGCCCAAGTTTACCCAGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCTTCCGAGGGAGTGTCTTAGAGGGAGTCCTACCAG         GTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 133492 CCTTCCGAGGGAGTGTCTTAGAGGGAGTCCTACCAGGTA...CAGGTACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCTGTGATGCAGGTGACAGCCACGGATGAGGATGATGCCATCTACACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134425 TCTGTGATGCAGGTGACAGCCACGGATGAGGATGATGCCATCTACACCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAATGGGGTGGTTGCTTACTCCATCCATAGCCAAGAACCAAAGGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134475 CAATGGGGTGGTTGCTTACTCCATCCATAGCCAAGAACCAAAGGACCCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACGACCTCATGTTCACCATTCACCGGAGCACAGGCACCATCAGCGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134525 ACGACCTCATGTTCACCATTCACCGGAGCACAGGCACCATCAGCGTCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCCAGTGGCCTGGACCGGGAA         AAAGTCCCTGAGTACACACT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 134575 TCCAGTGGCCTGGACCGGGAAGTG...CAGAAAGTCCCTGAGTACACACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GACCATCCAGGCCACAGACATGGATGGGGACGGCTCCACCACCACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135609 GACCATCCAGGCCACAGACATGGATGGGGACGGCTCCACCACCACGGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGGCAGTAGTGGAGATCCTTGATGCCAATGACAATGCTCCCATGTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135659 TGGCAGTAGTGGAGATCCTTGATGCCAATGACAATGCTCCCATGTTTGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCCCAGAAG         TACGAGGCCCATGTGCCTGAGAATGCAGTGGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 135709 CCCCAGAAGGTA...CAGTACGAGGCCCATGTGCCTGAGAATGCAGTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCATGAGGTGCAGAGGCTGACGGTCACTGATCTGGACGCCCCCAACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136955 CCATGAGGTGCAGAGGCTGACGGTCACTGATCTGGACGCCCCCAACTCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CAGCGTGGCGTGCCACCTACCTTATCATGGGCGGTGACGACGGGGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137005 CAGCGTGGCGTGCCACCTACCTTATCATGGGCGGTGACGACGGGGACCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTTACCATCACCACCCACCCTGAGAGCAACCAGGGCATCCTGACAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137055 TTTACCATCACCACCCACCCTGAGAGCAACCAGGGCATCCTGACAACCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GAAG         GGTTTGGATTTTGAGGCCAAAAACCAGCACACCCTGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137105 GAAGGTG...TAGGGTTTGGATTTTGAGGCCAAAAACCAGCACACCCTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ACGTTGAAGTGACCAACGAGGCCCCTTTTGTGCTGAAGCTCCCAACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139241 ACGTTGAAGTGACCAACGAGGCCCCTTTTGTGCTGAAGCTCCCAACCTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ACAGCCACCATAGTGGTCCACGTGGAGGATGTGAATGAGGCACCTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139291 ACAGCCACCATAGTGGTCCACGTGGAGGATGTGAATGAGGCACCTGTGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGTCCCACCCTCCAAAGTCGTTGAGGTCCAGGAGGGCATCCCCACTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139341 TGTCCCACCCTCCAAAGTCGTTGAGGTCCAGGAGGGCATCCCCACTGGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGCCTGTGTGTGTCTACACTGCAGAAGACCCTGACAAGGAGAATCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139391 AGCCTGTGTGTGTCTACACTGCAGAAGACCCTGACAAGGAGAATCAAAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ATCAG         CTACCGCATCCTGAGAGACCCAGCAGGGTGGCTAGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139441 ATCAGGTA...CAGCTACCGCATCCTGAGAGACCCAGCAGGGTGGCTAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CATGGACCCAGACAGTGGGCAGGTCACAGCTGTGGGCACCCTCGACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139862 CATGGACCCAGACAGTGGGCAGGTCACAGCTGTGGGCACCCTCGACCGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AGGATGAGCAGTTTGTGAGGAACAACATCTATGAAGTCATGGTCTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139912 AGGATGAGCAGTTTGTGAGGAACAACATCTATGAAGTCATGGTCTTGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ATGGACAATG         GAAGCCCTCCCACCACTGGCACGGGAACCCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 139962 ATGGACAATGGTG...CAGGAAGCCCTCCCACCACTGGCACGGGAACCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCTGCTAACACTGATTGATGTCAATGACCATGGCCCAGTCCCTGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142164 TCTGCTAACACTGATTGATGTCAATGACCATGGCCCAGTCCCTGAGCCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GTCAGATCACCATCTGCAACCAAAGCCCTGTGCGCCAGGTGCTGAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142214 GTCAGATCACCATCTGCAACCAAAGCCCTGTGCGCCAGGTGCTGAACATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 ACGGACAAGGACCTGTCTCCCCACACCTCCCCTTTCCAGGCCCAGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142264 ACGGACAAGGACCTGTCTCCCCACACCTCCCCTTTCCAGGCCCAGCTCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 AGATGACTCAGACATCTACTGGACGGCAGAGGTCAACGAGGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 142314 AGATGACTCAGACATCTACTGGACGGCAGAGGTCAACGAGGAAGGTA...

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1796    GTGACACAGTGGTCTTGTCCCTGAAGAAGTTCCTGAAGCAGGATACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146338 CAGGTGACACAGTGGTCTTGTCCCTGAAGAAGTTCCTGAAGCAGGATACA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TATGACGTGCACCTTTCTCTGTCTGACCATGGCAACAAAGAGCAGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146388 TATGACGTGCACCTTTCTCTGTCTGACCATGGCAACAAAGAGCAGCTGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GGTGATCAGGGCCACTGTGTGCGACTGCCATGGCCATGTCGAAACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146438 GGTGATCAGGGCCACTGTGTGCGACTGCCATGGCCATGTCGAAACCTGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CTGGACCCTGGAAGGGAGGTTTCATCCTCCCTGTGCTGGGGGCTGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146488 CTGGACCCTGGAAGGGAGGTTTCATCCTCCCTGTGCTGGGGGCTGTCCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GCTCTGCTGT         TCCTCCTGCTGGTGCTGCTTTTGTTGGTGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 146538 GCTCTGCTGTGTG...CAGTCCTCCTGCTGGTGCTGCTTTTGTTGGTGAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 AAAGAAGCGGAAGATCAAGGAGCCCCTCCTACTCCCAGAAGATGACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149907 AAAGAAGCGGAAGATCAAGGAGCCCCTCCTACTCCCAGAAGATGACACCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GTGACAACGTCTTCTACTATGGCGAAGAGGGGGGTGGCGAAGAGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149957 GTGACAACGTCTTCTACTATGGCGAAGAGGGGGGTGGCGAAGAGGACCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134          GACTATGACATCACCCAGCTCCACCGAGGTCTGGAGGCCAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150007 GTG...CAGGACTATGACATCACCCAGCTCCACCGAGGTCTGGAGGCCAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GCCGGAGGTGGTTCTCCGCAATGACGTGGCACCAACCATCATCCCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150439 GCCGGAGGTGGTTCTCCGCAATGACGTGGCACCAACCATCATCCCGACAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CCATGTACCGTCCTCGGCCAGCCAACCCAGATGAAATCGGCAACTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150489 CCATGTACCGTCCTCGGCCAGCCAACCCAGATGAAATCGGCAACTTTATA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 ATTGAG         AACCTGAAGGCGGCTAACACAGACCCCACAGCCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150539 ATTGAGGTG...CAGAACCTGAAGGCGGCTAACACAGACCCCACAGCCCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GCCCTACGACACCCTCTTGGTGTTCGACTATGAGGGCAGCGGCTCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152847 GCCCTACGACACCCTCTTGGTGTTCGACTATGAGGGCAGCGGCTCCGACG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 CCGCGTCCCTGAGCTCCCTCACCTCCTCCGCCTCCGACCAAGACCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152897 CCGCGTCCCTGAGCTCCCTCACCTCCTCCGCCTCCGACCAAGACCAAGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 TACGATTATCTGAACGAGTGGGGCAGCCGCTTCAAGAAGCTGGCAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152947 TACGATTATCTGAACGAGTGGGGCAGCCGCTTCAAGAAGCTGGCAGACAT

   2600     .    :    .    :
   2466 GTACGGTGGCGGGGAGGACGAC
        ||||||||||||||||||||||
 152997 GTACGGTGGCGGGGAGGACGAC