seq1 = pF1KB5782.tfa, 2307 bp
seq2 = pF1KB5782/gi568815577r_44786371.tfa (gi568815577r:44786371_45010782), 224412 bp

>pF1KB5782 2307
>gi568815577r:44786371_45010782 (Chr21)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-147  (100411-100499)   100% ->
148-328  (103688-103868)   100% ->
329-499  (107248-107418)   100% ->
500-741  (109050-109291)   100% ->
742-897  (110308-110463)   100% ->
898-993  (111621-111716)   100% ->
994-1083  (115723-115812)   100% ->
1084-1224  (117239-117379)   100% ->
1225-1412  (118787-118974)   99% ->
1413-1657  (120561-120805)   100% ->
1658-1877  (121288-121507)   100% ->
1878-2080  (121888-122090)   100% ->
2081-2247  (123881-124047)   100% ->
2248-2307  (124353-124412)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGCCTGCGCCCCCCACTGCTCGCCCTGGTGGGGCTGCTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGCCTGCGCCCCCCACTGCTCGCCCTGGTGGGGCTGCTCTCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGTGCG         TCCTCTCTCAGGAGTGCACGAAGTTCAAGGTCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGTGCGGTG...CAGTCCTCTCTCAGGAGTGCACGAAGTTCAAGGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAGCTGCCGGGAATGCATCGAGTCGGGGCCCGGCTGCACCTGGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100444 GCAGCTGCCGGGAATGCATCGAGTCGGGGCCCGGCTGCACCTGGTGCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGCTG         AACTTCACAGGGCCGGGGGATCCTGACTCCATTCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100494 AAGCTGGTA...CAGAACTTCACAGGGCCGGGGGATCCTGACTCCATTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTGCGACACCCGGCCACAGCTGCTCATGAGGGGCTGTGCGGCTGACGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103723 CTGCGACACCCGGCCACAGCTGCTCATGAGGGGCTGTGCGGCTGACGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCATGGACCCCACAAGCCTCGCTGAAACCCAGGAAGACCACAATGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103773 TCATGGACCCCACAAGCCTCGCTGAAACCCAGGAAGACCACAATGGGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGAAGCAGCTGTCCCCACAAAAAGTGACGCTTTACCTGCGACCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103823 CAGAAGCAGCTGTCCCCACAAAAAGTGACGCTTTACCTGCGACCAGGTA.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    329      GCCAGGCAGCAGCGTTCAACGTGACCTTCCGGCGGGCCAAGGGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103873 ..CAGGCCAGGCAGCAGCGTTCAACGTGACCTTCCGGCGGGCCAAGGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCCCATCGACCTGTACTATCTGATGGACCTCTCCTACTCCATGCTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107293 ACCCCATCGACCTGTACTATCTGATGGACCTCTCCTACTCCATGCTTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACCTCAGGAATGTCAAGAAGCTAGGTGGCGACCTGCTCCGGGCCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107343 GACCTCAGGAATGTCAAGAAGCTAGGTGGCGACCTGCTCCGGGCCCTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGAGATCACCGAGTCCGGCCGCATTG         GCTTCGGGTCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107393 CGAGATCACCGAGTCCGGCCGCATTGGTG...CAGGCTTCGGGTCCTTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGACAAGACCGTGCTGCCGTTCGTGAACACGCACCCTGATAAGCTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109065 TGGACAAGACCGTGCTGCCGTTCGTGAACACGCACCCTGATAAGCTGCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACCCATGCCCCAACAAGGAGAAAGAGTGCCAGCCCCCGTTTGCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109115 AACCCATGCCCCAACAAGGAGAAAGAGTGCCAGCCCCCGTTTGCCTTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCACGTGCTGAAGCTGACCAACAACTCCAACCAGTTTCAGACCGAGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109165 GCACGTGCTGAAGCTGACCAACAACTCCAACCAGTTTCAGACCGAGGTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGAAGCAGCTGATTTCCGGAAACCTGGATGCACCCGAGGGTGGGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109215 GGAAGCAGCTGATTTCCGGAAACCTGGATGCACCCGAGGGTGGGCTGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCATGATGCAGGTCGCCGCCTGCCCG         GAGGAAATCGGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 109265 GCCATGATGCAGGTCGCCGCCTGCCCGGTG...CAGGAGGAAATCGGCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCGCAACGTCACGCGGCTGCTGGTGTTTGCCACTGATGACGGCTTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110322 GCGCAACGTCACGCGGCTGCTGGTGTTTGCCACTGATGACGGCTTCCATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCGCGGGCGACGGGAAGCTGGGCGCCATCCTGACCCCCAACGACGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110372 TCGCGGGCGACGGGAAGCTGGGCGCCATCCTGACCCCCAACGACGGCCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TGTCACCTGGAGGACAACTTGTACAAGAGGAGCAACGAATTC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 110422 TGTCACCTGGAGGACAACTTGTACAAGAGGAGCAACGAATTCGTA...CA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    898  GACTACCCATCGGTGGGCCAGCTGGCGCACAAGCTGGCTGAAAACAACA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111620 GGACTACCCATCGGTGGGCCAGCTGGCGCACAAGCTGGCTGAAAACAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCCAGCCCATCTTCGCGGTGACCAGTAGGATGGTGAAGACCTACGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111670 TCCAGCCCATCTTCGCGGTGACCAGTAGGATGGTGAAGACCTACGAGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    994       AAACTCACCGAGATCATCCCCAAGTCAGCCGTGGGGGAGCTGTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111720 ...CAGAAACTCACCGAGATCATCCCCAAGTCAGCCGTGGGGGAGCTGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGAGGACTCCAGCAATGTGGTCCATCTCATTAAGAATGCTTACAAT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 115767 TGAGGACTCCAGCAATGTGGTCCATCTCATTAAGAATGCTTACAATGTG.

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1084      AAACTCTCCTCCAGGGTCTTCCTGGATCACAACGCCCTCCCCGAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115817 ..CAGAAACTCTCCTCCAGGGTCTTCCTGGATCACAACGCCCTCCCCGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ACCCTGAAAGTCACCTACGACTCCTTCTGCAGCAATGGAGTGACGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117284 ACCCTGAAAGTCACCTACGACTCCTTCTGCAGCAATGGAGTGACGCACAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GAACCAGCCCAGAGGTGACTGTGATGGCGTGCAGATCAATGTCCCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 117334 GAACCAGCCCAGAGGTGACTGTGATGGCGTGCAGATCAATGTCCCGGTG.

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1225      ATCACCTTCCAGGTGAAGGTCACGGCCACAGAGTGCATCCAGGAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117384 ..CAGATCACCTTCCAGGTGAAGGTCACGGCCACAGAGTGCATCCAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CAGTCGTTTGTCATCCGGGCGCTGGGCTTCACGGACATAGTGACCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118832 CAGTCGTTTGTCATCCGGGCGCTGGGCTTCACGGACATAGTGACCGTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGTCCTTCCCCAGTGTGAGTGCCGGTGCCGGGACCAGAGCAGAGACCGCA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118882 GGTTCTTCCCCAGTGTGAGTGCCGGTGCCGGGACCAGAGCAGAGACCGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GCCTCTGCCATGGCAAGGGCTTCTTGGAGTGCGGCATCTGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 118932 GCCTCTGCCATGGCAAGGGCTTCTTGGAGTGCGGCATCTGCAGGTG...C

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1413   GTGTGACACTGGCTACATTGGGAAAAACTGTGAGTGCCAGACACAGGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120559 AGGTGTGACACTGGCTACATTGGGAAAAACTGTGAGTGCCAGACACAGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CCGGAGCAGCCAGGAGCTGGAAGGAAGCTGCCGGAAGGACAACAACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120609 CCGGAGCAGCCAGGAGCTGGAAGGAAGCTGCCGGAAGGACAACAACTCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TCATCTGCTCAGGGCTGGGGGACTGTGTCTGCGGGCAGTGCCTGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120659 TCATCTGCTCAGGGCTGGGGGACTGTGTCTGCGGGCAGTGCCTGTGCCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ACCAGCGACGTCCCCGGCAAGCTGATATACGGGCAGTACTGCGAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120709 ACCAGCGACGTCCCCGGCAAGCTGATATACGGGCAGTACTGCGAGTGTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CACCATCAACTGTGAGCGCTACAACGGCCAGGTCTGCGGCGGCCCGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 120759 CACCATCAACTGTGAGCGCTACAACGGCCAGGTCTGCGGCGGCCCGGGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1658       GGAGGGGGCTCTGCTTCTGCGGGAAGTGCCGCTGCCACCCGGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120809 ...CAGGGAGGGGGCTCTGCTTCTGCGGGAAGTGCCGCTGCCACCCGGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TTTGAGGGCTCAGCGTGCCAGTGCGAGAGGACCACTGAGGGCTGCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121332 TTTGAGGGCTCAGCGTGCCAGTGCGAGAGGACCACTGAGGGCTGCCTGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CCCGCGGCGTGTTGAGTGTAGTGGTCGTGGCCGGTGCCGCTGCAACGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121382 CCCGCGGCGTGTTGAGTGTAGTGGTCGTGGCCGGTGCCGCTGCAACGTAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 GCGAGTGCCATTCAGGCTACCAGCTGCCTCTGTGCCAGGAGTGCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121432 GCGAGTGCCATTCAGGCTACCAGCTGCCTCTGTGCCAGGAGTGCCCCGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TGCCCCTCACCCTGTGGCAAGTACAT         CTCCTGCGCCGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 121482 TGCCCCTCACCCTGTGGCAAGTACATGTG...CAGCTCCTGCGCCGAGTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CCTGAAGTTCGAAAAGGGCCCCTTTGGGAAGAACTGCAGCGCGGCGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121903 CCTGAAGTTCGAAAAGGGCCCCTTTGGGAAGAACTGCAGCGCGGCGTGTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CGGGCCTGCAGCTGTCGAACAACCCCGTGAAGGGCAGGACCTGCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121953 CGGGCCTGCAGCTGTCGAACAACCCCGTGAAGGGCAGGACCTGCAAGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 AGGGACTCAGAGGGCTGCTGGGTGGCCTACACGCTGGAGCAGCAGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122003 AGGGACTCAGAGGGCTGCTGGGTGGCCTACACGCTGGAGCAGCAGGACGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GATGGACCGCTACCTCATCTATGTGGATGAGAGCCGAG         AGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 122053 GATGGACCGCTACCTCATCTATGTGGATGAGAGCCGAGGTG...TAGAGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GTGTGGCAGGCCCCAACATCGCCGCCATCGTCGGGGGCACCGTGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123884 GTGTGGCAGGCCCCAACATCGCCGCCATCGTCGGGGGCACCGTGGCAGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 ATCGTGCTGATCGGCATTCTCCTGCTGGTCATCTGGAAGGCTCTGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123934 ATCGTGCTGATCGGCATTCTCCTGCTGGTCATCTGGAAGGCTCTGATCCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CCTGAGCGACCTCCGGGAGTACAGGCGCTTTGAGAAGGAGAAGCTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123984 CCTGAGCGACCTCCGGGAGTACAGGCGCTTTGAGAAGGAGAAGCTCAAGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 CCCAGTGGAACAAT         GATAATCCCCTTTTCAAGAGCGCCACC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 124034 CCCAGTGGAACAATGTA...CAGGATAATCCCCTTTTCAAGAGCGCCACC

   2400     .    :    .    :    .    :
   2275 ACGACGGTCATGAACCCCAAGTTTGCTGAGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 124380 ACGACGGTCATGAACCCCAAGTTTGCTGAGAGT