seq1 = pF1KB5777.tfa, 2466 bp
seq2 = pF1KB5777/gi568815582r_71633061.tfa (gi568815582r:71633061_71889479), 256419 bp

>pF1KB5777 2466
>gi568815582r:71633061_71889479 (Chr16)

(complement)

1-201  (100001-100201)   100% ->
202-326  (114888-115012)   100% ->
327-468  (116118-116259)   100% ->
469-565  (118228-118324)   100% ->
566-642  (119781-119857)   100% ->
643-738  (123896-123991)   100% ->
739-819  (124754-124834)   100% ->
820-918  (125032-125130)   100% ->
919-974  (127913-127968)   100% ->
975-1088  (130559-130672)   100% ->
1089-1229  (133321-133461)   100% ->
1230-1284  (135593-135647)   100% ->
1285-1407  (139148-139270)   100% ->
1408-1497  (139497-139586)   100% ->
1498-1625  (141102-141229)   100% ->
1626-1730  (142788-142892)   100% ->
1731-1872  (143866-144007)   100% ->
1873-1999  (144210-144336)   100% ->
2000-2107  (150139-150246)   99% ->
2108-2268  (150378-150538)   100% ->
2269-2367  (154773-154871)   100% ->
2368-2466  (156321-156419)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGCCCCCATCAGATTGCGGGAGCTGATCCGGACCATCCGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGCCCCCATCAGATTGCGGGAGCTGATCCGGACCATCCGGACAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGAACCCAAGCTGAAGAACGAGAAATGATCCAGAAAGAATGTGCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGAACCCAAGCTGAAGAACGAGAAATGATCCAGAAAGAATGTGCTGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCGGTCATCTTTTAGAGAAGAAGACAATACATACCGATGTCGGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCGGTCATCTTTTAGAGAAGAAGACAATACATACCGATGTCGGAATGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAAAATTACTGTATATGCACATGCTGGGCTACCCTGCTCACTTTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCAAAATTACTGTATATGCACATGCTGGGCTACCCTGCTCACTTTGGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 G         TTGGAGTGCCTCAAGCTTATTGCCTCTCAAAAATTTACAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTA...CAGTTGGAGTGCCTCAAGCTTATTGCCTCTCAAAAATTTACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACAAACGCATTGGCTATTTAGGGGCAATGCTGCTGTTAGATGAAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114928 ACAAACGCATTGGCTATTTAGGGGCAATGCTGCTGTTAGATGAAAGACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGTCCATCTTCTCATGACCAACTGTATCAAGAA         TGATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 114978 GATGTCCATCTTCTCATGACCAACTGTATCAAGAAGTA...CAGTGATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAATCATAGCACGCAATTCGTACAGGGGTTAGCACTTTGTACCCTCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116124 TAATCATAGCACGCAATTCGTACAGGGGTTAGCACTTTGTACCCTCGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCATGGGCTCCTCAGAGATGTGCAGAGATCTTGCAGGAGAGGTAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116174 GCATGGGCTCCTCAGAGATGTGCAGAGATCTTGCAGGAGAGGTAGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCCTGAAAACCTCCAACTCTTACTTAAGAAAAAAG         GCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 116224 CTCCTGAAAACCTCCAACTCTTACTTAAGAAAAAAGGTA...TAGGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACTGTGTGCTGTTCATGTCATCAGGAAAGTTCCTGAACTTATGGAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118233 ACTGTGTGCTGTTCATGTCATCAGGAAAGTTCCTGAACTTATGGAGATGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTTTACCAGCAACAAAAAATTTATTGAATGAGAAGAACCATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 118283 TTTTACCAGCAACAAAAAATTTATTGAATGAGAAGAACCATGGTA...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    566  GTGTCCTCCACACATCTGTAGTCCTCCTCACAGAAATGTGTGAGCGAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119780 GGTGTCCTCCACACATCTGTAGTCCTCCTCACAGAAATGTGTGAGCGAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCAGACATGCTTGCGCATTTCAGAAAG         CTTGTGCCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 119830 CCCAGACATGCTTGCGCATTTCAGAAAGGTA...CAGCTTGTGCCCCAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TAGTTCGTATTTTAAAGAACCTCATCATGTCCGGATATTCACCAGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123909 TAGTTCGTATTTTAAAGAACCTCATCATGTCCGGATATTCACCAGAACAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GATGTTTCTGGTATCAGTGACCCCTTTTTGCAG         GTACGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 123959 GATGTTTCTGGTATCAGTGACCCCTTTTTGCAGGTG...TAGGTACGAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TTTGCGGTTATTAAGAATTTTAGGACGAAATGATGATGATTCAAGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124762 TTTGCGGTTATTAAGAATTTTAGGACGAAATGATGATGATTCAAGTGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CTATGAATGATATATTAGCACAG         GTTGCCACTAATACTGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 124812 CTATGAATGATATATTAGCACAGGTG...CAGGTTGCCACTAATACTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACTAGTAAAAATGTAGGAAATGCTATTCTTTATGAAACGGTTTTGACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125050 ACTAGTAAAAATGTAGGAAATGCTATTCTTTATGAAACGGTTTTGACTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CATGGATATTAAGTCAGAGAGTGGATTGCGA         GTCCTAGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 125100 CATGGATATTAAGTCAGAGAGTGGATTGCGAGTA...TAGGTCCTAGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TAAATATCCTGGGTCGTTTCTTATTGAACAATGACAAGAATATTAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 127923 TAAATATCCTGGGTCGTTTCTTATTGAACAATGACAAGAATATTAGGTA.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    975      ATATGTGGCTCTGACATCTTTGTTGAAGACTGTACAGACAGATCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127973 ..CAGATATGTGGCTCTGACATCTTTGTTGAAGACTGTACAGACAGATCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TAATGCAGTACAGAGGCACAGAAGCACAATTGTGGACTGTCTTAAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130604 TAATGCAGTACAGAGGCACAGAAGCACAATTGTGGACTGTCTTAAAGATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TGGATGTCTCAATAAAACG         GCGTGCAATGGAATTGAGTTTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 130654 TGGATGTCTCAATAAAACGGTA...AAGGCGTGCAATGGAATTGAGTTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GCCCTGGTAAATGGGAATAATATCCGAGGCATGATGAAAGAATTACTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133343 GCCCTGGTAAATGGGAATAATATCCGAGGCATGATGAAAGAATTACTTTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TTTTCTGGATTCGTGTGAGCCAGAATTTAAAGCAGACTGTGCATCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133393 TTTTCTGGATTCGTGTGAGCCAGAATTTAAAGCAGACTGTGCATCTGGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCTTTCTTGCTGCAGAAAA         GTATGCACCTTCCAAACGATGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 133443 TCTTTCTTGCTGCAGAAAAGTA...CAGGTATGCACCTTCCAAACGATGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CATATAGACACAATTATGCGTGTTTTGACAACG         GCAGGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 135615 CATATAGACACAATTATGCGTGTTTTGACAACGGTA...TAGGCAGGAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TTATGTTCGTGATGATGCAGTCCCCAATTTAATCCAGTTAATAACTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139156 TTATGTTCGTGATGATGCAGTCCCCAATTTAATCCAGTTAATAACTAATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GTGTGGAGATGCATGCCTATACTGTCCAGCGCCTGTACAAAGCAATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139206 GTGTGGAGATGCATGCCTATACTGTCCAGCGCCTGTACAAAGCAATTCTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GGTGATTATTCTCAA         CAACCTTTGGTACAAGTGGCTGCATG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 139256 GGTGATTATTCTCAAGTA...CAGCAACCTTTGGTACAAGTGGCTGCATG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GTGTATAGGTGAATATGGTGATCTTCTTGTATCTGGCCAGTGTGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139523 GTGTATAGGTGAATATGGTGATCTTCTTGTATCTGGCCAGTGTGAAGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AAGAGCCTATTCAG         GTAACAGAGGATGAAGTGTTGGATATT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 139573 AAGAGCCTATTCAGGTA...CAGGTAACAGAGGATGAAGTGTTGGATATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 TTAGAAAGTGTCCTAATCTCTAATATGTCCACCTCTGTGACACGAGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141129 TTAGAAAGTGTCCTAATCTCTAATATGTCCACCTCTGTGACACGAGGTTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TGCCCTCACTGCCATTATGAAGCTTTCCACTCGATTCACTTGTACTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141179 TGCCCTCACTGCCATTATGAAGCTTTCCACTCGATTCACTTGTACTGTAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 A         CCGAATTAAGAAAGTGGTTTCCATCTACGGAAGCAGCATT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141229 AGTG...TAGCCGAATTAAGAAAGTGGTTTCCATCTACGGAAGCAGCATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GATGTGGAACTCCAGCAGAGGGCAGTAGAATATAATGCACTTTTCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142828 GATGTGGAACTCCAGCAGAGGGCAGTAGAATATAATGCACTTTTCAAGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 ATATGACCACATGAG         GTCTGCCCTACTTGAGAGAATGCCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 142878 ATATGACCACATGAGGTG...TAGGTCTGCCCTACTTGAGAGAATGCCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 TCATGGAAAAAGTGACCACAAATGGCCCTACTGAGATTGTGCAGACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143892 TCATGGAAAAAGTGACCACAAATGGCCCTACTGAGATTGTGCAGACAAAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 GGAGAGACAGAACCAGCTCCACTAGAGACCAAACCGCCACCCTCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143942 GGAGAGACAGAACCAGCTCCACTAGAGACCAAACCGCCACCCTCTGGGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 ACAGCCCACCAGCCAG         GCCAATGATTTATTGGATTTGTTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 143992 ACAGCCCACCAGCCAGGTA...TAGGCCAATGATTTATTGGATTTGTTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 GAGGAAATGACATAACACCTGTTATTCCAACTGCGCCTACAAGCAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144235 GAGGAAATGACATAACACCTGTTATTCCAACTGCGCCTACAAGCAAACCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 TCTTCTGCTGGTGGAGAACTTCTTGATTTGCTGGGAGACATCAACCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144285 TCTTCTGCTGGTGGAGAACTTCTTGATTTGCTGGGAGACATCAACCTTAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 AG         GTGCTCCAGCTGCTGCTCCTGCCCCTGCCTCAGTCCCAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144335 AGGTG...TAGGTGCTCCAGCTGCTGCTCCTGCCCCTGCCTCAGTCCCAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 AGATATCCCAGCCCCACTTCTTGTTGGATGGGCTTTCATCACAGCCTCTC
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150178 AGATATCCCAGCCCCCCTTCTTGTTGGATGGGCTTTCATCACAGCCTCTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 TTCAATGATATTGCTGCAG         GCATCCCCTCCATCACAGCATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 150228 TTCAATGATATTGCTGCAGGTA...CAGGCATCCCCTCCATCACAGCATA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 CAGTAAGAATGGCTTGAAGATAGAATTCACCTTTGAACGGTCAAATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150400 CAGTAAGAATGGCTTGAAGATAGAATTCACCTTTGAACGGTCAAATACCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 ACCCCAGTGTAACAGTGATAACGATACAGGCCTCCAACAGCACAGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150450 ACCCCAGTGTAACAGTGATAACGATACAGGCCTCCAACAGCACAGAGCTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 GATATGACGGACTTTGTTTTCCAAGCTGCAGTACCAAAG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 150500 GATATGACGGACTTTGTTTTCCAAGCTGCAGTACCAAAGGTA...TAGAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2271 ATTCCAGCTGCAGCTCTTGTCTCCTAGCAGCAGCATTGTCCCAGCATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154775 ATTCCAGCTGCAGCTCTTGTCTCCTAGCAGCAGCATTGTCCCAGCATTTA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 ACACGGGGACCATCACACAAGTCATTAAAGTTCTGAACCCTCAGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 154825 ACACGGGGACCATCACACAAGTCATTAAAGTTCTGAACCCTCAGAAGGTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2368       CAACAGCTGCGAATGCGGATCAAGCTTACATATAATCACAAGGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154875 ...TAGCAACAGCTGCGAATGCGGATCAAGCTTACATATAATCACAAGGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2412 CTCAGCAATGCAAGATCTAGCAGAGGTGAACAACTTTCCCCCTCAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156365 CTCAGCAATGCAAGATCTAGCAGAGGTGAACAACTTTCCCCCTCAGTCCT

   2650     .
   2462 GGCAA
        |||||
 156415 GGCAA