seq1 = pF1KB5775.tfa, 2439 bp
seq2 = pF1KB5775/gi568815580f_58571644.tfa (gi568815580f:58571644_58847839), 276196 bp

>pF1KB5775 2439
>gi568815580f:58571644_58847839 (Chr18)

1-209  (100001-100209)   100% ->
210-376  (109527-109693)   100% ->
377-498  (124723-124844)   100% ->
499-649  (128798-128948)   100% ->
650-828  (137735-137913)   100% ->
829-925  (138333-138429)   100% ->
926-952  (142440-142466)   100% ->
953-985  (144292-144324)   100% ->
986-1189  (151405-151608)   100% ->
1190-1367  (161754-161931)   100% ->
1368-1442  (162664-162738)   100% ->
1443-1570  (163559-163686)   100% ->
1571-1720  (170222-170371)   100% ->
1721-1878  (172695-172852)   100% ->
1879-2004  (174023-174148)   100% ->
2005-2439  (175762-176196)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCTGTTGGGGGACCCGCTACAGGCCCTGCCGCCCTCGGCCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGCTGTTGGGGGACCCGCTACAGGCCCTGCCGCCCTCGGCCGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACGGGGCCGCTGCTCGCCCCTCCGGCCGGCGCGACCCTCAACCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACGGGGCCGCTGCTCGCCCCTCCGGCCGGCGCGACCCTCAACCGCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGAGCCGCTGCTGCGGAGGCTCAGCGAGCTCCTGGATCAGGCGCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGAGCCGCTGCTGCGGAGGCTCAGCGAGCTCCTGGATCAGGCGCCCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCGGGGCTGGAGGAGACTGGCGGAGCTGGCGGGGAGTCGCGGGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCGGGGCTGGAGGAGACTGGCGGAGCTGGCGGGGAGTCGCGGGCGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCCTCAG         TTGCCTAGACCTGGAGCAGTGTTCTCTTAAGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCCTCAGGTG...CAGTTGCCTAGACCTGGAGCAGTGTTCTCTTAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TACTGGAGCCTGAAGGAAGCCCCAGCCTGTGTCTGCTGAAGTTAATGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109559 TACTGGAGCCTGAAGGAAGCCCCAGCCTGTGTCTGCTGAAGTTAATGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAAAAAGGTTGCACAGTCACAGAATTGAGTGATTTCCTGCAGGCTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109609 GAAAAAGGTTGCACAGTCACAGAATTGAGTGATTTCCTGCAGGCTATGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACACACTGAAGTTCTTCAGCTTCTCAGCCCCCCAG         GAATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109659 ACACACTGAAGTTCTTCAGCTTCTCAGCCCCCCAGGTA...TAGGAATAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGATTACTGTAAACCCAGAGTCAAAGGCAGTCTTGGCTGGACAGTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124729 AGATTACTGTAAACCCAGAGTCAAAGGCAGTCTTGGCTGGACAGTTTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAACTGTGTTGCCGGGCAACTGGACATCCTTTTGTTCAATATCAGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124779 AAACTGTGTTGCCGGGCAACTGGACATCCTTTTGTTCAATATCAGTGGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAAATGAATAAAGAG         ATTCCAAATGGAAATACATCAGAGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 124829 CAAAATGAATAAAGAGGTA...CAGATTCCAAATGGAAATACATCAGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTATTTTTAATGCAGTGCATGTAAAAGATGCAGGCTTTTATGTCTGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128823 TTATTTTTAATGCAGTGCATGTAAAAGATGCAGGCTTTTATGTCTGTCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTTAATAACAATTTCACCTTTGAATTCAGCCAGTGGTCACAGCTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128873 GTTAATAACAATTTCACCTTTGAATTCAGCCAGTGGTCACAGCTGGATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTGCGACATCCCAGAGAGCTTCCAGA         GAAGTGTTGATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 128923 TTGCGACATCCCAGAGAGCTTCCAGAGTA...AAGGAAGTGTTGATGGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCTCTGAATCCAAGTTGCAAATCTGTGTTGAACCAACTTCCCAAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137750 TCTCTGAATCCAAGTTGCAAATCTGTGTTGAACCAACTTCCCAAAAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATGCCAGGCAGCACATTGGTTTTACAGTGTGTTGCTGTTGGAAGCCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137800 ATGCCAGGCAGCACATTGGTTTTACAGTGTGTTGCTGTTGGAAGCCCTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCCTCACTACCAGTGGTTCAAAAATGAATTACCATTAACACATGAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137850 TCCTCACTACCAGTGGTTCAAAAATGAATTACCATTAACACATGAGACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAAAGCTATACATG         GTGCCTTATGTGGATTTGGAACACCAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 137900 AAAAGCTATACATGGTA...TAGGTGCCTTATGTGGATTTGGAACACCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGAACCTACTGGTGTCATGTATATAATGATCGAGACAGTCAAGATAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138360 GGAACCTACTGGTGTCATGTATATAATGATCGAGACAGTCAAGATAGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAAGGTAGAAATCATCATAG         ATGAATTAAATAATCTTGGTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 138410 GAAGGTAGAAATCATCATAGGTA...TAGATGAATTAAATAATCTTGGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATCCTG         ATAATAAAGAGCAAACAACTGACCAGCCTTTGG  
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 142461 ATCCTGGTG...TAGATAATAAAGAGCAAACAACTGACCAGCCTTTGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    986        CGAAGGACAAGGTTGCCCTTTTGATAGGAAATATGAATTACCG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144327 G...AAGCGAAGGACAAGGTTGCCCTTTTGATAGGAAATATGAATTACCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGAGCACCCCAAGCTCAAAGCTCCTTTGGTGGATGTGTACGAATTGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151448 GGAGCACCCCAAGCTCAAAGCTCCTTTGGTGGATGTGTACGAATTGACTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACTTACTGAGACAGCTGGACTTCAAAGTGGTTTCACTGTTGGATCTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151498 ACTTACTGAGACAGCTGGACTTCAAAGTGGTTTCACTGTTGGATCTTACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAATATGAGATGCGTAATGCTGTGGATGAGTTTTTACTCCTTTTAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151548 GAATATGAGATGCGTAATGCTGTGGATGAGTTTTTACTCCTTTTAGACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GGGAGTATATG         GGTTATTATATTATGCAGGACATGGTTATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 151598 GGGAGTATATGGTA...CAGGGTTATTATATTATGCAGGACATGGTTATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AAAATTTTGGGAACAGCTTCATGGTCCCCGTTGATGCTCCAAATCCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161784 AAAATTTTGGGAACAGCTTCATGGTCCCCGTTGATGCTCCAAATCCATAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AGGTCTGAAAATTGTCTGTGTGTACAAAATATACTGAAATTGATGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161834 AGGTCTGAAAATTGTCTGTGTGTACAAAATATACTGAAATTGATGCAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AAAAGAAACTGGACTTAATGTGTTCTTATTGGATATGTGTAGGAAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 161884 AAAAGAAACTGGACTTAATGTGTTCTTATTGGATATGTGTAGGAAAAGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1368        AAATGACTACGATGATACCATTCCAATCTTGGATGCACTAAAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161934 A...TAGAAATGACTACGATGATACCATTCCAATCTTGGATGCACTAAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTCACCGCCAATATTGTGTTTGGATATGCCAC         GTGTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 162707 GTCACCGCCAATATTGTGTTTGGATATGCCACGTA...AAGGTGTCAAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AGCAGAAGCTTTTGAAATCCAGCATTCTGGATTGGCAAATGGAATCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163568 AGCAGAAGCTTTTGAAATCCAGCATTCTGGATTGGCAAATGGAATCTTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TGAAATTTTTAAAAGACAGATTATTAGAAGATAAGAAAATCACTGTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163618 TGAAATTTTTAAAAGACAGATTATTAGAAGATAAGAAAATCACTGTGTTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTGGATGAAGTTGCAGAAG         ATATGGGTAAGTGTCACCTTAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 163668 CTGGATGAAGTTGCAGAAGGTA...TAGATATGGGTAAGTGTCACCTTAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CAAAGGCAAACAGGCTCTAGAGATTCGAAGTAGTTTATCTGAGAAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170244 CAAAGGCAAACAGGCTCTAGAGATTCGAAGTAGTTTATCTGAGAAGAGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CACTTACTGATCCAATACAGGGAACAGAATATTCTGCTGAATCTCTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170294 CACTTACTGATCCAATACAGGGAACAGAATATTCTGCTGAATCTCTTGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CGGAATCTACAGTGGGCCAAGGCTCATG         AACTTCCAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 170344 CGGAATCTACAGTGGGCCAAGGCTCATGGTA...CAGAACTTCCAGAAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TATGTGTCTTAAGTTTGACTGTGGTGTTCAGATTCAATTAGGATTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172708 TATGTGTCTTAAGTTTGACTGTGGTGTTCAGATTCAATTAGGATTTGCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CTGAGTTTTCCAATGTCATGATCATCTATACAAGTATAGTTTACAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172758 CTGAGTTTTCCAATGTCATGATCATCTATACAAGTATAGTTTACAAACCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CCGGAGATAATAATGTGTGATGCCTACGTTACTGATTTTCCACTT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 172808 CCGGAGATAATAATGTGTGATGCCTACGTTACTGATTTTCCACTTGTG..

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879     GATCTAGATATTGATCCAAAAGATGCAAATAAAGGCACACCTGAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172858 .CAGGATCTAGATATTGATCCAAAAGATGCAAATAAAGGCACACCTGAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AAACTGGCAGCTACTTGGTATCAAAGGATCTTCCCAAGCATTGCCTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174069 AAACTGGCAGCTACTTGGTATCAAAGGATCTTCCCAAGCATTGCCTCTAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ACCAGACTCAGTTCACTGCAAAAATTAAAG         GAACATCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 174119 ACCAGACTCAGTTCACTGCAAAAATTAAAGGTT...CAGGAACATCTAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CTTCACAGTATGTTTATCATATCAGTACTCAGGATTGGAAGATACTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175773 CTTCACAGTATGTTTATCATATCAGTACTCAGGATTGGAAGATACTGTAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AGGACAAGCAGGAAGTGAATGTTGGGAAACCTCTCATTGCTAAATTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175823 AGGACAAGCAGGAAGTGAATGTTGGGAAACCTCTCATTGCTAAATTAGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 ATGCATCGAGGTTTGGGAAGGAAGACTTGCTTTCAAACTTGTCTTATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175873 ATGCATCGAGGTTTGGGAAGGAAGACTTGCTTTCAAACTTGTCTTATGTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TAATGGTCCTTACCAGAGTTCTGCAGCCACCTCAGGAGGAGCAGGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175923 TAATGGTCCTTACCAGAGTTCTGCAGCCACCTCAGGAGGAGCAGGGCATT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ATCACTCATTGCAAGACCCATTCCATGGTGTTTACCATTCACATCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175973 ATCACTCATTGCAAGACCCATTCCATGGTGTTTACCATTCACATCCTGGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 AATCCAAGTAATGTTACACCAGCAGATAGCTGTCATTGCAGCCGGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176023 AATCCAAGTAATGTTACACCAGCAGATAGCTGTCATTGCAGCCGGACTCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 AGATGCATTTATTTCAAGTTTCGCTCACCATGCTTCATGTCATTTTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176073 AGATGCATTTATTTCAAGTTTCGCTCACCATGCTTCATGTCATTTTAGTA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 GAAGTAATGTGCCAGTAGAGACAACTGATGAAATACCATTTAGTTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176123 GAAGTAATGTGCCAGTAGAGACAACTGATGAAATACCATTTAGTTTCTCT

   2550     .    :    .    :
   2416 GACAGGCTCAGAATTTCTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||
 176173 GACAGGCTCAGAATTTCTGAAAAA