seq1 = pF1KB5758.tfa, 2217 bp
seq2 = pF1KB5758/gi568815591f_30494922.tfa (gi568815591f:30494922_30733857), 238936 bp

>pF1KB5758 2217
>gi568815591f:30494922_30733857 (Chr7)

1-222  (100001-100222)   99% ->
223-324  (103875-103976)   100% ->
325-427  (105026-105128)   100% ->
428-569  (106138-106279)   100% ->
570-658  (108113-108201)   100% ->
659-735  (108575-108651)   100% ->
736-881  (114664-114809)   100% ->
882-1031  (117175-117324)   100% ->
1032-1194  (120975-121137)   100% ->
1195-1359  (122193-122357)   100% ->
1360-1469  (126472-126581)   99% ->
1470-1613  (127398-127541)   100% ->
1614-1699  (131313-131398)   100% ->
1700-1809  (133639-133748)   100% ->
1810-1903  (136527-136620)   100% ->
1904-2094  (137326-137516)   100% ->
2095-2217  (138814-138936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTCTCCGCGTCCAGTGCTGCTTAGAGGTGCTCGCGCCGCTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTCTCCGCGTCCAGTGCTGCTTAGAGGTGCTCGCGCCGCTCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCTGCCGCCCCGGCTCTTAGCCCGACCCTCGCTCCTGCTCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTGCTGCCGCCCCGGCTCTTAGCCCGACCCTCGCTCCTGCTCCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTCCCTCAGCGCGGCCTCCTGCGCCCCGATCTCCTTGCCCGCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTCCCTCAGCGCGGCCTCCTGCCCCCCGATCTCCTTGCCCGCCGCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCGGAGCAGCATGGACGGCGCGGGGGCTGAGGAGGTGCTGGCACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCGGAGCAGCATGGACGGCGCGGGGGCTGAGGAGGTGCTGGCACCTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGGCTAGCAGTGCGCCAGCAG         GGAGATCTTGTGCGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100201 GAGGCTAGCAGTGCGCCAGCAGGTA...TAGGGAGATCTTGTGCGAAAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAAAGAAGATAAAGCACCCCAAGTAGACGTAGACAAAGCAGTGGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103894 TCAAAGAAGATAAAGCACCCCAAGTAGACGTAGACAAAGCAGTGGCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCAAAGCCCGCAAGAGGGTTCTGGAAGCAAAG         GAGCTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103944 CTCAAAGCCCGCAAGAGGGTTCTGGAAGCAAAGGTG...CAGGAGCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTTACAGCCCAAAGATGATATTGTAGACCGAGCAAAAATGGAAGATACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105034 GTTACAGCCCAAAGATGATATTGTAGACCGAGCAAAAATGGAAGATACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGAAGAGGAGGTTTTTCTATGATCAAGCTTTTGCTATTTATGGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105084 TGAAGAGGAGGTTTTTCTATGATCAAGCTTTTGCTATTTATGGAGGTA..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    428     GTGTTAGTGGTCTGTATGACTTTGGGCCAGTTGGCTGTGCTTTGAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105134 .TAGGTGTTAGTGGTCTGTATGACTTTGGGCCAGTTGGCTGTGCTTTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAACAATATTATTCAGACCTGGAGGCAGCACTTTATCCAAGAGGAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106184 GAACAATATTATTCAGACCTGGAGGCAGCACTTTATCCAAGAGGAACAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTGGAGATCGATTGCACCATGCTCACCCCTGAGCCAGTTTTAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 106234 TCCTGGAGATCGATTGCACCATGCTCACCCCTGAGCCAGTTTTAAAGTG.

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    570      GACCTCTGGCCATGTAGACAAATTTGCTGACTTCATGGTGAAAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106284 ..TAGGACCTCTGGCCATGTAGACAAATTTGCTGACTTCATGGTGAAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTAAAAAATGGAGAATGTTTTCGTGCTGACCATCTATTAAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 108158 CGTAAAAAATGGAGAATGTTTTCGTGCTGACCATCTATTAAAAGGTG...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    659    CTCATTTACAGAAATTGATGTCTGATAAGAAGTGTTCTGTCGAAAAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108572 CAGCTCATTTACAGAAATTGATGTCTGATAAGAAGTGTTCTGTCGAAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAATCAGAAATGGAAAGTGTTTTGGCCCAG         CTTGATAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 108622 AAATCAGAAATGGAAAGTGTTTTGGCCCAGGTG...TAGCTTGATAACTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGGACAGCAAGAACTTGCGGATCTTTTTGTGAACTATAATGTAAAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114675 TGGACAGCAAGAACTTGCGGATCTTTTTGTGAACTATAATGTAAAATCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCATTACTGGAAATGATCTATCCCCTCCAGTGTCTTTTAACTTAATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114725 CCATTACTGGAAATGATCTATCCCCTCCAGTGTCTTTTAACTTAATGTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAGACTTTCATTGGGCCTGGAGGAAACATGCCTGG         GTACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 114775 AAGACTTTCATTGGGCCTGGAGGAAACATGCCTGGGTA...TAGGTACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GAGACCAGAAACTGCACAGGGGATTTTCTTGAATTTCAAACGACTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117181 GAGACCAGAAACTGCACAGGGGATTTTCTTGAATTTCAAACGACTTTTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGTTCAACCAAGGAAAGTTGCCTTTTGCTGCTGCCCAGATTGGAAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117231 AGTTCAACCAAGGAAAGTTGCCTTTTGCTGCTGCCCAGATTGGAAATTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTTAGAAATGAGATCTCCCCTCGATCTGGACTGATCAGAGTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 117281 TTTAGAAATGAGATCTCCCCTCGATCTGGACTGATCAGAGTCAGGTA...

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1032    AGAATTCACAATGGCAGAAATTGAGCACTTTGTAGATCCCAGTGAGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120972 CAGAGAATTCACAATGGCAGAAATTGAGCACTTTGTAGATCCCAGTGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAGACCACCCCAAGTTCCAGAATGTGGCAGACCTTCACCTTTATTTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121022 AAGACCACCCCAAGTTCCAGAATGTGGCAGACCTTCACCTTTATTTGTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCAGCAAAAGCCCAGGTCAGCGGACAGTCCGCTCGGAAAATGCGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121072 TCAGCAAAAGCCCAGGTCAGCGGACAGTCCGCTCGGAAAATGCGCCTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGATGCTGTTGAACAG         GGTGTGATTAATAACACAGTATTAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 121122 AGATGCTGTTGAACAGGTA...TAGGGTGTGATTAATAACACAGTATTAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCTATTTCATTGGCCGCATCTACCTCTACCTCACGAAGGTTGGAATATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122218 GCTATTTCATTGGCCGCATCTACCTCTACCTCACGAAGGTTGGAATATCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CCAGATAAACTCCGCTTCCGGCAGCACATGGAGAATGAGATGGCCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122268 CCAGATAAACTCCGCTTCCGGCAGCACATGGAGAATGAGATGGCCCATTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGCCTGTGACTGTTGGGATGCAGAATCCAAAACATCCTAC         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 122318 TGCCTGTGACTGTTGGGATGCAGAATCCAAAACATCCTACGTA...TAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GTTGGATTGAGATTGTTGGATGTGCTGATCGTTCCTGTTATGACCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126473 GTTGGATTGAGATTGTTGGATGTGCTGATCGTTCCTGTTATGACCTCTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TGTCATGCACGAGCCACCAAAGTCCCACTTGTAGCTGAGAAACCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126523 TGTCATGCACGAGCCACCAAAGTCCCACTTGTAGCTGAGAAACCTCTGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AGAACCCAA         AACAGTCAATGTTGTTCAGTTTGAACCCAGTA
        |||||||| >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 126573 AGAACCCATATC...CAAAACAGTCAATGTTGTTCAGTTTGAACCCAGTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGGGAGCAATTGGTAAGGCATATAAGAAGGATGCAAAACTGGTGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127430 AGGGAGCAATTGGTAAGGCATATAAGAAGGATGCAAAACTGGTGATGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TATCTTGCCATTTGTGATGAGTGCTACATTACAGAAATGGAGATGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127480 TATCTTGCCATTTGTGATGAGTGCTACATTACAGAAATGGAGATGCTGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GAATGAGAAAGG         GGAATTCACAATTGAAACTGAAGGGAAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 127530 GAATGAGAAAGGGTA...TAGGGAATTCACAATTGAAACTGAAGGGAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CATTTCAGTTAACAAAAGACATGATCAATGTGAAGAGATTCCAGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131342 CATTTCAGTTAACAAAAGACATGATCAATGTGAAGAGATTCCAGAAAACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CTATATG         TGGAAGAAGTTGTTCCGAATGTAATTGAACCTTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131392 CTATATGGTA...CAGTGGAAGAAGTTGTTCCGAATGTAATTGAACCTTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CTTCGGCCTGGGTAGGATCATGTATACGGTATTTGAACATACATTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133673 CTTCGGCCTGGGTAGGATCATGTATACGGTATTTGAACATACATTCCATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TACGAGAAGGAGATGAACAGAGAACA         TTCTTCAGTTTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 133723 TACGAGAAGGAGATGAACAGAGAACAGTA...CAGTTCTTCAGTTTCCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GCTGTAGTTGCTCCATTCAAATGTTCCGTCCTCCCACTGAGCCAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136542 GCTGTAGTTGCTCCATTCAAATGTTCCGTCCTCCCACTGAGCCAAAACCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GGAGTTCATGCCATTTGTCAAGGAATTAT         CGGAAGCCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 136592 GGAGTTCATGCCATTTGTCAAGGAATTATGTA...TAGCGGAAGCCCTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CCAGGCATGGAGTATCTCACAAAGTAGACGATTCCTCTGGGTCAATCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137338 CCAGGCATGGAGTATCTCACAAAGTAGACGATTCCTCTGGGTCAATCGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AGGCGCTATGCCAGGACTGATGAGATTGGCGTGGCTTTTGGTGTCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137388 AGGCGCTATGCCAGGACTGATGAGATTGGCGTGGCTTTTGGTGTCACCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 TGACTTTGACACAGTGAACAAGACCCCCCACACTGCAACTCTGAGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137438 TGACTTTGACACAGTGAACAAGACCCCCCACACTGCAACTCTGAGGGACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GTGACTCAATGCGGCAGATAAGAGCAGAG         ATCTCTGAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 137488 GTGACTCAATGCGGCAGATAAGAGCAGAGGTA...TAGATCTCTGAGCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CCCAGCATAGTCCAAGACCTAGCCAATGGCAACATCACATGGGCTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138826 CCCAGCATAGTCCAAGACCTAGCCAATGGCAACATCACATGGGCTGATGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 GGAGGCCAGGTATCCTCTGTTTGAAGGGCAAGAGACTGGTAAAAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138876 GGAGGCCAGGTATCCTCTGTTTGAAGGGCAAGAGACTGGTAAAAAAGAGA

   2350     .    :
   2207 CAATCGAGGAA
        |||||||||||
 138926 CAATCGAGGAA