seq1 = pF1KB5751.tfa, 2424 bp
seq2 = pF1KB5751/gi568815592r_32745582.tfa (gi568815592r:32745582_32953816), 208235 bp

>pF1KB5751 2424
>gi568815592r:32745582_32953816 (Chr6)

(complement)

1-778  (100001-100778)   100% ->
779-893  (101315-101429)   100% ->
894-1024  (101578-101708)   100% ->
1025-1230  (102668-102873)   100% ->
1231-1428  (103300-103497)   100% ->
1429-1557  (104699-104827)   100% ->
1558-1746  (104977-105165)   100% ->
1747-1920  (105725-105898)   100% ->
1921-2083  (106142-106304)   100% ->
2084-2220  (106613-106749)   100% ->
2221-2424  (108032-108235)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGCTTCTCGCCAGCGCAGGATCAGCCTGTTCCTGGGACTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAGCTTCTCGCCAGCGCAGGATCAGCCTGTTCCTGGGACTTTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGAGCCCCGCCCTCGTTCCCTCCCCCAGCCGCCAGTAGGGGAGGACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGAGCCCCGCCCTCGTTCCCTCCCCCAGCCGCCAGTAGGGGAGGACTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGTACCCGGAGCTTCAGGCCCCACCGGGGCGCGGAGAGTCCCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGTACCCGGAGCTTCAGGCCCCACCGGGGCGCGGAGAGTCCCAGGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCGGGACCGGGACGGCGTCCGAGTGCCAATGGCTAGCTCTAGGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCGGGACCGGGACGGCGTCCGAGTGCCAATGGCTAGCTCTAGGTGTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCTCCCCGCGGGTGCCGCTGCCTCCCCGGAGCTTCTCTCGCATGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCTCCCCGCGGGTGCCGCTGCCTCCCCGGAGCTTCTCTCGCATGGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGACAGTACTGCTACTTCTCGCCGACTGGGTGCTGCTCCGGACCGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGACAGTACTGCTACTTCTCGCCGACTGGGTGCTGCTCCGGACCGCGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCCGCATATTCTCCCTGCTGGTGCCCACCGCGCTGCCACTGCTCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCCGCATATTCTCCCTGCTGGTGCCCACCGCGCTGCCACTGCTCCGGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGGGCGGTGGGCCTGAGCCGCTGGGCCGTGCTCTGGCTGGGGGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGGGCGGTGGGCCTGAGCCGCTGGGCCGTGCTCTGGCTGGGGGCCTGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGTCCTCAGGGCAACGGTTGGCTCCAAGAGCGAAAACGCAGGTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGTCCTCAGGGCAACGGTTGGCTCCAAGAGCGAAAACGCAGGTGCCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTGGCTGGCTGCTTTGAAGCCATTAGCTGCGGCACTGGGCTTGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTGGCTGGCTGCTTTGAAGCCATTAGCTGCGGCACTGGGCTTGGCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCGGGACTTGCCTTGTTCCGAGAGCTGATCTCATGGGGAGCCCCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCGGGACTTGCCTTGTTCCGAGAGCTGATCTCATGGGGAGCCCCCGGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGCGGATAGCACCAGGCTACTGCACTGGGGAAGTCACCCTACCGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGCGGATAGCACCAGGCTACTGCACTGGGGAAGTCACCCTACCGCCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTTGTCAGTTATGCAGCGGCACTGCCCGCAGCAGCCCTGTGGCACAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTTGTCAGTTATGCAGCGGCACTGCCCGCAGCAGCCCTGTGGCACAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGGGAGCCTCTGGGTGCCCGGCGGTCAGGGCGGCTCTGGAAACCCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGGGAGCCTCTGGGTGCCCGGCGGTCAGGGCGGCTCTGGAAACCCTGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTCGGCTTCTAGGCTGCCTGGGCTCGGAGACGCGCCGCCTCTCGCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTCGGCTTCTAGGCTGCCTGGGCTCGGAGACGCGCCGCCTCTCGCTGTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGGTCCTGGTGGTCCTCTCCTCTCTTG         GGGAGATGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100751 CTGGTCCTGGTGGTCCTCTCCTCTCTTGGTA...CAGGGGAGATGGCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCCATTCTTTACGGGCCGCCTCACTGACTGGATTCTACAAGATGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101328 TCCATTCTTTACGGGCCGCCTCACTGACTGGATTCTACAAGATGGCTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCGATACCTTCACTCGAAACTTAACTCTCATGTCCATTCTCACCATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101378 CCGATACCTTCACTCGAAACTTAACTCTCATGTCCATTCTCACCATAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AG         TGCAGTGCTGGAGTTCGTGGGTGACGGGATCTATAACAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101428 AGGTC...TAGTGCAGTGCTGGAGTTCGTGGGTGACGGGATCTATAACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CACCATGGGCCACGTGCACAGCCACTTGCAGGGAGAGGTGTTTGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101617 CACCATGGGCCACGTGCACAGCCACTTGCAGGGAGAGGTGTTTGGGGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TCCTGCGCCAGGAGACGGAGTTTTTCCAACAGAACCAGACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101667 TCCTGCGCCAGGAGACGGAGTTTTTCCAACAGAACCAGACAGGTT...CA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1025  GTAACATCATGTCTCGGGTAACAGAGGACACGTCCACCCTGAGTGATTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102667 GGTAACATCATGTCTCGGGTAACAGAGGACACGTCCACCCTGAGTGATTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TCTGAGTGAGAATCTGAGCTTATTTCTGTGGTACCTGGTGCGAGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102717 TCTGAGTGAGAATCTGAGCTTATTTCTGTGGTACCTGGTGCGAGGCCTAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GTCTCTTGGGGATCATGCTCTGGGGATCAGTGTCCCTCACCATGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102767 GTCTCTTGGGGATCATGCTCTGGGGATCAGTGTCCCTCACCATGGTCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CTGATCACCCTGCCTCTGCTTTTCCTTCTGCCCAAGAAGGTGGGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102817 CTGATCACCCTGCCTCTGCTTTTCCTTCTGCCCAAGAAGGTGGGAAAATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GTACCAG         TTGCTGGAAGTGCAGGTGCGGGAATCTCTGGCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102867 GTACCAGGTA...CAGTTGCTGGAAGTGCAGGTGCGGGAATCTCTGGCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AGTCCAGCCAGGTGGCCATTGAGGCTCTGTCGGCCATGCCTACAGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103334 AGTCCAGCCAGGTGGCCATTGAGGCTCTGTCGGCCATGCCTACAGTTCGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AGCTTTGCCAACGAGGAGGGCGAAGCCCAGAAGTTTAGGGAAAAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103384 AGCTTTGCCAACGAGGAGGGCGAAGCCCAGAAGTTTAGGGAAAAGCTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 AGAAATAAAGACACTCAACCAGAAGGAGGCTGTGGCCTATGCAGTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103434 AGAAATAAAGACACTCAACCAGAAGGAGGCTGTGGCCTATGCAGTCAACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CCTGGACCACTAGT         ATTTCAGGTATGCTGCTGAAAGTGGGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103484 CCTGGACCACTAGTGTG...TAGATTTCAGGTATGCTGCTGAAAGTGGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 ATCCTCTACATTGGTGGGCAGCTGGTGACCAGTGGGGCTGTAAGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104726 ATCCTCTACATTGGTGGGCAGCTGGTGACCAGTGGGGCTGTAAGCAGTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 GAACCTTGTCACATTTGTTCTCTACCAGATGCAGTTCACCCAGGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104776 GAACCTTGTCACATTTGTTCTCTACCAGATGCAGTTCACCCAGGCTGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AG         GTACTGCTCTCCATCTACCCCAGAGTACAGAAGGCTGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104826 AGGTG...TAGGTACTGCTCTCCATCTACCCCAGAGTACAGAAGGCTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GGCTCCTCAGAGAAAATATTTGAGTACCTGGACCGCACCCCTCGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105016 GGCTCCTCAGAGAAAATATTTGAGTACCTGGACCGCACCCCTCGCTGCCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 ACCCAGTGGTCTGTTGACTCCCTTACACTTGGAGGGCCTTGTCCAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105066 ACCCAGTGGTCTGTTGACTCCCTTACACTTGGAGGGCCTTGTCCAGTTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 AAGATGTCTCCTTTGCCTACCCAAACCGCCCAGATGTCTTAGTGCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105116 AAGATGTCTCCTTTGCCTACCCAAACCGCCCAGATGTCTTAGTGCTACAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747          GGGCTGACATTCACCCTACGCCCTGGCGAGGTGACGGCGCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105166 GTA...TAGGGGCTGACATTCACCCTACGCCCTGGCGAGGTGACGGCGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 GGTGGGACCCAATGGGTCTGGGAAGAGCACAGTGGCTGCCCTGCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105766 GGTGGGACCCAATGGGTCTGGGAAGAGCACAGTGGCTGCCCTGCTGCAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 ATCTGTACCAGCCCACCGGGGGACAGCTGCTGTTGGATGGGAAGCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105816 ATCTGTACCAGCCCACCGGGGGACAGCTGCTGTTGGATGGGAAGCCCCTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 CCCCAATATGAGCACCGCTACCTGCACAGGCAG         GTGGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105866 CCCCAATATGAGCACCGCTACCTGCACAGGCAGGTA...CAGGTGGCTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 AGTGGGACAAGAGCCACAGGTATTTGGAAGAAGTCTTCAAGAAAATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106150 AGTGGGACAAGAGCCACAGGTATTTGGAAGAAGTCTTCAAGAAAATATTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 CCTATGGCCTGACCCAGAAGCCAACTATGGAGGAAATCACAGCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106200 CCTATGGCCTGACCCAGAAGCCAACTATGGAGGAAATCACAGCTGCTGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 GTAAAGTCTGGGGCCCATAGTTTCATCTCTGGACTCCCTCAGGGCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106250 GTAAAGTCTGGGGCCCATAGTTTCATCTCTGGACTCCCTCAGGGCTATGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 CACAG         AGGTAGACGAGGCTGGGAGCCAGCTGTCAGGGGGTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106300 CACAGGTA...CAGAGGTAGACGAGGCTGGGAGCCAGCTGTCAGGGGGTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 AGCGACAGGCAGTGGCGTTGGCCCGAGCATTGATCCGGAAACCGTGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106649 AGCGACAGGCAGTGGCGTTGGCCCGAGCATTGATCCGGAAACCGTGTGTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 CTTATCCTGGATGATGCCACCAGTGCCCTGGATGCAAACAGCCAGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106699 CTTATCCTGGATGATGCCACCAGTGCCCTGGATGCAAACAGCCAGTTACA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 G         GTGGAGCAGCTCCTGTACGAAAGCCCTGAGCGGTACTCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106749 GGTG...CAGGTGGAGCAGCTCCTGTACGAAAGCCCTGAGCGGTACTCCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 GCTCAGTGCTTCTCATCACCCAGCACCTCAGCCTGGTGGAGCAGGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108072 GCTCAGTGCTTCTCATCACCCAGCACCTCAGCCTGGTGGAGCAGGCTGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 CACATCCTCTTTCTGGAAGGAGGCGCTATCCGGGAGGGGGGAACCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108122 CACATCCTCTTTCTGGAAGGAGGCGCTATCCGGGAGGGGGGAACCCACCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 GCAGCTCATGGAGAAAAAGGGGTGCTACTGGGCCATGGTGCAGGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108172 GCAGCTCATGGAGAAAAAGGGGTGCTACTGGGCCATGGTGCAGGCTCCTG

   2500     .    :
   2411 CAGATGCTCCAGAA
        ||||||||||||||
 108222 CAGATGCTCCAGAA