seq1 = pF1KB5742.tfa, 2223 bp
seq2 = pF1KB5742/gi568815597r_182475395.tfa (gi568815597r:182475395_182686806), 211412 bp

>pF1KB5742 2223
>gi568815597r:182475395_182686806 (Chr1)

(complement)

1-1480  (100001-101480)   99% ->
1481-1566  (102641-102726)   100% ->
1567-1772  (104549-104754)   100% ->
1773-1905  (105450-105582)   100% ->
1906-2039  (110418-110551)   100% ->
2040-2223  (111229-111412)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGCAGGGATCATAACAACCCCCAGGAGGGACCCACGTCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGCAGGGATCATAACAACCCCCAGGAGGGACCCACGTCCTCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGTAGAAGGGCTGCAGTGGAAGACAATCACTTGCTGATTAAAGCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGTAGAAGGGCTGCAGTGGAAGACAATCACTTGCTGATTAAAGCTGTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAACGAAGATGTTGACCTGGTCCAGCAATTGCTGGAAGGTGGAGCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAACGAAGATGTTGACCTGGTCCAGCAATTGCTGGAAGGTGGAGCCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTAATTTCCAGGAAGAGGAAGGGGGCTGGACACCTCTGCATAACGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTAATTTCCAGGAAGAGGAAGGGGGCTGGACACCTCTGCATAACGCAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAAATGAGCAGGGAGGACATTGTGGAACTTCTGCTCCGTCATGGTGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100201 ACAAATGAGCAGGGAGGACATTGTGGAACTTCTGCTTCGTCATGGTGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCCTGTTCTGAGGAAGAAGAATGGGGCCACGCCTTTTATCCTCGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCCTGTTCTGAGGAAGAAGAATGGGGCCACGCCTTTTATCCTCGCAGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTGCGGGGAGCGTGAAGCTGCTGAAACTTTTCCTTTCTAAAGGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTGCGGGGAGCGTGAAGCTGCTGAAACTTTTCCTTTCTAAAGGAGCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTCAATGAGTGTGATTTTTATGGCTTCACAGCCTTCATGGAAGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTCAATGAGTGTGATTTTTATGGCTTCACAGCCTTCATGGAAGCCGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTATGGTAAGGTCAAAGCCCTAAAATTCCTTTATAAGAGAGGAGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTATGGTAAGGTCAAAGCCCTAAAATTCCTTTATAAGAGAGGAGCAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGAATTTGAGGCGAAAGACAAAGGAGGATCAAGAGCGGCTGAGGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGAATTTGAGGCGAAAGACAAAGGAGGATCAAGAGCGGCTGAGGAAAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGGGCCACAGCTCTCATGGACGCTGCTGAAAAAGGACACGTAGAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGGGCCACAGCTCTCATGGACGCTGCTGAAAAAGGACACGTAGAGGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAAGATTCTCCTTGATGAGATGGGGGCAGATGTAAACGCCTGTGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAAGATTCTCCTTGATGAGATGGGGGCAGATGTAAACGCCTGTGACAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGGGCAGAAATGCCTTGATCCATGCTCTCCTGAGCTCTGACGATAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGGGCAGAAATGCCTTGATCCATGCTCTCCTGAGCTCTGACGATAGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTGGAGGCTATTACGCATCTGCTGCTGGACCATGGGGCTGATGTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTGGAGGCTATTACGCATCTGCTGCTGGACCATGGGGCTGATGTCAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAGGGGAGAAAGAGGGAAGACTCCCCTGATCCTGGCAGTGGAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAGGGGAGAAAGAGGGAAGACTCCCCTGATCCTGGCAGTGGAGAAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CACTTGGGTTTGGTGCAGAGGCTTCTGGAGCAAGAGCACATAGAGATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CACTTGGGTTTGGTGCAGAGGCTTCTGGAGCAAGAGCACATAGAGATTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGACACAGACAGTGATGGCAAAACAGCACTGCTGCTTGCTGTTGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGACACAGACAGTGATGGCAAAACAGCACTGCTGCTTGCTGTTGAACTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AACTGAAGAAAATCGCCGAGTTGCTGTGCAAACGTGGAGCCAGTACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AACTGAAGAAAATCGCCGAGTTGCTGTGCAAACGTGGAGCCAGTACAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGTGGGGATCTTGTTATGACAGCGAGGCGGAATTATGACCATTCCCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGTGGGGATCTTGTTATGACAGCGAGGCGGAATTATGACCATTCCCTTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAAGGTTCTTCTCTCTCATGGAGCCAAAGAAGATTTTCACCCTCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAGGTTCTTCTCTCTCATGGAGCCAAAGAAGATTTTCACCCTCCTGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAGACTGGAAGCCTCAGAGCTCACACTGGGGGGCAGCCCTGAAGGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAGACTGGAAGCCTCAGAGCTCACACTGGGGGGCAGCCCTGAAGGATCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CACAGAATATACCGCCCTATGATTGGCAAACTCAAGTTCTTTATTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CACAGAATATACCGCCCTATGATTGGCAAACTCAAGTTCTTTATTGATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AAAATACAAAATTGCTGATACTTCAGAAGGAGGCATCTACCTGGGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AAAATACAAAATTGCTGATACTTCAGAAGGAGGCATCTACCTGGGGTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ATGAGAAGCAAGAAGTAGCTGTGAAGACGTTCTGTGAGGGCAGCCCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ATGAGAAGCAAGAAGTAGCTGTGAAGACGTTCTGTGAGGGCAGCCCACGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCACAGCGGGAAGTCTCTTGTCTGCAAAGCAGCCGAGAGAACAGTCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GCACAGCGGGAAGTCTCTTGTCTGCAAAGCAGCCGAGAGAACAGTCACTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGTGACATTCTATGGGAGTGAGAGCCACAGGGGCCACTTGTTTGTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGTGACATTCTATGGGAGTGAGAGCCACAGGGGCCACTTGTTTGTGTGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TCACCCTCTGTGAGCAGACTCTGGAAGCGTGTTTGGATGTGCACAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TCACCCTCTGTGAGCAGACTCTGGAAGCGTGTTTGGATGTGCACAGAGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GAAGATGTGGAAAATGAGGAAGATGAATTTGCCCGAAATGTCCTGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GAAGATGTGGAAAATGAGGAAGATGAATTTGCCCGAAATGTCCTGTCATC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TATATTTAAGGCTGTTCAAGAACTACACTTGTCCTGTGGATACACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TATATTTAAGGCTGTTCAAGAACTACACTTGTCCTGTGGATACACCCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGGATCTGCAACCACAAAACATCTTAATAG         ATTCTAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101451 AGGATCTGCAACCACAAAACATCTTAATAGGTG...TAGATTCTAAGAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GCTGCTCACCTGGCAGATTTTGATAAGAGCATCAAGTGGGCTGGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102652 GCTGCTCACCTGGCAGATTTTGATAAGAGCATCAAGTGGGCTGGAGATCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 ACAGGAAGTCAAGAGAGATCTAGAG         GACCTTGGACGGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102702 ACAGGAAGTCAAGAGAGATCTAGAGGTA...CAGGACCTTGGACGGCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 TCCTCTATGTGGTAAAGAAGGGAAGCATCTCATTTGAGGATCTGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104565 TCCTCTATGTGGTAAAGAAGGGAAGCATCTCATTTGAGGATCTGAAAGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CAAAGTAATGAAGAGGTGGTTCAACTTTCTCCAGATGAGGAAACTAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104615 CAAAGTAATGAAGAGGTGGTTCAACTTTCTCCAGATGAGGAAACTAAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 CCTCATTCATCGTCTCTTCCATCCTGGGGAACATGTGAGGGACTGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104665 CCTCATTCATCGTCTCTTCCATCCTGGGGAACATGTGAGGGACTGTCTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 GTGACCTGCTGGGTCATCCCTTCTTTTGGACTTGGGAGAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104715 GTGACCTGCTGGGTCATCCCTTCTTTTGGACTTGGGAGAGGTA...CAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CGCTATAGGACGCTTCGGAATGTGGGAAATGAATCCGACATCAAAACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105451 CGCTATAGGACGCTTCGGAATGTGGGAAATGAATCCGACATCAAAACACG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 AAAATCTGAAAGTGAGATCCTCAGACTACTGCAACCTGGGCCTTCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105501 AAAATCTGAAAGTGAGATCCTCAGACTACTGCAACCTGGGCCTTCTGAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 ATTCCAAAAGTTTTGACAAGTGGACGACTAAG         ATTAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105551 ATTCCAAAAGTTTTGACAAGTGGACGACTAAGGTA...TAGATTAATGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 TGTGTTATGAAAAAAATGAATAAGTTTTATGAAAAAAGAGGCAATTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110427 TGTGTTATGAAAAAAATGAATAAGTTTTATGAAAAAAGAGGCAATTTCTA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 CCAGAACACTGTGGGTGATCTGCTAAAGTTCATCCGGAATTTGGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110477 CCAGAACACTGTGGGTGATCTGCTAAAGTTCATCCGGAATTTGGGAGAAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 ACATTGATGAAGAAAAGCATAAAAA         GATGAAATTAAAAATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 110527 ACATTGATGAAGAAAAGCATAAAAAGTA...CAGGATGAAATTAAAAATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 GGAGACCCTTCCCTGTATTTTCAGAAGACATTTCCAGATCTGGTGATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111245 GGAGACCCTTCCCTGTATTTTCAGAAGACATTTCCAGATCTGGTGATCTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 TGTCTACACAAAACTACAGAACACAGAATATAGAAAGCATTTCCCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111295 TGTCTACACAAAACTACAGAACACAGAATATAGAAAGCATTTCCCCCAAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 CCCACAGTCCAAACAAGCCTCAGTGTGATGGAGCTGGTGGGGCCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111345 CCCACAGTCCAAACAAGCCTCAGTGTGATGGAGCTGGTGGGGCCAGTGGG

   2250     .    :    .
   2206 TTGGCCAGCCCTGGGTGC
        ||||||||||||||||||
 111395 TTGGCCAGCCCTGGGTGC