seq1 = pF1KB5730.tfa, 2196 bp
seq2 = pF1KB5730/gi568815591r_142841255.tfa (gi568815591r:142841255_143061873), 220619 bp

>pF1KB5730 2196
>gi568815591r:142841255_143061873 (Chr7)

(complement)

1-81  (100000-100079)   98% ->
82-223  (100373-100514)   100% ->
224-400  (100770-100946)   100% ->
401-525  (103446-103570)   100% ->
526-672  (103901-104047)   100% ->
673-735  (107347-107409)   100% ->
736-924  (107502-107690)   100% ->
925-1073  (107918-108066)   100% ->
1074-1203  (109236-109365)   100% ->
1204-1314  (115557-115667)   100% ->
1315-1413  (117133-117231)   100% ->
1414-1491  (117474-117551)   100% ->
1492-1592  (117991-118091)   100% ->
1593-1703  (118278-118388)   100% ->
1704-1771  (118531-118598)   100% ->
1772-1941  (118830-118999)   100% ->
1942-2037  (119345-119440)   100% ->
2038-2196  (120461-120619)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGGTGGGGACCAAAGTGAGGAAGAGCCGAGGGAACGCAGCCAGGC
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGAAGGTGGGGACCAAAGTGAGGAAGAGCCGAGGGAACGCAGCCAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGTGGAATGGGAACTCTCTGGAGCCAAGAG         AGCACTCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100049 AGGTGGAATGGGAACTCTCTGGAGCCAAGAGGTA...CAGAGCACTCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGAGAGGCTGCCCGTGGAAGGGAGCAGGCCATGGGCAGTGGCCAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100383 AAGAGAGGCTGCCCGTGGAAGGGAGCAGGCCATGGGCAGTGGCCAGGCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGCTGACAGCTATCCTGATTTTGGGCCTGCTCCTTTGTTTTTCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100433 GTGCTGACAGCTATCCTGATTTTGGGCCTGCTCCTTTGTTTTTCTGTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTGTTCTACAACTTCCAGAACTGTGGCCCTC         GCCCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100483 TTTGTTCTACAACTTCCAGAACTGTGGCCCTCGTA...CAGGCCCCTGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGACATCTGTGTGTTTGGATCTCCGGGATCATTACCTGGCCTCTGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100779 AGACATCTGTGTGTTTGGATCTCCGGGATCATTACCTGGCCTCTGGGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAAGTGTGGCCCCCTGCACCGACTTCTTCAGCTTTGCCTGTGGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100829 ACAAGTGTGGCCCCCTGCACCGACTTCTTCAGCTTTGCCTGTGGAAGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAAGAGACCAATAATTCTTTTCAGGAGCTTGCCACAAAGAACAAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100879 CAAAGAGACCAATAATTCTTTTCAGGAGCTTGCCACAAAGAACAAAAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GACTTCGGAGAATACTGG         AGGTCCAGAATTCCTGGCACCCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100929 GACTTCGGAGAATACTGGGTG...TAGAGGTCCAGAATTCCTGGCACCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCTCTGGGGAGGAGAAAGCCTTCCAGTTCTACAACTCCTGCATGGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103469 GGCTCTGGGGAGGAGAAAGCCTTCCAGTTCTACAACTCCTGCATGGATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACTTGCCATTGAAGCTGCAGGGACTGGTCCCCTCAGACAAGTTATTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103519 ACTTGCCATTGAAGCTGCAGGGACTGGTCCCCTCAGACAAGTTATTGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AG         CTTGGAGGCTGGCGCATCTCTGGTAAATGGACTTCCTTA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103569 AGGTG...AAGCTTGGAGGCTGGCGCATCTCTGGTAAATGGACTTCCTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACTTTAACCGAACGCTGAGACTTCTGATGAGTCAGTATGGCCATTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103940 AACTTTAACCGAACGCTGAGACTTCTGATGAGTCAGTATGGCCATTTCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTCTTCAGAGCCTACCTAGGACCTCATCCTGCCTCTCCACACACACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103990 TTTCTTCAGAGCCTACCTAGGACCTCATCCTGCCTCTCCACACACACCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCATCCAG         ATAGACCAGCCAGAGTTTGATGTTCCCCTCAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104040 TCATCCAGGTG...CAGATAGACCAGCCAGAGTTTGATGTTCCCCTCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAAGATCAAGAACAGAAGATCTATGCCCAG         ATCTTTCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 107380 CAAGATCAAGAACAGAAGATCTATGCCCAGGTA...CAGATCTTTCGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ATACCTGACTTACCTGAATCAGCTGGGAACCTTGCTGGGAGGAGACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107513 ATACCTGACTTACCTGAATCAGCTGGGAACCTTGCTGGGAGGAGACCCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCAAGGTGCAAGAACACTCTTCCTTGTCAATCTCCATCACTTCACGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107563 GCAAGGTGCAAGAACACTCTTCCTTGTCAATCTCCATCACTTCACGGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTCCAGTTTCTGAGGCCCCTGGAGCAGCGGCGGGCACAGGGCAAGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107613 TTCCAGTTTCTGAGGCCCCTGGAGCAGCGGCGGGCACAGGGCAAGCTCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCAGATGGTCACTATCGACCAGCTCAAG         GAAATGGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 107663 CCAGATGGTCACTATCGACCAGCTCAAGGTG...AAGGAAATGGCCCCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCATCGACTGGTTGTCCTGCTTGCAAGCGACATTCACACCGATGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107931 CCATCGACTGGTTGTCCTGCTTGCAAGCGACATTCACACCGATGTCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGCCCTTCTCAGTCCCTCGTGGTCCATGACGTGGAATATTTGAAAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107981 AGCCCTTCTCAGTCCCTCGTGGTCCATGACGTGGAATATTTGAAAAACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GTCACAACTGGTGGAGGAGATGCTGCTAAAGCAGAG         GGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 108031 GTCACAACTGGTGGAGGAGATGCTGCTAAAGCAGAGGTT...TAGGGACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TTCTGCAGAGCCACATGATCTTAGGGCTGGTGGTGACCCTTTCTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109241 TTCTGCAGAGCCACATGATCTTAGGGCTGGTGGTGACCCTTTCTCCAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTGGACAGTCAATTCCAGGAGGCACGCAGAAAGCTCAGCCAGAAACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109291 CTGGACAGTCAATTCCAGGAGGCACGCAGAAAGCTCAGCCAGAAACTGCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GGAACTGACAGAGCAACCACCCATG         CCTGCCCGCCCACGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 109341 GGAACTGACAGAGCAACCACCCATGGTG...TAGCCTGCCCGCCCACGAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GGATGAAGTGCGTGGAGGAGACAGGCACGTTCTTCGAGCCCACGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115573 GGATGAAGTGCGTGGAGGAGACAGGCACGTTCTTCGAGCCCACGCTGGCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GCTTTGTTTGTTCGTGAGGCCTTTGGCCCGAGCACCCGAAGTGCT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 115623 GCTTTGTTTGTTCGTGAGGCCTTTGGCCCGAGCACCCGAAGTGCTGTA..

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315     GCCATGAAATTATTCACTGCGATCCGGGATGCCCTCATCACTCGCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115673 .CAGGCCATGAAATTATTCACTGCGATCCGGGATGCCCTCATCACTCGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TCAGAAACCTTCCCTGGATGAATGAGGAGACCCAGAACATGGCCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117179 TCAGAAACCTTCCCTGGATGAATGAGGAGACCCAGAACATGGCCCAGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AAG         GTTGCTCAACTGCAGGTGGAGATGGGGGCTTCAGAATG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117229 AAGGTC...CAGGTTGCTCAACTGCAGGTGGAGATGGGGGCTTCAGAATG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGCCCTGAAGCCAGAGCTGGCCCGACAAGAATACAACGAT         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 117512 GGCCCTGAAGCCAGAGCTGGCCCGACAAGAATACAACGATGTG...CAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TACAGCTTGGATCGAGCTTCCTGCAGTCTGTCCTGAGCTGTGTCCGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117992 TACAGCTTGGATCGAGCTTCCTGCAGTCTGTCCTGAGCTGTGTCCGGTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CTCCGAGCTAGAATTGTCCAGAGCTTCTTGCAGCCTCACCCCCAACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118042 CTCCGAGCTAGAATTGTCCAGAGCTTCTTGCAGCCTCACCCCCAACACAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593          GTGGAAGGTGTCCCCTTGGGACGTCAATGCTTACTATTCGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118092 GTA...CAGGTGGAAGGTGTCCCCTTGGGACGTCAATGCTTACTATTCGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TATCTGACCATGTGGTAGTCTTTCCAGCTGGACTCCTCCAACCCCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118319 TATCTGACCATGTGGTAGTCTTTCCAGCTGGACTCCTCCAACCCCCATTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TTCCACCCTGGCTATCCCAG         AGCCGTGAACTTTGGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118369 TTCCACCCTGGCTATCCCAGGTA...TAGAGCCGTGAACTTTGGCGCTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TGGCAGCATCATGGCCCACGAGCTGTTGCACATCTTCTACCAGCTCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 118552 TGGCAGCATCATGGCCCACGAGCTGTTGCACATCTTCTACCAGCTCTGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1772       TACTGCCTGGGGGCTGCCTCGCCTGTGACAACCATGCCCTCCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118602 ...CAGTACTGCCTGGGGGCTGCCTCGCCTGTGACAACCATGCCCTCCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GAAGCTCACCTGTGCCTGAAGCGCCATTATGCTGCCTTTCCATTACCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118874 GAAGCTCACCTGTGCCTGAAGCGCCATTATGCTGCCTTTCCATTACCTAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CAGAACCTCCTTCAATGACTCCCTCACATTCTTAGAGAATGCTGCAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118924 CAGAACCTCCTTCAATGACTCCCTCACATTCTTAGAGAATGCTGCAGACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TTGGGGGGCTAGCCATCGCGCTGCAG         GCATACAGCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 118974 TTGGGGGGCTAGCCATCGCGCTGCAGGTA...CAGGCATACAGCAAGAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CTGTTACGGCACCATGGGGAGACTGTCCTGCCCAGCCTGGACCTCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119360 CTGTTACGGCACCATGGGGAGACTGTCCTGCCCAGCCTGGACCTCAGCCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CCAGCAGATCTTCTTTCGAAGCTATGCCCAG         GTGATGTGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 119410 CCAGCAGATCTTCTTTCGAAGCTATGCCCAGGTA...CAGGTGATGTGTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 GGAAGCCCAGCCCCCAGGACTCTCACGACACTCACAGCCCTCCACACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120471 GGAAGCCCAGCCCCCAGGACTCTCACGACACTCACAGCCCTCCACACCTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CGAGTCCACGGGCCCCTCAGCAGCACCCCAGCCTTTGCCAGGTATTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120521 CGAGTCCACGGGCCCCTCAGCAGCACCCCAGCCTTTGCCAGGTATTTCCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2148 CTGTGCACGTGGTGCTCTCTTGAACCCCTCCAGCCGCTGCCAGCTCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120571 CTGTGCACGTGGTGCTCTCTTGAACCCCTCCAGCCGCTGCCAGCTCTGG