seq1 = pF1KB5714.tfa, 2163 bp
seq2 = pF1KB5714/gi568815582r_56384764.tfa (gi568815582r:56384764_56619862), 235099 bp

>pF1KB5714 2163
>gi568815582r:56384764_56619862 (Chr16)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-349  (105183-105414)   98% ->
350-471  (108583-108704)   100% ->
472-534  (108942-109004)   100% ->
535-612  (109829-109906)   100% ->
613-717  (113639-113743)   100% ->
718-804  (113827-113913)   100% ->
805-940  (117055-117190)   100% ->
941-1080  (117407-117546)   100% ->
1081-1225  (118366-118510)   100% ->
1226-1397  (118838-119009)   100% ->
1398-1527  (119956-120085)   100% ->
1528-1659  (121295-121426)   100% ->
1660-1797  (121983-122120)   100% ->
1798-1910  (122784-122896)   100% ->
1911-2059  (134125-134273)   100% ->
2060-2163  (134996-135099)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCTGCCTGTGTTCACCCTGAAACTGCGCCACAAAATCAGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCTGCCTGTGTTCACCCTGAAACTGCGCCACAAAATCAGCCCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATGGTGGCCATAGGGCGCTACGACGGGACTCACCCGTGCCTGGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATGGTGGCCATAGGGCGCTACGACGGGACTCACCCGTGCCTGGCGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACCCAAACGGGCAAG         GTTTTTATTCATAATCCTCATACA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACCCAAACGGGCAAGGTA...CAGGTTTTTATTCATAATCCTCATACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGAACCAGCATGTCAGTGCATCCAGGGTCTTCCAGAGCCCCCTGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105207 CGGAACCAGCATGTCAGTGCATCCAGGGTCTTCCAGAGCCCCCTGGAATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGATGTTTCTCTTCTCAACATTAACCAGGCAGTCAGCTGTCTGACTGCAG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 105257 TGATGTTTCTCTTCTCAGCATTAACCAGGCAGTCAGCTGTCTGACTGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCGTATTGAACCCTGAGCTTGGCTATGATGCCCTTTTAGTGGGGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105307 GCGTATTGAACCCTGAGCTTGGCTATGATGCCCTTTTAGTGGGGACACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACTAATCTTTTGGCTTATGATGTCTACAATAATTCGGATTTGTTCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105357 ACTAATCTTTTGGCTTATGATGTCTACAATAATTCGGATTTGTTCTACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGAGGTAG         CAGATGGGGCAAATGCAATTGTGCTGGGGACAT
        ||||| | >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105407 AGAGGCAAGTA...TAGCAGATGGGGCAAATGCAATTGTGCTGGGGACAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGGAGACATTTCTTCCCCTCTTGCGATTATTGGTGGCAATTGTGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108616 TGGGAGACATTTCTTCCCCTCTTGCGATTATTGGTGGCAATTGTGCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAAGGTTTCAATCATGAAGGAAGTGATCTCTTTTGGACG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108666 CAAGGTTTCAATCATGAAGGAAGTGATCTCTTTTGGACGGTA...CAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TACTGGAGACAATGTTAATTCCTTGGCCTTGTGTGACTTTGATGGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108944 TACTGGAGACAATGTTAATTCCTTGGCCTTGTGTGACTTTGATGGTGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAAAGAAAGAG         CTTCTTGTTGGATCTGAGGATTTTGATATC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 108994 GAAAGAAAGAGGTA...CAGCTTCTTGTTGGATCTGAGGATTTTGATATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGAGTTTTTAAGGAAGATGAGATTGTGGCAGAAATGACAGAAACAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 109859 CGAGTTTTTAAGGAAGATGAGATTGTGGCAGAAATGACAGAAACAGAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    613        ATAGTCACCTCTCTTTGTCCCATGTATGGCAGTCGATTTGGTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109909 A...CAGATAGTCACCTCTCTTTGTCCCATGTATGGCAGTCGATTTGGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGCCCTTTCCAATGGCACAGTTGGAGTTTATGACAAAACATCCCGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113682 ATGCCCTTTCCAATGGCACAGTTGGAGTTTATGACAAAACATCCCGATAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGGAGAATTAAA         TCGAAAAATCATGCCATGAGCATTCATGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113732 TGGAGAATTAAAGTT...CAGTCGAAAAATCATGCCATGAGCATTCATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TTTTGACCTTAATTCTGATGGAGTGAATGAACTGATAACTGGTTGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113856 TTTTGACCTTAATTCTGATGGAGTGAATGAACTGATAACTGGTTGGTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATGGGAAG         GTTGATGCTCGAAGTGACCGAACTGGGGAGGTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 113906 ATGGGAAGGTA...TAGGTTGATGCTCGAAGTGACCGAACTGGGGAGGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATCTTTAAGGACAATTTTTCTTCTGCAATTGCCGGTGTGGTAGAGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117088 ATCTTTAAGGACAATTTTTCTTCTGCAATTGCCGGTGTGGTAGAGGGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TTACCGGATGGATGGCCACATACAGTTAATCTGCTGCTCAGTGGATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117138 TTACCGGATGGATGGCCACATACAGTTAATCTGCTGCTCAGTGGATGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAA         TCCGGGGCTACCTGCCTGGCACGGCTGAGATGAGGGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117188 AAAGTA...CAGTCCGGGGCTACCTGCCTGGCACGGCTGAGATGAGGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AACCTCATGGACACCAGTGCAGAGCAGGACCTGATCCGAGAGCTGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117445 AACCTCATGGACACCAGTGCAGAGCAGGACCTGATCCGAGAGCTGAGTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GAAGAAGCAGAATCTGTTGCTGGAACTCCGTAACTATGAGGAAAATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117495 GAAGAAGCAGAATCTGTTGCTGGAACTCCGTAACTATGAGGAAAATGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AG         GCTGAATTGGCCAGTCCACTGAACGAGGCTGATGGGCAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117545 AGGTA...CAGGCTGAATTGGCCAGTCCACTGAACGAGGCTGATGGGCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CGGGGCATAATCCCAGCCAATACCAGGCTCCACACCACGCTCTCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118405 CGGGGCATAATCCCAGCCAATACCAGGCTCCACACCACGCTCTCAGTCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCTGGGGAATGAGACCCAAACTGCTCATACAGAATTACGCATTTCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118455 CCTGGGGAATGAGACCCAAACTGCTCATACAGAATTACGCATTTCCACTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CTAATG         ACACCATCATCCGAGCAGTATTGATTTTTGCAGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118505 CTAATGGTA...CAGACACCATCATCCGAGCAGTATTGATTTTTGCAGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGAATTTTTACAGGTGAAAGCCACGTGGTACATCCCAGCATTCACAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118873 GGAATTTTTACAGGTGAAAGCCACGTGGTACATCCCAGCATTCACAACCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTCCAGTTCCATCTGCATCCCTATTGTGCCTCCCAAAGATGTCCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118923 CTCCAGTTCCATCTGCATCCCTATTGTGCCTCCCAAAGATGTCCCTGTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATCTGCACTTGAAGGCATTCGTGGGTTACAGAAGCAG         CACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118973 ATCTGCACTTGAAGGCATTCGTGGGTTACAGAAGCAGGTG...TAGCACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CAGTTTCATGTATTTGAATCGACAAGACAGCTCCCTCGATTCTCCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119960 CAGTTTCATGTATTTGAATCGACAAGACAGCTCCCTCGATTCTCCATGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGCGCTGACCAGCCTGGACCCTGCCAGTGAGCCAATCAGTTATGTTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120010 TGCGCTGACCAGCCTGGACCCTGCCAGTGAGCCAATCAGTTATGTTAACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TTACCATTGCAGAACGGGCACAGAGG         GTTGTTGTATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 120060 TTACCATTGCAGAACGGGCACAGAGGGTG...AAGGTTGTTGTATGGCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GGTCAGAACTTTCTGTTACCAGAAGACACTCACATTCAGAATGCTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121310 GGTCAGAACTTTCTGTTACCAGAAGACACTCACATTCAGAATGCTCCATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TCAAGTGTGTTTCACATCTTTACGGAATGGCGGCCACCTGCATATAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121360 TCAAGTGTGTTTCACATCTTTACGGAATGGCGGCCACCTGCATATAAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TAAAACTTAGTGGAGAG         ATCACTATAAATACTGATGATATT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 121410 TAAAACTTAGTGGAGAGGTA...TAGATCACTATAAATACTGATGATATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GATTTGGCTGGTGATATCATCCAGTCAATGGCATCATTTTTTGCTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122007 GATTTGGCTGGTGATATCATCCAGTCAATGGCATCATTTTTTGCTATTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AGACCTTCAAGTAGAAGCGGATTTTCCTGTCTATTTTGAGGAATTACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122057 AGACCTTCAAGTAGAAGCGGATTTTCCTGTCTATTTTGAGGAATTACGAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AGGTGCTAGTTAAG         GTGGATGAATATCATTCAGTGCATCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 122107 AGGTGCTAGTTAAGGTG...CAGGTGGATGAATATCATTCAGTGCATCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 AAGCTCAGTGCTGATATGGCTGATCATTCTAATTTGATCCGAAGTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122811 AAGCTCAGTGCTGATATGGCTGATCATTCTAATTTGATCCGAAGTTTGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GGTCGGAGCTGAGGATGCTCGTCTGATGAGGGACAT         GAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 122861 GGTCGGAGCTGAGGATGCTCGTCTGATGAGGGACATGTG...CAGGAAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CAATGAAGAGTCGTTATATGGAACTCTATGACCTTAATAGAGACTTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134130 CAATGAAGAGTCGTTATATGGAACTCTATGACCTTAATAGAGACTTGCTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AATGGATATAAAATTCGCTGTAACAATCACACAGAGCTGTTGGGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134180 AATGGATATAAAATTCGCTGTAACAATCACACAGAGCTGTTGGGAAACCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CAAAGCAGTAAATCAAGCAATTCAAAGAGCAGGTCGTCTGCGGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 134230 CAAAGCAGTAAATCAAGCAATTCAAAGAGCAGGTCGTCTGCGGGGTA...

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2060    TTGGAAAACCAAAGAACCAGGTGATCACTGCTTGTCGGGATGCAATT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134993 CAGTTGGAAAACCAAAGAACCAGGTGATCACTGCTTGTCGGGATGCAATT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CGAAGCAATAACATCAACACACTGTTCAAAATCATGCGAGTGGGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135043 CGAAGCAATAACATCAACACACTGTTCAAAATCATGCGAGTGGGGACAGC

   2300     .
   2157 TTCTTCC
        |||||||
 135093 TTCTTCC