seq1 = pF1KB5694.tfa, 1938 bp
seq2 = pF1KB5694/gi568815587r_119210348.tfa (gi568815587r:119210348_119417101), 206754 bp

>pF1KB5694 1938
>gi568815587r:119210348_119417101 (Chr11)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-192  (101839-101963)   100% ->
193-400  (102062-102269)   99% ->
401-471  (102353-102423)   100% ->
472-559  (102526-102613)   100% ->
560-739  (104153-104332)   100% ->
740-861  (104454-104575)   100% ->
862-1024  (104674-104836)   100% ->
1025-1143  (104932-105050)   100% ->
1144-1285  (105153-105294)   100% ->
1286-1407  (105451-105572)   100% ->
1408-1549  (105681-105822)   100% ->
1550-1645  (105917-106012)   100% ->
1646-1793  (106199-106346)   100% ->
1794-1911  (106636-106753)   100% ->
1912-1938  (107187-107213)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTTCCCAGGCTGGTCTGCGCCTTCTTGCTCGCCGCCTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTTCCCAGGCTGGTCTGCGCCTTCTTGCTCGCCGCCTGCTGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTCCTCGCGTCGCGG         GTGTGCCCGGAGAGGCTGAGCAGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTCCTCGCGTCGCGGGTG...CAGGTGTGCCCGGAGAGGCTGAGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGCGCCTGAGCTGGTGGAGGTGGAAGTGGGCAGCACAGCCCTTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101863 CTGCGCCTGAGCTGGTGGAGGTGGAAGTGGGCAGCACAGCCCTTCTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCGGCCTCTCCCAGTCCCAAGGCAACCTCAGCCATGTCGACTGGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101913 TGCGGCCTCTCCCAGTCCCAAGGCAACCTCAGCCATGTCGACTGGTTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 T         GTCCACAAGGAGAAGCGGACGCTCATCTTCCGTGTGCGCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101963 TGTG...TAGGTCCACAAGGAGAAGCGGACGCTCATCTTCCGTGTGCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGGCCAGGGCCAGAGCGAACCTGGGGAGTACGGGCAGCGGCTCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 102102 AGGGCCAGGGCCAGAGCGAACCTGGGGAGTACGAGCAGCGGCTCAGCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGGACAGAGGGGCTACTCTGGCCCTGACTCAAGTCACCCCCCAAGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102152 CAGGACAGAGGGGCTACTCTGGCCCTGACTCAAGTCACCCCCCAAGACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCGCATCTTCTTGTGCCAGGGCAAGCGCCCTCGGTCCCAGGAGTACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102202 GCGCATCTTCTTGTGCCAGGGCAAGCGCCCTCGGTCCCAGGAGTACCGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCCAGCTCCGCGTCTACA         AAGCTCCGGAGGAGCCAAACATC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102252 TCCAGCTCCGCGTCTACAGTG...TAGAAGCTCCGGAGGAGCCAAACATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGGTCAACCCCCTGGGCATCCCTGTGAACAGTAAGGAGCCTGAGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102376 CAGGTCAACCCCCTGGGCATCCCTGTGAACAGTAAGGAGCCTGAGGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472        GTCGCTACCTGTGTAGGGAGGAACGGGTACCCCATTCCTCAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102426 G...TAGGTCGCTACCTGTGTAGGGAGGAACGGGTACCCCATTCCTCAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCATCTGGTACAAGAATGGCCGGCCTCTGAAGGAGGAGAAGAACC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102569 TCATCTGGTACAAGAATGGCCGGCCTCTGAAGGAGGAGAAGAACCGTG..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    560     GGGTCCACATTCAGTCGTCCCAGACTGTGGAGTCGAGTGGTTTGTA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102619 .CAGGGGTCCACATTCAGTCGTCCCAGACTGTGGAGTCGAGTGGTTTGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CACCTTGCAGAGTATTCTGAAGGCACAGCTGGTTAAAGAAGACAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104199 CACCTTGCAGAGTATTCTGAAGGCACAGCTGGTTAAAGAAGACAAAGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCCAGTTTTACTGTGAGCTCAACTACCGGCTGCCCAGTGGGAACCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104249 CCCAGTTTTACTGTGAGCTCAACTACCGGCTGCCCAGTGGGAACCACATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGGAGTCCAGGGAAGTCACCGTCCCTGTTTTCT         ACCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104299 AAGGAGTCCAGGGAAGTCACCGTCCCTGTTTTCTGTG...CAGACCCGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGAAAAAGTGTGGCTGGAAGTGGAGCCCGTGGGAATGCTGAAGGAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104461 AGAAAAAGTGTGGCTGGAAGTGGAGCCCGTGGGAATGCTGAAGGAAGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACCGCGTGGAAATCAGGTGTTTGGCTGATGGCAACCCTCCACCACACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104511 ACCGCGTGGAAATCAGGTGTTTGGCTGATGGCAACCCTCCACCACACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGCATCAGCAAGCAG         AACCCCAGCACCAGGGAGGCAGAGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104561 AGCATCAGCAAGCAGGTG...TAGAACCCCAGCACCAGGGAGGCAGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGAGACAACCAACGACAACGGGGTCCTGGTGCTGGAGCCTGCCCGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104700 AGAGACAACCAACGACAACGGGGTCCTGGTGCTGGAGCCTGCCCGGAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AACACAGTGGGCGCTATGAATGTCAGGGCCTGGACTTGGACACCATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104750 AACACAGTGGGCGCTATGAATGTCAGGGCCTGGACTTGGACACCATGATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCGCTGCTGAGTGAACCACAGGAACTACTGGTGAACT         ATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 104800 TCGCTGCTGAGTGAACCACAGGAACTACTGGTGAACTGTG...CAGATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GTCTGACGTCCGAGTGAGTCCCGCAGCCCCTGAGAGACAGGAAGGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104936 GTCTGACGTCCGAGTGAGTCCCGCAGCCCCTGAGAGACAGGAAGGCAGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCCTCACCCTGACCTGTGAGGCAGAGAGTAGCCAGGACCTCGAGTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104986 GCCTCACCCTGACCTGTGAGGCAGAGAGTAGCCAGGACCTCGAGTTCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TGGCTGAGAGAAGAG         ACAGGCCAGGTGCTGGAAAGGGGGCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105036 TGGCTGAGAGAAGAGGTA...CAGACAGGCCAGGTGCTGGAAAGGGGGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGTGCTTCAGTTGCATGACCTGAAACGGGAGGCAGGAGGCGGCTATCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105179 TGTGCTTCAGTTGCATGACCTGAAACGGGAGGCAGGAGGCGGCTATCGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCGTGGCGTCTGTGCCCAGCATACCCGGCCTGAACCGCACACAGCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105229 GCGTGGCGTCTGTGCCCAGCATACCCGGCCTGAACCGCACACAGCTGGTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AACGTGGCCATTTTTG         GCCCCCCTTGGATGGCATTCAAGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105279 AACGTGGCCATTTTTGGTG...AAGGCCCCCCTTGGATGGCATTCAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GAGGAAGGTGTGGGTGAAAGAGAATATGGTGTTGAATCTGTCTTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105476 GAGGAAGGTGTGGGTGAAAGAGAATATGGTGTTGAATCTGTCTTGTGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CGTCAGGGCACCCCCGGCCCACCATCTCCTGGAACGTCAACGGCACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105526 CGTCAGGGCACCCCCGGCCCACCATCTCCTGGAACGTCAACGGCACGGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1408       GCAAGTGAACAAGACCAAGATCCACAGCGAGTCCTGAGCACCCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105576 ...CAGGCAAGTGAACAAGACCAAGATCCACAGCGAGTCCTGAGCACCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GAATGTCCTCGTGACCCCGGAGCTGTTGGAGACAGGTGTTGAATGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105725 GAATGTCCTCGTGACCCCGGAGCTGTTGGAGACAGGTGTTGAATGCACGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCTCCAACGACCTGGGCAAAAACACCAGCATCCTCTTCCTGGAGCTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105775 CCTCCAACGACCTGGGCAAAAACACCAGCATCCTCTTCCTGGAGCTGGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1550        TCAATTTAACCACCCTCACACCAGACTCCAACACAACCACTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105825 G...TAGTCAATTTAACCACCCTCACACCAGACTCCAACACAACCACTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CCTCAGCACTTCCACTGCCAGTCCTCATACCAGAGCCAACAGCACCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105960 CCTCAGCACTTCCACTGCCAGTCCTCATACCAGAGCCAACAGCACCTCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CAG         AGAGAAAGCTGCCGGAGCCGGAGAGCCGGGGCGTGGTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106010 CAGGTA...CAGAGAGAAAGCTGCCGGAGCCGGAGAGCCGGGGCGTGGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ATCGTGGCTGTGATTGTGTGCATCCTGGTCCTGGCGGTGCTGGGCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106237 ATCGTGGCTGTGATTGTGTGCATCCTGGTCCTGGCGGTGCTGGGCGCTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CCTCTATTTCCTCTATAAGAAGGGCAAGCTGCCGTGCAGGCGCTCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106287 CCTCTATTTCCTCTATAAGAAGGGCAAGCTGCCGTGCAGGCGCTCAGGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AGCAGGAGAT         CACGCTACCCCCGTCTCGTAAGAGCGAACTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106337 AGCAGGAGATGTA...CAGCACGCTACCCCCGTCTCGTAAGAGCGAACTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GTAGTTGAAGTTAAGTCAGATAAGCTCCCAGAAGAGATGGGCCTCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106667 GTAGTTGAAGTTAAGTCAGATAAGCTCCCAGAAGAGATGGGCCTCCTGCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GGGCAGCAGCGGTGACAAGAGGGCTCCGGGAGACCAG         GGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 106717 GGGCAGCAGCGGTGACAAGAGGGCTCCGGGAGACCAGGTA...TAGGGAG

   2050     .    :    .    :
   1916 AGAAATACATCGATCTGAGGCAT
        |||||||||||||||||||||||
 107191 AGAAATACATCGATCTGAGGCAT