seq1 = pF1KB5684.tfa, 1686 bp
seq2 = pF1KB5684/gi568815590r_42075996.tfa (gi568815590r:42075996_42293185), 217190 bp

>pF1KB5684 1686
>gi568815590r:42075996_42293185 (Chr8)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-115  (101772-101814)   100% ->
116-253  (104115-104252)   100% ->
254-364  (105170-105280)   100% ->
365-539  (105614-105788)   99% ->
540-631  (108014-108105)   100% ->
632-803  (110296-110467)   100% ->
804-889  (111164-111249)   100% ->
890-1085  (112501-112696)   100% ->
1086-1222  (112808-112944)   100% ->
1223-1363  (113120-113260)   100% ->
1364-1530  (114123-114289)   100% ->
1531-1686  (117035-117190)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGCAATGAAGAGAGGGCTCTGCTGTGTGCTGCTGCTGTGTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGCAATGAAGAGAGGGCTCTGCTGTGTGCTGCTGCTGTGTGGAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTCTTCGTTTCGCCCAGCCAG         GAAATCCATGCCCGATTCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 AGTCTTCGTTTCGCCCAGCCAGGTT...CAGGAAATCCATGCCCGATTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAAGAGGAGCCAGATCTTACCAAG         TGATCTGCAGAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101791 GAAGAGGAGCCAGATCTTACCAAGGTC...TAGTGATCTGCAGAGATGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAAACGCAGATGATATACCAGCAACATCAGTCATGGCTGCGCCCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104132 AAAACGCAGATGATATACCAGCAACATCAGTCATGGCTGCGCCCTGTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGAAGCAACCGGGTGGAATATTGCTGGTGCAACAGTGGCAGGGCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104182 CAGAAGCAACCGGGTGGAATATTGCTGGTGCAACAGTGGCAGGGCACAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCACTCAGTGCCTGTCAAAA         GTTGCAGCGAGCCAAGGTGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104232 GCCACTCAGTGCCTGTCAAAAGTA...CAGGTTGCAGCGAGCCAAGGTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTCAACGGGGGCACCTGCCAGCAGGCCCTGTACTTCTCAGATTTCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105190 TTCAACGGGGGCACCTGCCAGCAGGCCCTGTACTTCTCAGATTTCGTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAGTGCCCCGAAGGATTTGCTGGGAAGTGCTGTGAAATAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105240 CCAGTGCCCCGAAGGATTTGCTGGGAAGTGCTGTGAAATAGGTG...CAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATACCAGGGCCACGTGCTACGAGGACCAGGGCATCAGCTACAGGGGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105614 ATACCAGGGCCACGTGCTACGAGGACCAGGGCATCAGCTACAGGGGCACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGGAGCACAGCGGAGAGTGGCGCCGAGTGCACCAACTGGAACAGCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105664 TGGAGCACAGCGGAGAGTGGCGCCGAGTGCACCAACTGGAACAGCAGCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTTGGCCCAGAAGCCCTACAGCGGGCGGAGGCCAGATGCCATCAGGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 105714 GTTGGCCCAGAAGCCCTACAGCGGGCGGAGGCCAGACGCCATCAGGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCCTGGGGAACCACAACTACTGCAG         AAACCCAGATCGAGAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105764 GCCTGGGGAACCACAACTACTGCAGGTG...CAGAAACCCAGATCGAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCAAAGCCCTGGTGCTACGTCTTTAAGGCGGGGAAGTACAGCTCAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108030 TCAAAGCCCTGGTGCTACGTCTTTAAGGCGGGGAAGTACAGCTCAGAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTGCAGCACCCCTGCCTGCTCTGAGG         GAAACAGTGACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108080 CTGCAGCACCCCTGCCTGCTCTGAGGGTA...TAGGAAACAGTGACTGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACTTTGGGAATGGGTCAGCCTACCGTGGCACGCACAGCCTCACCGAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110311 ACTTTGGGAATGGGTCAGCCTACCGTGGCACGCACAGCCTCACCGAGTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGTGCCTCCTGCCTCCCGTGGAATTCCATGATCCTGATAGGCAAGGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110361 GGTGCCTCCTGCCTCCCGTGGAATTCCATGATCCTGATAGGCAAGGTTTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CACAGCACAGAACCCCAGTGCCCAGGCACTGGGCCTGGGCAAACATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110411 CACAGCACAGAACCCCAGTGCCCAGGCACTGGGCCTGGGCAAACATAATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACTGCCG         GAATCCTGATGGGGATGCCAAGCCCTGGTGCCAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110461 ACTGCCGGTA...TAGGAATCCTGATGGGGATGCCAAGCCCTGGTGCCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTGCTGAAGAACCGCAGGCTGACGTGGGAGTACTGTGATGTGCCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111198 GTGCTGAAGAACCGCAGGCTGACGTGGGAGTACTGTGATGTGCCCTCCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CT         CCACCTGCGGCCTGAGACAGTACAGCCAGCCTCAGTTTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111248 CTGTA...CAGCCACCTGCGGCCTGAGACAGTACAGCCAGCCTCAGTTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCATCAAAGGAGGGCTCTTCGCCGACATCGCCTCCCACCCCTGGCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112540 GCATCAAAGGAGGGCTCTTCGCCGACATCGCCTCCCACCCCTGGCAGGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCCATCTTTGCCAAGCACAGGAGGTCGCCCGGAGAGCGGTTCCTGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112590 GCCATCTTTGCCAAGCACAGGAGGTCGCCCGGAGAGCGGTTCCTGTGCGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGGCATACTCATCAGCTCCTGCTGGATTCTCTCTGCCGCCCACTGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112640 GGGCATACTCATCAGCTCCTGCTGGATTCTCTCTGCCGCCCACTGCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGGAGAG         GTTTCCGCCCCACCACCTGACGGTGATCTTGGGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112690 AGGAGAGGTA...CAGGTTTCCGCCCCACCACCTGACGGTGATCTTGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AGAACATACCGGGTGGTCCCTGGCGAGGAGGAGCAGAAATTTGAAGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112842 AGAACATACCGGGTGGTCCCTGGCGAGGAGGAGCAGAAATTTGAAGTCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AAAATACATTGTCCATAAGGAATTCGATGATGACACTTACGACAATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112892 AAAATACATTGTCCATAAGGAATTCGATGATGACACTTACGACAATGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TTG         CGCTGCTGCAGCTGAAATCGGATTCGTCCCGCTGTGCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112942 TTGGTA...CAGCGCTGCTGCAGCTGAAATCGGATTCGTCCCGCTGTGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CAGGAGAGCAGCGTGGTCCGCACTGTGTGCCTTCCCCCGGCGGACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113158 CAGGAGAGCAGCGTGGTCCGCACTGTGTGCCTTCCCCCGGCGGACCTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GCTGCCGGACTGGACGGAGTGTGAGCTCTCCGGCTACGGCAAGCATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113208 GCTGCCGGACTGGACGGAGTGTGAGCTCTCCGGCTACGGCAAGCATGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CCT         TGTCTCCTTTCTATTCGGAGCGGCTGAAGGAGGCTCAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113258 CCTGTA...CAGTGTCTCCTTTCTATTCGGAGCGGCTGAAGGAGGCTCAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTCAGACTGTACCCATCCAGCCGCTGCACATCACAACATTTACTTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114161 GTCAGACTGTACCCATCCAGCCGCTGCACATCACAACATTTACTTAACAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AACAGTCACCGACAACATGCTGTGTGCTGGAGACACTCGGAGCGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114211 AACAGTCACCGACAACATGCTGTGTGCTGGAGACACTCGGAGCGGCGGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCCAGGCAAACTTGCACGACGCCTGCCAG         GGCGATTCGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114261 CCCAGGCAAACTTGCACGACGCCTGCCAGGTA...CAGGGCGATTCGGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GGCCCCCTGGTGTGTCTGAACGATGGCCGCATGACTTTGGTGGGCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117047 GGCCCCCTGGTGTGTCTGAACGATGGCCGCATGACTTTGGTGGGCATCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CAGCTGGGGCCTGGGCTGTGGACAGAAGGATGTCCCGGGTGTGTACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117097 CAGCTGGGGCCTGGGCTGTGGACAGAAGGATGTCCCGGGTGTGTACACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGGTTACCAACTACCTAGACTGGATTCGTGACAACATGCGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117147 AGGTTACCAACTACCTAGACTGGATTCGTGACAACATGCGACCG