seq1 = pF1KB5676.tfa, 2418 bp
seq2 = pF1KB5676/gi568815589r_34957120.tfa (gi568815589r:34957120_35168362), 211243 bp

>pF1KB5676 2418
>gi568815589r:34957120_35168362 (Chr9)

(complement)

1-17  (96010-96026)   100% ->
18-129  (100001-100112)   100% ->
130-302  (100300-100472)   100% ->
303-445  (101546-101688)   100% ->
446-576  (102982-103112)   100% ->
577-708  (104078-104209)   100% ->
709-811  (105283-105385)   100% ->
812-945  (106013-106146)   100% ->
946-1081  (106225-106360)   100% ->
1082-1194  (106674-106786)   100% ->
1195-1359  (107184-107348)   100% ->
1360-1482  (107440-107562)   100% ->
1483-1695  (107838-108050)   100% ->
1696-2004  (108562-108870)   100% ->
2005-2160  (109144-109299)   100% ->
2161-2315  (110833-110987)   100% ->
2316-2418  (111141-111243)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCTGGAGCCGA         TTCAAAAGGTGATGACCTATCAAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
  96010 ATGGCTTCTGGAGCCGAGTG...TAGTTCAAAAGGTGATGACCTATCAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGCCATTCTCAAACAGAAGAACCGTCCCAATCGGTTAATTGTTGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100025 AGCCATTCTCAAACAGAAGAACCGTCCCAATCGGTTAATTGTTGATGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATCAATGAGGACAACAGTGTGGTGTCCTTGTCCCAG         CCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100075 CCATCAATGAGGACAACAGTGTGGTGTCCTTGTCCCAGGTA...CAGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAGATGGATGAATTGCAGTTGTTCCGAGGTGACACAGTGTTGCTGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100303 AAGATGGATGAATTGCAGTTGTTCCGAGGTGACACAGTGTTGCTGAAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAAGAAGAGACGAGAAGCTGTTTGCATCGTCCTTTCTGATGATACTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100353 AAAGAAGAGACGAGAAGCTGTTTGCATCGTCCTTTCTGATGATACTTGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGATGAGAAGATTCGGATGAATAGAGTTGTTCGGAATAACCTTCGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100403 CTGATGAGAAGATTCGGATGAATAGAGTTGTTCGGAATAACCTTCGTGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGCCTAGGGGATGTCATCAG         CATCCAGCCATGCCCTGATGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100453 CGCCTAGGGGATGTCATCAGGTG...CAGCATCCAGCCATGCCCTGATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAGTACGGCAAACGTATCCATGTGCTGCCCATTGATGACACAGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101567 GAAGTACGGCAAACGTATCCATGTGCTGCCCATTGATGACACAGTGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCATTACTGGTAATCTCTTCGAGGTATACCTTAAGCCGTACTTCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101617 GCATTACTGGTAATCTCTTCGAGGTATACCTTAAGCCGTACTTCCTGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCGTATCGACCCATCCGGAAAG         GAGACATTTTTCTTGTCCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101667 GCGTATCGACCCATCCGGAAAGGTG...CAGGAGACATTTTTCTTGTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGTGGGATGCGTGCTGTGGAGTTCAAAGTGGTGGAAACAGATCCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103001 TGGTGGGATGCGTGCTGTGGAGTTCAAAGTGGTGGAAACAGATCCTAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTTATTGCATTGTTGCTCCAGACACAGTGATCCACTGCGAAGGGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103051 CTTATTGCATTGTTGCTCCAGACACAGTGATCCACTGCGAAGGGGAGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCAAACGAGAG         GATGAGGAAGAGTCCTTGAATGAAGTAGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103101 ATCAAACGAGAGGTG...CAGGATGAGGAAGAGTCCTTGAATGAAGTAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTATGATGACATTGGTGGCTGCAGGAAGCAGCTAGCTCAGATAAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104107 GTATGATGACATTGGTGGCTGCAGGAAGCAGCTAGCTCAGATAAAGGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGTGGAACTGCCCCTGAGACATCCTGCCCTCTTTAAGGCAATTGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104157 TGGTGGAACTGCCCCTGAGACATCCTGCCCTCTTTAAGGCAATTGGTGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAG         CCTCCTAGAGGAATCCTGCTTTACGGACCTCCTGGAAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104207 AAGGTG...CAGCCTCCTAGAGGAATCCTGCTTTACGGACCTCCTGGAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGGAAAGACCCTGATTGCTCGAGCTGTAGCAAATGAGACTGGAGCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105321 AGGAAAGACCCTGATTGCTCGAGCTGTAGCAAATGAGACTGGAGCCTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCTTCTTGATCAATG         GTCCTGAGATCATGAGCAAATTGGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105371 TCTTCTTGATCAATGGTG...CAGGTCCTGAGATCATGAGCAAATTGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGTGAGTCTGAGAGCAACCTTCGTAAAGCCTTTGAGGAGGCTGAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106039 GGTGAGTCTGAGAGCAACCTTCGTAAAGCCTTTGAGGAGGCTGAGAAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGCTCCTGCCATCATCTTCATTGATGAGCTAGATGCCATCGCTCCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106089 TGCTCCTGCCATCATCTTCATTGATGAGCTAGATGCCATCGCTCCCAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GAGAGAAA         ACTCATGGCGAGGTGGAGCGGCGCATTGTATCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106139 GAGAGAAAGTA...CAGACTCATGGCGAGGTGGAGCGGCGCATTGTATCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CAGTTGTTGACCCTCATGGATGGCCTAAAGCAGAGGGCACATGTGATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106258 CAGTTGTTGACCCTCATGGATGGCCTAAAGCAGAGGGCACATGTGATTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TATGGCAGCAACCAACAGACCCAACAGCATTGACCCAGCTCTACGGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106308 TATGGCAGCAACCAACAGACCCAACAGCATTGACCCAGCTCTACGGCGAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TTG         GTCGCTTTGACAGGGAGGTAGATATTGGAATTCCTGAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106358 TTGGTA...CAGGTCGCTTTGACAGGGAGGTAGATATTGGAATTCCTGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GCTACAGGACGCTTAGAGATTCTTCAGATCCATACCAAGAACATGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106712 GCTACAGGACGCTTAGAGATTCTTCAGATCCATACCAAGAACATGAAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGCAGATGATGTGGACCTGGAACAG         GTAGCCAATGAGACTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106762 GGCAGATGATGTGGACCTGGAACAGGTG...CAGGTAGCCAATGAGACTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ACGGGCATGTGGGTGCTGACTTAGCAGCCCTGTGCTCAGAGGCTGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107200 ACGGGCATGTGGGTGCTGACTTAGCAGCCCTGTGCTCAGAGGCTGCTCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CAAGCCATCCGCAAGAAGATGGATCTCATTGACCTAGAGGATGAGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107250 CAAGCCATCCGCAAGAAGATGGATCTCATTGACCTAGAGGATGAGACCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGATGCCGAGGTCATGAACTCTCTAGCAGTTACTATGGATGACTTCCGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 107300 TGATGCCGAGGTCATGAACTCTCTAGCAGTTACTATGGATGACTTCCGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1360         TGGGCCTTGAGCCAGAGTAACCCATCAGCACTGCGGGAAACC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107350 TA...TAGTGGGCCTTGAGCCAGAGTAACCCATCAGCACTGCGGGAAACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTGGTAGAGGTGCCACAGGTAACCTGGGAAGACATCGGGGGCCTAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107482 GTGGTAGAGGTGCCACAGGTAACCTGGGAAGACATCGGGGGCCTAGAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGTCAAACGTGAGCTACAGGAGCTGGTCCAG         TATCCTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 107532 TGTCAAACGTGAGCTACAGGAGCTGGTCCAGGTA...TAGTATCCTGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AGCACCCAGACAAATTCCTGAAGTTTGGCATGACACCTTCCAAGGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107848 AGCACCCAGACAAATTCCTGAAGTTTGGCATGACACCTTCCAAGGGAGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CTGTTCTATGGACCTCCTGGCTGTGGGAAAACTTTGTTGGCCAAAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107898 CTGTTCTATGGACCTCCTGGCTGTGGGAAAACTTTGTTGGCCAAAGCCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TGCTAATGAATGCCAGGCCAACTTCATCTCCATCAAGGGTCCTGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107948 TGCTAATGAATGCCAGGCCAACTTCATCTCCATCAAGGGTCCTGAGCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TCACCATGTGGTTTGGGGAGTCTGAGGCCAATGTCAGAGAAATCTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107998 TCACCATGTGGTTTGGGGAGTCTGAGGCCAATGTCAGAGAAATCTTTGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAG         GCCCGCCAAGCTGCCCCCTGTGTGCTATTCTTTGATGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108048 AAGGTG...CAGGCCCGCCAAGCTGCCCCCTGTGTGCTATTCTTTGATGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GCTGGATTCGATTGCCAAGGCTCGTGGAGGTAACATTGGAGATGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108600 GCTGGATTCGATTGCCAAGGCTCGTGGAGGTAACATTGGAGATGGTGGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GGGCTGCTGACCGAGTCATCAACCAGATCCTGACAGAAATGGATGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108650 GGGCTGCTGACCGAGTCATCAACCAGATCCTGACAGAAATGGATGGCATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TCCACAAAAAAAAATGTGTTCATCATTGGCGCTACCAACCGGCCTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108700 TCCACAAAAAAAAATGTGTTCATCATTGGCGCTACCAACCGGCCTGACAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CATTGATCCTGCCATCCTCAGACCTGGCCGTCTTGATCAGCTCATCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108750 CATTGATCCTGCCATCCTCAGACCTGGCCGTCTTGATCAGCTCATCTACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TCCCACTTCCTGATGAGAAGTCCCGTGTTGCCATCCTCAAGGCTAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108800 TCCCACTTCCTGATGAGAAGTCCCGTGTTGCCATCCTCAAGGCTAACCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CGCAAGTCCCCAGTTGCCAAG         GATGTGGACTTGGAGTTCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 108850 CGCAAGTCCCCAGTTGCCAAGGCA...TAGGATGTGGACTTGGAGTTCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GGCTAAAATGACTAATGGCTTCTCTGGAGCTGACCTGACAGAGATTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109164 GGCTAAAATGACTAATGGCTTCTCTGGAGCTGACCTGACAGAGATTTGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 AGCGTGCTTGCAAGCTGGCCATCCGTGAATCCATCGAGAGTGAGATTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109214 AGCGTGCTTGCAAGCTGGCCATCCGTGAATCCATCGAGAGTGAGATTAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CGAGAACGAGAGAGGCAGACAAACCCATCAGCCATG         GAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 109264 CGAGAACGAGAGAGGCAGACAAACCCATCAGCCATGGTG...TAGGAGGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 AGAAGAGGATGATCCAGTGCCTGAGATCCGTCGAGATCACTTTGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110838 AGAAGAGGATGATCCAGTGCCTGAGATCCGTCGAGATCACTTTGAAGAAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 CCATGCGCTTTGCGCGCCGTTCTGTCAGTGACAATGACATTCGGAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110888 CCATGCGCTTTGCGCGCCGTTCTGTCAGTGACAATGACATTCGGAAGTAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GAGATGTTTGCCCAGACCCTTCAGCAGAGTCGGGGCTTTGGCAGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110938 GAGATGTTTGCCCAGACCCTTCAGCAGAGTCGGGGCTTTGGCAGCTTCAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316          ATTCCCTTCAGGGAACCAGGGTGGAGCTGGCCCCAGTCAGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110988 GTA...CAGATTCCCTTCAGGGAACCAGGGTGGAGCTGGCCCCAGTCAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 GCAGTGGAGGCGGCACAGGTGGCAGTGTATACACAGAAGACAATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111182 GCAGTGGAGGCGGCACAGGTGGCAGTGTATACACAGAAGACAATGATGAT

   2550     .    :
   2407 GACCTGTATGGC
        ||||||||||||
 111232 GACCTGTATGGC