seq1 = pF1KB5674.tfa, 1305 bp
seq2 = pF1KB5674/gi568815578f_50410528.tfa (gi568815578f:50410528_50681460), 270933 bp

>pF1KB5674 1305
>gi568815578f:50410528_50681460 (Chr20)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-154  (150836-150926)   100% ->
155-255  (154442-154542)   100% ->
256-354  (157853-157951)   100% ->
355-492  (163990-164127)   100% ->
493-702  (167893-168102)   100% ->
703-864  (168641-168802)   100% ->
865-1088  (169176-169399)   100% ->
1089-1284  (170738-170933)   100% ->
1285-1305  (172165-172185)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGATGGAAAAGGAGTTCGAGCAGATCGACAAGTCCGGGAGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGATGGAAAAGGAGTTCGAGCAGATCGACAAGTCCGGGAGCTGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCATTTACCAG         GATATCCGACATGAAGCCAGTGACTTCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCATTTACCAGGTG...TAGGATATCCGACATGAAGCCAGTGACTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATGTAGAGTGGCCAAGCTTCCTAAGAACAAAAACCGAAATAGGTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150864 CATGTAGAGTGGCCAAGCTTCCTAAGAACAAAAACCGAAATAGGTACAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACGTCAGTCCCT         TTGACCATAGTCGGATTAAACTACATCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 150914 GACGTCAGTCCCTGTA...CAGTTGACCATAGTCGGATTAAACTACATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAAGATAATGACTATATCAACGCTAGTTTGATAAAAATGGAAGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154470 AGAAGATAATGACTATATCAACGCTAGTTTGATAAAAATGGAAGAAGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAGGAGTTACATTCTTACCCAG         GGCCCTTTGCCTAACACA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 154520 AAAGGAGTTACATTCTTACCCAGGTA...CAGGGCCCTTTGCCTAACACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TGCGGTCACTTTTGGGAGATGGTGTGGGAGCAGAAAAGCAGGGGTGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157871 TGCGGTCACTTTTGGGAGATGGTGTGGGAGCAGAAAAGCAGGGGTGTCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATGCTCAACAGAGTGATGGAGAAAGGTTCG         TTAAAATGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 157921 CATGCTCAACAGAGTGATGGAGAAAGGTTCGGTA...CAGTTAAAATGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CACAATACTGGCCACAAAAAGAAGAAAAAGAGATGATCTTTGAAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164000 CACAATACTGGCCACAAAAAGAAGAAAAAGAGATGATCTTTGAAGACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AATTTGAAATTAACATTGATCTCTGAAGATATCAAGTCATATTATACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164050 AATTTGAAATTAACATTGATCTCTGAAGATATCAAGTCATATTATACAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCGACAGCTAGAATTGGAAAACCTTACA         ACCCAAGAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 164100 GCGACAGCTAGAATTGGAAAACCTTACAGTG...CAGACCCAAGAAACTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GAGAGATCTTACATTTCCACTATACCACATGGCCTGACTTTGGAGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167906 GAGAGATCTTACATTTCCACTATACCACATGGCCTGACTTTGGAGTCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAATCACCAGCCTCATTCTTGAACTTTCTTTTCAAAGTCCGAGAGTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167956 GAATCACCAGCCTCATTCTTGAACTTTCTTTTCAAAGTCCGAGAGTCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTCACTCAGCCCGGAGCACGGGCCCGTTGTGGTGCACTGCAGTGCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168006 GTCACTCAGCCCGGAGCACGGGCCCGTTGTGGTGCACTGCAGTGCAGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCGGCAGGTCTGGAACCTTCTGTCTGGCTGATACCTGCCTCTTGCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 168056 TCGGCAGGTCTGGAACCTTCTGTCTGGCTGATACCTGCCTCTTGCTGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703       ATGGACAAGAGGAAAGACCCTTCTTCCGTTGATATCAAGAAAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168106 ...CAGATGGACAAGAGGAAAGACCCTTCTTCCGTTGATATCAAGAAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCTGTTAGAAATGAGGAAGTTTCGGATGGGGCTGATCCAGACAGCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168685 GCTGTTAGAAATGAGGAAGTTTCGGATGGGGCTGATCCAGACAGCCGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCTGCGCTTCTCCTACCTGGCTGTGATCGAAGGTGCCAAATTCATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168735 AGCTGCGCTTCTCCTACCTGGCTGTGATCGAAGGTGCCAAATTCATCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGGGACTCTTCCGTGCAG         GATCAGTGGAAGGAGCTTTCCCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 168785 GGGGACTCTTCCGTGCAGGTC...AAGGATCAGTGGAAGGAGCTTTCCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CGAGGACCTGGAGCCCCCACCCGAGCATATCCCCCCACCTCCCCGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169199 CGAGGACCTGGAGCCCCCACCCGAGCATATCCCCCCACCTCCCCGGCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCAAACGAATCCTGGAGCCACACAATGGGAAATGCAGGGAGTTCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169249 CCAAACGAATCCTGGAGCCACACAATGGGAAATGCAGGGAGTTCTTCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AATCACCAGTGGGTGAAGGAAGAGACCCAGGAGGATAAAGACTGCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169299 AATCACCAGTGGGTGAAGGAAGAGACCCAGGAGGATAAAGACTGCCCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAAGGAAGAAAAAGGAAGCCCCTTAAATGCCGCACCCTACGGCATCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169349 CAAGGAAGAAAAAGGAAGCCCCTTAAATGCCGCACCCTACGGCATCGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 G         CATGAGTCAAGACACTGAAGTTAGAAGTCGGGTCGTGGGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169399 GGTA...CAGCATGAGTCAAGACACTGAAGTTAGAAGTCGGGTCGTGGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGAAGTCTTCGAGGTGCCCAGGCTGCCTCCCCAGCCAAAGGGGAGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170778 GGAAGTCTTCGAGGTGCCCAGGCTGCCTCCCCAGCCAAAGGGGAGCCGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACTGCCCGAGAAGGACGAGGACCATGCACTGAGTTACTGGAAGCCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170828 ACTGCCCGAGAAGGACGAGGACCATGCACTGAGTTACTGGAAGCCCTTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGGTCAACATGTGCGTGGCTACGGTCCTCACGGCCGGCGCTTACCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170878 TGGTCAACATGTGCGTGGCTACGGTCCTCACGGCCGGCGCTTACCTCTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .
   1279 TACAGG         TTCCTGTTCAACAGCAACACA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 170928 TACAGGGTA...CAGTTCCTGTTCAACAGCAACACA