seq1 = pF1KB5670.tfa, 2775 bp
seq2 = pF1KB5670/gi568815589r_32357125.tfa (gi568815589r:32357125_32626166), 269042 bp

>pF1KB5670 2775
>gi568815589r:32357125_32626166 (Chr9)

(complement)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-241  (125228-125362)   100% ->
242-423  (132225-132406)   100% ->
424-571  (133629-133776)   100% ->
572-691  (134747-134866)   100% ->
692-799  (136716-136823)   100% ->
800-953  (137280-137433)   100% ->
954-1212  (137964-138222)   100% ->
1213-1375  (138534-138696)   100% ->
1376-1480  (140888-140992)   100% ->
1481-1638  (144670-144827)   100% ->
1639-1774  (145813-145948)   100% ->
1775-1923  (149036-149184)   100% ->
1924-2014  (153102-153192)   100% ->
2015-2185  (158235-158405)   100% ->
2186-2337  (159726-159877)   100% ->
2338-2481  (166653-166796)   100% ->
2482-2775  (168749-169042)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCACCGAGCAGCGACGCAGCCTGCAAGCCTTCCAGGATTATATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCACCGAGCAGCGACGCAGCCTGCAAGCCTTCCAGGATTATATCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGACCCTGGACCCTACCTACATCCTGAGCTACATGGCCCCCTGGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGACCCTGGACCCTACCTACATCCTGAGCTACATGGCCCCCTGGTTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGAGG         AAGAGGTGCAGTATATTCAGGCTGAGAAAAACAAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGAGGGTG...TAGAAGAGGTGCAGTATATTCAGGCTGAGAAAAACAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGGCCCAATGGAGGCTGCCACACTTTTTCTCAAGTTCCTGTTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125263 AAGGGCCCAATGGAGGCTGCCACACTTTTTCTCAAGTTCCTGTTGGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGGAGGAAGGCTGGTTCCGTGGCTTTTTGGATGCCCTAGACCATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125313 CCAGGAGGAAGGCTGGTTCCGTGGCTTTTTGGATGCCCTAGACCATGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242          GTTATTCTGGACTTTATGAAGCCATTGAAAGTTGGGATTTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125363 GTT...CAGGTTATTCTGGACTTTATGAAGCCATTGAAAGTTGGGATTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAAAAATTGAAAAGTTGGAGGAGTATAGATTACTTTTAAAACGTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132266 AAAAAAATTGAAAAGTTGGAGGAGTATAGATTACTTTTAAAACGTTTACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACCAGAATTTAAAACCAGAATTATCCCAACCGATATCATTTCTGATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132316 ACCAGAATTTAAAACCAGAATTATCCCAACCGATATCATTTCTGATCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGAATGTTTAATTAATCAGGAATGTGAAGAAATTCTACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 132366 CTGAATGTTTAATTAATCAGGAATGTGAAGAAATTCTACAGGTA...TAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTTGCTCTACTAAGGGGATGATGGCAGGTGCAGAGAAATTGGTGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133629 ATTTGCTCTACTAAGGGGATGATGGCAGGTGCAGAGAAATTGGTGGAATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTTCTCAGATCAGACAAGGAAAACTGGCCCAAAACTTTGAAACTTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133679 CCTTCTCAGATCAGACAAGGAAAACTGGCCCAAAACTTTGAAACTTGCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGAGAAAGAAAGGAACAAGTTCAGTGAACTGTGGATTGTAGAGAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 133729 TGGAGAAAGAAAGGAACAAGTTCAGTGAACTGTGGATTGTAGAGAAAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    572        GTATAAAAGATGTTGAAACAGAAGATCTTGAGGATAAGATGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133779 A...AAGGTATAAAAGATGTTGAAACAGAAGATCTTGAGGATAAGATGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AACTTCTGACATACAGATTTTCTACCAAGAAGATCCAGAATGCCAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134790 AACTTCTGACATACAGATTTTCTACCAAGAAGATCCAGAATGCCAGAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTAGTGAGAATTCATGTCCACCTTCAG         AAGTGTCTGATACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 134840 TTAGTGAGAATTCATGTCCACCTTCAGGTA...CAGAAGTGTCTGATACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AACTTGTACAGCCCATTTAAACCAAGAAATTACCAATTAGAGCTTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136730 AACTTGTACAGCCCATTTAAACCAAGAAATTACCAATTAGAGCTTGCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCCTGCTATGAAAGGAAAAAACACAATAATATGTGCTCCTACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 136780 GCCTGCTATGAAAGGAAAAAACACAATAATATGTGCTCCTACAGGTA...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    800    GTTGTGGAAAAACCTTTGTTTCACTGCTTATATGTGAACATCATCTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137277 AAGGTTGTGGAAAAACCTTTGTTTCACTGCTTATATGTGAACATCATCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAAAAATTCCCACAAGGACAAAAGGGGAAAGTTGTCTTTTTTGCGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137327 AAAAAATTCCCACAAGGACAAAAGGGGAAAGTTGTCTTTTTTGCGAATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GATCCCAGTGTATGAACAGCAGAAATCTGTATTCTCAAAATACTTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137377 GATCCCAGTGTATGAACAGCAGAAATCTGTATTCTCAAAATACTTTGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GACATGG         GTATAGAGTTACAGGCATTTCTGGAGCAACAGCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137427 GACATGGGTA...CAGGTATAGAGTTACAGGCATTTCTGGAGCAACAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGAATGTCCCAGTGGAACAGATTGTTGAGAACAATGACATCATCATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137998 GAGAATGTCCCAGTGGAACAGATTGTTGAGAACAATGACATCATCATTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AACTCCACAGATTCTTGTGAACAACCTTAAAAAGGGAACGATTCCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138048 AACTCCACAGATTCTTGTGAACAACCTTAAAAAGGGAACGATTCCATCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TATCCATCTTTACTTTGATGATATTTGATGAATGCCACAACACTAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138098 TATCCATCTTTACTTTGATGATATTTGATGAATGCCACAACACTAGTAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CAACACCCGTACAATATGATCATGTTTAATTATCTAGATCAGAAACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138148 CAACACCCGTACAATATGATCATGTTTAATTATCTAGATCAGAAACTTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGGATCTTCAGGCCCACTGCCCCAG         GTCATTGGGCTGACTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 138198 AGGATCTTCAGGCCCACTGCCCCAGGTA...CAGGTCATTGGGCTGACTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CCTCGGTTGGTGTTGGGGATGCCAAAAACACAGATGAAGCCTTGGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138550 CCTCGGTTGGTGTTGGGGATGCCAAAAACACAGATGAAGCCTTGGATTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATCTGCAAGCTGTGTGCTTCTCTTGATGCGTCAGTGATAGCAACAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138600 ATCTGCAAGCTGTGTGCTTCTCTTGATGCGTCAGTGATAGCAACAGTCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 ACACAATCTGGAGGAACTGGAGCAAGTTGTTTATAAGCCCCAGAAGT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 138650 ACACAATCTGGAGGAACTGGAGCAAGTTGTTTATAAGCCCCAGAAGTGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1376       TTTTCAGGAAAGTGGAATCACGGATTAGCGACAAATTTAAATAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138700 ...TAGTTTTCAGGAAAGTGGAATCACGGATTAGCGACAAATTTAAATAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ATCATAGCTCAGCTGATGAGGGACACAGAGAGTCTGGCAAAGAGAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140932 ATCATAGCTCAGCTGATGAGGGACACAGAGAGTCTGGCAAAGAGAATCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CAAAGACCTCG         AAAACTTATCTCAAATTCAAAATAGGGAAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 140982 CAAAGACCTCGGTG...CAGAAAACTTATCTCAAATTCAAAATAGGGAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TTGGAACACAGAAATATGAACAATGGATTGTTACAGTTCAGAAAGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144700 TTGGAACACAGAAATATGAACAATGGATTGTTACAGTTCAGAAAGCATGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ATGGTGTTCCAGATGCCAGACAAAGATGAAGAGAGCAGGATTTGTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144750 ATGGTGTTCCAGATGCCAGACAAAGATGAAGAGAGCAGGATTTGTAAAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CCTGTTTTTATACACTTCACATTTGCGG         AAATATAATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 144800 CCTGTTTTTATACACTTCACATTTGCGGGTA...CAGAAATATAATGATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CCCTCATTATCAGTGAGCATGCACGAATGAAAGATGCTCTGGATTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145826 CCCTCATTATCAGTGAGCATGCACGAATGAAAGATGCTCTGGATTACTTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AAAGACTTCTTCAGCAATGTCCGAGCAGCAGGATTCGATGAGATTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145876 AAAGACTTCTTCAGCAATGTCCGAGCAGCAGGATTCGATGAGATTGAGCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 AGATCTTACTCAGAGATTTGAAG         AAAAGCTGCAGGAACTAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 145926 AGATCTTACTCAGAGATTTGAAGGTG...CAGAAAAGCTGCAGGAACTAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AAAGTGTTTCCAGGGATCCCAGCAATGAGAATCCTAAACTTGAAGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149054 AAAGTGTTTCCAGGGATCCCAGCAATGAGAATCCTAAACTTGAAGACCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TGCTTCATCTTACAAGAAGAGTACCACTTAAACCCAGAGACAATAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149104 TGCTTCATCTTACAAGAAGAGTACCACTTAAACCCAGAGACAATAACAAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TCTCTTTGTGAAAACCAGAGCACTTGTGGAC         GCTTTAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 149154 TCTCTTTGTGAAAACCAGAGCACTTGTGGACGTA...CAGGCTTTAAAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 ATTGGATTGAAGGAAATCCTAAACTCAGTTTTCTAAAACCTGGCATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153112 ATTGGATTGAAGGAAATCCTAAACTCAGTTTTCTAAAACCTGGCATATTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 ACTGGACGTGGCAAAACAAATCAGAACACAG         GAATGACCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 153162 ACTGGACGTGGCAAAACAAATCAGAACACAGGTA...CAGGAATGACCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CCCGGCACAGAAGTGTATATTGGATGCATTCAAAGCCAGTGGAGATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158245 CCCGGCACAGAAGTGTATATTGGATGCATTCAAAGCCAGTGGAGATCACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ATATTCTGATTGCCACCTCAGTTGCTGATGAAGGCATTGACATTGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158295 ATATTCTGATTGCCACCTCAGTTGCTGATGAAGGCATTGACATTGCACAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 TGCAATCTTGTCATCCTTTATGAGTATGTGGGCAATGTCATCAAAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158345 TGCAATCTTGTCATCCTTTATGAGTATGTGGGCAATGTCATCAAAATGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CCAAACCAGAG         GCAGAGGAAGAGCAAGAGGTAGCAAGTGCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 158395 CCAAACCAGAGGTA...TAGGCAGAGGAAGAGCAAGAGGTAGCAAGTGCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TCCTTCTGACTAGTAATGCTGGTGTAATTGAAAAAGAACAAATAAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159756 TCCTTCTGACTAGTAATGCTGGTGTAATTGAAAAAGAACAAATAAACATG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 TACAAAGAAAAAATGATGAATGACTCTATTTTACGCCTTCAGACATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159806 TACAAAGAAAAAATGATGAATGACTCTATTTTACGCCTTCAGACATGGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CGAAGCAGTATTTAGGGAAAAG         ATTCTGCATATACAGACTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 159856 CGAAGCAGTATTTAGGGAAAAGGTA...TAGATTCTGCATATACAGACTC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 ATGAAAAATTCATCAGAGATAGTCAAGAAAAACCAAAACCTGTACCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166672 ATGAAAAATTCATCAGAGATAGTCAAGAAAAACCAAAACCTGTACCTGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 AAGGAAAATAAAAAACTGCTCTGCAGAAAGTGCAAAGCCTTGGCATGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166722 AAGGAAAATAAAAAACTGCTCTGCAGAAAGTGCAAAGCCTTGGCATGTTA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CACAGCTGACGTAAGAGTGATAGAG         GAATGCCATTACACTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 166772 CACAGCTGACGTAAGAGTGATAGAGGTA...TAGGAATGCCATTACACTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TGCTTGGAGATGCTTTTAAGGAATGCTTTGTGAGTAGACCACATCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168765 TGCTTGGAGATGCTTTTAAGGAATGCTTTGTGAGTAGACCACATCCCAAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 CCAAAGCAGTTTTCAAGTTTTGAAAAAAGAGCAAAGATATTCTGTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168815 CCAAAGCAGTTTTCAAGTTTTGAAAAAAGAGCAAAGATATTCTGTGCCCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 ACAGAACTGCAGCCATGACTGGGGAATCCATGTGAAGTACAAGACATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168865 ACAGAACTGCAGCCATGACTGGGGAATCCATGTGAAGTACAAGACATTTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 AGATTCCAGTTATAAAAATTGAAAGTTTTGTGGTGGAGGATATTGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168915 AGATTCCAGTTATAAAAATTGAAAGTTTTGTGGTGGAGGATATTGCAACT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GGAGTTCAGACACTGTACTCGAAGTGGAAGGACTTTCATTTTGAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168965 GGAGTTCAGACACTGTACTCGAAGTGGAAGGACTTTCATTTTGAGAAGAT

   2900     .    :    .    :    .
   2748 ACCATTTGATCCAGCAGAAATGTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 169015 ACCATTTGATCCAGCAGAAATGTCCAAA