seq1 = pF1KB5667.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KB5667/gi568815597r_145836313.tfa (gi568815597r:145836313_146057927), 221615 bp

>pF1KB5667 1011
>gi568815597r:145836313_146057927 (Chr1)

(complement)

1-292  (100001-100292)   99% ->
293-456  (110146-110309)   100% ->
457-597  (115075-115215)   100% ->
598-693  (120229-120324)   100% ->
694-771  (120943-121020)   100% ->
772-1011  (121376-121615)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACTATGCGAGCGCAGCGGCTGCAGCCTGGTGTGGGCACCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACTATGCGAGCGCAGCGGCTGCAGCCTGGTGTGGGCACCAGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGGGCACTCTCCGAGCGCTGCGGCCCGGAGTGACTGGGGCCGCGGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100051 GAGGGGCACTCTCCGAGCGCTGCGGCCCGGAGTGACTGGGGCCGCGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACCGCCACACCCCCTGCGGGCCCCCCGCCTGCCCCGCCGCCTCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACCGCCACACCCCCTGCGGGCCCCCCGCCTGCCCCGCCGCCTCCCGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGCCCCCGCCGCCGCTGCTCCTGTCTGGGGCCCCAGGACTACCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGCCCCCGCCGCCGCTGCTCCTGTCTGGGGCCCCAGGACTACCCCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCGGCGCCGCCGGCAGCCCGGCAGTGCTGCGAGAGGCCGTGGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCGGCGCCGCCGGCAGCCCGGCAGTGCTGCGAGAGGCCGTGGAGGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTGAGGAGCTTCGCCAAGCACACGCAGGGCTATGGCCGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100251 TGGTGAGGAGCTTCGCCAAGCACACGCAGGGCTATGGCCGAGGTG...TA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    293  TGAATGTGGTGGAGGCACTTCAGGAATTCTGGCAGATGAAGCAGTCCCG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110145 GTGAATGTGGTGGAGGCACTTCAGGAATTCTGGCAGATGAAGCAGTCCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGGTGCTGACTTAAAGAATGGGGCTCTAGTGGTTTATGAGATGGTTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110195 TGGTGCTGACTTAAAGAATGGGGCTCTAGTGGTTTATGAGATGGTTCCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCAACAGCCCTCCTTATGTCTGCTATGTCACCCTGCCTGGGGGAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110245 CCAACAGCCCTCCTTATGTCTGCTATGTCACCCTGCCTGGGGGAAGCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTTGGGAGTTTCCAG         TTTTGCCCCACAAAAGCTGAGGCCCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 110295 TTTGGGAGTTTCCAGGTA...TAGTTTTGCCCCACAAAAGCTGAGGCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAGGAGTGCTGCAAAGATTGCGCTAATGAATTCTGTGTTTAATGAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115101 GAGGAGTGCTGCAAAGATTGCGCTAATGAATTCTGTGTTTAATGAACATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTTCCCGAAGAATCACTGATGAGTTCATCGAGAAGAGTGTCTCTGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115151 CTTCCCGAAGAATCACTGATGAGTTCATCGAGAAGAGTGTCTCTGAGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGGCATCTTTTAAT         GGCAACAGGGAGGAAGCTGACAACCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115201 CTGGCATCTTTTAATGTA...CAGGGCAACAGGGAGGAAGCTGACAACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAATACAGGGATTGGTGCCTTCCGATTCATGCTGGAATCCAACAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120255 AAATACAGGGATTGGTGCCTTCCGATTCATGCTGGAATCCAACAAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AATCAATGTTGGAGTTCCAG         GAGCTAATGACAGTTTTTCAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 120305 AATCAATGTTGGAGTTCCAGGTA...CAGGAGCTAATGACAGTTTTTCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGCTACACTGGAATGGCAGCCTTAAGGCCATGAGGGAACGACAATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120964 CTGCTACACTGGAATGGCAGCCTTAAGGCCATGAGGGAACGACAATGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCGGCAG         GAGGTGTTGGCTCATTATTCGCACCGGGCCCTGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121014 TCGGCAGGTA...TAGGAGGTGTTGGCTCATTATTCGCACCGGGCCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGATGATATTCGCCACCAAATGGCCTTGGACTGGGTGAGCCGGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121410 ATGATGATATTCGCCACCAAATGGCCTTGGACTGGGTGAGCCGGGAGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGTGTGCCGGGGGCACTGTCTAGAGAGCTGGCCTCTACTGAGCGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121460 AGTGTGCCGGGGGCACTGTCTAGAGAGCTGGCCTCTACTGAGCGGGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGATGAAGCCCGACTGGCAGGCAAGGAGCTGCGCTTCCACAAGGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121510 GGATGAAGCCCGACTGGCAGGCAAGGAGCTGCGCTTCCACAAGGAGAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AAGATATTCTTGTGCTGGCTGCTGGGCAGTTGGGCAATATGCATTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121560 AAGATATTCTTGTGCTGGCTGCTGGGCAGTTGGGCAATATGCATTCTTCC

   1050     .
   1006 AACTGC
        ||||||
 121610 AACTGC