seq1 = pF1KB5664.tfa, 1134 bp
seq2 = pF1KB5664/gi568815589f_88901201.tfa (gi568815589f:88901201_89102334), 201134 bp

>pF1KB5664 1134
>gi568815589f:88901201_89102334 (Chr9)

1-1134  (100001-101134)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAACTGCCCTCCCGCCGCGTCTCCAGCCGGTGCGGGGGAACGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAACTGCCCTCCCGCCGCGTCTCCAGCCGGTGCGGGGGAACGAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCGGGAGCATTACCAGTACGTGGGGAAGTTGGCGGGCAGGCTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCGGGAGCATTACCAGTACGTGGGGAAGTTGGCGGGCAGGCTGAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCTCCGAGGGCAGCACGCTCACCACCGTGCTCTTCTTGGTCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCCTCCGAGGGCAGCACGCTCACCACCGTGCTCTTCTTGGTCATCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTTCATCGTCTTGGAGAACCTGATGGTTTTGATTGCCATCTGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTTCATCGTCTTGGAGAACCTGATGGTTTTGATTGCCATCTGGAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAATAAATTTCACAACCGCATGTACTTTTTCATTGGCAACCTGGCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAATAAATTTCACAACCGCATGTACTTTTTCATTGGCAACCTGGCTCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGACCTGCTGGCCGGCATCGCTTACAAGGTCAACATTCTGATGTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGACCTGCTGGCCGGCATCGCTTACAAGGTCAACATTCTGATGTCTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGAAGACGTTCAGCCTGTCTCCCACGGTCTGGTTCCTCAGGGAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGAAGACGTTCAGCCTGTCTCCCACGGTCTGGTTCCTCAGGGAGGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATGTTCGTGGCCCTTGGGGCGTCCACCTGCAGCTTACTGGCCATCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATGTTCGTGGCCCTTGGGGCGTCCACCTGCAGCTTACTGGCCATCGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCGAGCGGCACTTGACAATGATCAAAATGAGGCCTTACGACGCCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCGAGCGGCACTTGACAATGATCAAAATGAGGCCTTACGACGCCAACAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGCACCGCGTCTTCCTCCTGATCGGGATGTGCTGGCTCATTGCCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGCACCGCGTCTTCCTCCTGATCGGGATGTGCTGGCTCATTGCCTTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGGGCGCCCTGCCCATTCTGGGCTGGAACTGCCTGCACAATCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGGGCGCCCTGCCCATTCTGGGCTGGAACTGCCTGCACAATCTCCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTGCTCTACCATCCTGCCCCTCTACTCCAAGAAGTACATTGCCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTGCTCTACCATCCTGCCCCTCTACTCCAAGAAGTACATTGCCTTCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCAGCATCTTCACGGCCATCCTGGTGACCATCGTGATCCTCTACGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCAGCATCTTCACGGCCATCCTGGTGACCATCGTGATCCTCTACGCACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCTACTTCCTGGTGAAGTCCAGCAGCCGTAAGGTGGCCAACCACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATCTACTTCCTGGTGAAGTCCAGCAGCCGTAAGGTGGCCAACCACAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACTCGGAGCGGTCCATGGCACTGCTGCGGACCGTGGTGATTGTGGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACTCGGAGCGGTCCATGGCACTGCTGCGGACCGTGGTGATTGTGGTGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGTTCATCGCCTGCTGGTCCCCACTCTTCATCCTCTTCCTCATTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGTTCATCGCCTGCTGGTCCCCACTCTTCATCCTCTTCCTCATTGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCTGCAGGGTGCAGGCGTGCCCCATCCTCTTCAAGGCTCAGTGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCCTGCAGGGTGCAGGCGTGCCCCATCCTCTTCAAGGCTCAGTGGTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCGTGTTGGCTGTGCTCAACTCCGCCATGAACCCGGTCATCTACACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCGTGTTGGCTGTGCTCAACTCCGCCATGAACCCGGTCATCTACACGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCAGCAAGGAGATGCGGCGGGCCTTCTTCCGTCTGGTCTGCAACTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCAGCAAGGAGATGCGGCGGGCCTTCTTCCGTCTGGTCTGCAACTGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGTCAGGGGACGGGGGGCCCGCGCCTCACCCATCCAGCCTGCGCTCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGTCAGGGGACGGGGGGCCCGCGCCTCACCCATCCAGCCTGCGCTCGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CAAGCAGAAGTAAATCAAGCAGCAGCAACAATAGCAGCCACTCTCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CAAGCAGAAGTAAATCAAGCAGCAGCAACAATAGCAGCCACTCTCCGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTCAAGGAAGACCTGCCCCACACAGCCCCCTCATCCTGCATCATGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTCAAGGAAGACCTGCCCCACACAGCCCCCTCATCCTGCATCATGGACAA

   1100     .    :    .    :    .    :
   1101 GAACGCAGCACTTCAGAATGGGATCTTCTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAACGCAGCACTTCAGAATGGGATCTTCTGCAAC