seq1 = pF1KB5655.tfa, 3684 bp
seq2 = pF1KB5655/gi568815594f_89794972.tfa (gi568815594f:89794972_90053415), 258444 bp

>pF1KB5655 3684
>gi568815594f:89794972_90053415 (Chr4)

1-623  (100001-100623)   100% ->
624-743  (114305-114424)   100% ->
744-850  (116973-117079)   100% ->
851-955  (128197-128301)   100% ->
956-1129  (132824-132997)   100% ->
1130-3118  (139839-141827)   100% ->
3119-3265  (156634-156780)   100% ->
3266-3684  (158026-158444)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGGGCAAGATTATTTGTCCTTCTTTCTAGTTTATGGAGTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGGGGCAAGATTATTTGTCCTTCTTTCTAGTTTATGGAGTGGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTGGGCTTAACAACAGTAAGCATTCTTGGACTATACCTGAGGATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTGGGCTTAACAACAGTAAGCATTCTTGGACTATACCTGAGGATGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCTCAGAAGACTATGCCTTCTGCTTCAGTTCCTCCAAATAAAATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCTCAGAAGACTATGCCTTCTGCTTCAGTTCCTCCAAATAAAATACAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGTTTGCAAATACTGCCAACCACTCGGGTCATGTCGGCGGAGATAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGTTTGCAAATACTGCCAACCACTCGGGTCATGTCGGCGGAGATAGCTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AACTCCAGAGGCAAGAACTTCTGAAGACAGTCTTCTTAAATCAACACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AACTCCAGAGGCAAGAACTTCTGAAGACAGTCTTCTTAAATCAACACTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCCCTCAGAAACAAGTGCACCTGCTGAGGGTGTGAGAAATCAAACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCCCTCAGAAACAAGTGCACCTGCTGAGGGTGTGAGAAATCAAACTCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACATCCACAGAGAAAGCAGAAGGAGTGGTCAAGTTACAGAATCTTACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACATCCACAGAGAAAGCAGAAGGAGTGGTCAAGTTACAGAATCTTACCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCAACCAACGCTAGCATCAAGTTCAATCCTGGAGCAGAATCAGTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCAACCAACGCTAGCATCAAGTTCAATCCTGGAGCAGAATCAGTGGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTCCAATTCTACACTGAAATTTCTTCAGAGCTTTGCCAGAAAGTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTCCAATTCTACACTGAAATTTCTTCAGAGCTTTGCCAGAAAGTCAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAACAAGCAACTTCTCTAAACACAGTTGGAGGCACTGGAGGCATTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAACAAGCAACTTCTCTAAACACAGTTGGAGGCACTGGAGGCATTGGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGTTGGAGGCACTGGAGGCGTGGGAAATCGAGCCCCACGGGAAACATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGTTGGAGGCACTGGAGGCGTGGGAAATCGAGCCCCACGGGAAACATACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAGCCGGGGTGACAGCAGTTCCAGCCAAAGAACTGACTACCAAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAGCCGGGGTGACAGCAGTTCCAGCCAAAGAACTGACTACCAAAAATCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATTTCGAAACAACTAGAGGAAA         GAATTGGTGTGCTTATGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100601 AATTTCGAAACAACTAGAGGAAAGTA...TAGGAATTGGTGTGCTTATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ACATACCAGGTTATCTCCCACAGTGATATTGGACAACCAGGTCACTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114323 ACATACCAGGTTATCTCCCACAGTGATATTGGACAACCAGGTCACTTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCCCAGGTGGGAAAGGACCTTGTGGCTGGACCGGTGGATCCTGTCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114373 TCCCAGGTGGGAAAGGACCTTGTGGCTGGACCGGTGGATCCTGTCCTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AG         ATCTCAGAAGATATCCAATCCTGTCTATAGGATGCAACA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114423 AGGTA...TAGATCTCAGAAGATATCCAATCCTGTCTATAGGATGCAACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TAAAATTGTCACCTCATTGGATTGGAGGTGCTGTCCTGGATACAGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117012 TAAAATTGTCACCTCATTGGATTGGAGGTGCTGTCCTGGATACAGTGGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CGAAATGTCAACTAAGAG         CCCAGGAACAGCAAAGTTTGATA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 117062 CGAAATGTCAACTAAGAGGTA...TAGCCCAGGAACAGCAAAGTTTGATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CACACCAACCAGGCTGAAAGTCATACAGCTGTTGGCAGAGGAGTAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128220 CACACCAACCAGGCTGAAAGTCATACAGCTGTTGGCAGAGGAGTAGCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GCAGCAGCAGCAGCAAGGCTGTGGTGACCCAG         AAGTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 128270 GCAGCAGCAGCAGCAAGGCTGTGGTGACCCAGGTC...CAGAAGTGATGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AAAAAATGACTGATCAGGTGAACTACCAGGCAATGAAACTGACTCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132833 AAAAAATGACTGATCAGGTGAACTACCAGGCAATGAAACTGACTCTTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CAGAAGAAGATTGACAATATTTCTTTGACTGTGAATGATGTAAGGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132883 CAGAAGAAGATTGACAATATTTCTTTGACTGTGAATGATGTAAGGAACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TTACTCCTCCCTAGAAGGAAAAGTCAGCGAAGATAAAAGCAGAGAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132933 TTACTCCTCCCTAGAAGGAAAAGTCAGCGAAGATAAAAGCAGAGAATTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AATCTCTTCTAAAAG         GTCTAAAATCCAAAAGCATTAATGTA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 132983 AATCTCTTCTAAAAGGTA...TAGGTCTAAAATCCAAAAGCATTAATGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CTGATAAGAGACATAGTAAGAGAACAATTTAAAATTTTTCAAAATGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139865 CTGATAAGAGACATAGTAAGAGAACAATTTAAAATTTTTCAAAATGACAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GCAAGAGACTGTAGCACAGCTCTTCAAGACTGTATCAAGTCTATCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139915 GCAAGAGACTGTAGCACAGCTCTTCAAGACTGTATCAAGTCTATCAGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ACCTCGAAAGCACCAGGCAAATAATTCAAAAAGTTAATGAATCTGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139965 ACCTCGAAAGCACCAGGCAAATAATTCAAAAAGTTAATGAATCTGTGGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TCAATAGCAGCCCAGCAAAAGTTTGTTTTGGTGCAAGAGAATCGGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140015 TCAATAGCAGCCCAGCAAAAGTTTGTTTTGGTGCAAGAGAATCGGCCCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TTTGACTGATATAGTGGAACTAAGGAATCACATTGTGAATGTAAGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140065 TTTGACTGATATAGTGGAACTAAGGAATCACATTGTGAATGTAAGGCAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AAATGACTCTTACATGTGAGAAGCCTATTAAAGAACTAGAAGTAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140115 AAATGACTCTTACATGTGAGAAGCCTATTAAAGAACTAGAAGTAAAGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 ACTCATTTAGAAGGTGCTCTAGAACAGGAACACTCAAGAAGCATTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140165 ACTCATTTAGAAGGTGCTCTAGAACAGGAACACTCAAGAAGCATTCTGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TTATGAATCCCTCAATAAAACTCTTTCTAAATTGAAGGAAGTACATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140215 TTATGAATCCCTCAATAAAACTCTTTCTAAATTGAAGGAAGTACATGAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AGCTTTTATCAACTGAACAGGTATCAGACCAGAAGAATGCTCCAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140265 AGCTTTTATCAACTGAACAGGTATCAGACCAGAAGAATGCTCCAGCTGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GAGTCAGTTAGCAATAATGTCACTGAGTACATGTCTACTTTACATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140315 GAGTCAGTTAGCAATAATGTCACTGAGTACATGTCTACTTTACATGAAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 TATAAAGAAGCAGAGTTTGATGATGCTGCAAATGTTTGAAGATTTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140365 TATAAAGAAGCAGAGTTTGATGATGCTGCAAATGTTTGAAGATTTGCACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 TTCAAGAAAGCAAGATTAACAATCTCACCGTCTCTTTGGAGATGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140415 TTCAAGAAAGCAAGATTAACAATCTCACCGTCTCTTTGGAGATGGAGAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GAGTCTCTCAGAGGTGAATGTGAAGACATGTTATCCAAATGCAGAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140465 GAGTCTCTCAGAGGTGAATGTGAAGACATGTTATCCAAATGCAGAAATGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 TTTTAAATTTCAACTTAAGGACACAGAAGAGAATTTACATGTGTTAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140515 TTTTAAATTTCAACTTAAGGACACAGAAGAGAATTTACATGTGTTAAATC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 AAACATTGGCTGAAGTTCTCTTTCCAATGGACAATAAGATGGACAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140565 AAACATTGGCTGAAGTTCTCTTTCCAATGGACAATAAGATGGACAAAATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 AGTGAGCAACTAAATGATTTGACTTATGATATGGAGATCCTTCAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140615 AGTGAGCAACTAAATGATTTGACTTATGATATGGAGATCCTTCAACCCTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 GCTTGAGCAGGGAGCATCACTCAGACAGACAATGACATATGAACAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140665 GCTTGAGCAGGGAGCATCACTCAGACAGACAATGACATATGAACAACCAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 AGGAAGCAATAGTGATAAGGAAAAAGATAGAAAATCTGACTAGTGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140715 AGGAAGCAATAGTGATAAGGAAAAAGATAGAAAATCTGACTAGTGCTGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 AATAGTCTAAATTTTATTATCAAAGAACTTACAAAAAGACACAACTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140765 AATAGTCTAAATTTTATTATCAAAGAACTTACAAAAAGACACAACTTACT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 TAGAAATGAAGTACAGGGTCGTGATGATGCCTTAGAAAGACGTATCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140815 TAGAAATGAAGTACAGGGTCGTGATGATGCCTTAGAAAGACGTATCAATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 AATATGCCTTAGAAATGGAAGATGGCCTCAATAAGACAATGACTATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140865 AATATGCCTTAGAAATGGAAGATGGCCTCAATAAGACAATGACTATTATA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 AATAATGCTATTGATTTCATTCAAGATAACTATGCCCTAAAAGAGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140915 AATAATGCTATTGATTTCATTCAAGATAACTATGCCCTAAAAGAGACTTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 AAGTACTATTAAGGATAATAGTGAGATCCATCATAAATGTACCTCCGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140965 AAGTACTATTAAGGATAATAGTGAGATCCATCATAAATGTACCTCCGATA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 TGGAAACTATTTTGACATTTATTCCTCAGTTCCACCGTCTGAATGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141015 TGGAAACTATTTTGACATTTATTCCTCAGTTCCACCGTCTGAATGATTCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2356 ATTCAGACTTTGGTCAATGACAATCAGAGATATAACTTTGTTTTGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141065 ATTCAGACTTTGGTCAATGACAATCAGAGATATAACTTTGTTTTGCAAGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 CGCCAAGACCCTTGCAGGTATTCCCAGAGATGAGAAACTAAATCAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141115 CGCCAAGACCCTTGCAGGTATTCCCAGAGATGAGAAACTAAATCAGTCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2456 ACTTCCAAAAGATGTATCAAATGTTCAATGAAACCACTTCCCAAGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141165 ACTTCCAAAAGATGTATCAAATGTTCAATGAAACCACTTCCCAAGTGAGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2506 AAATACCAGCAAAATATGAGTCATTTGGAAGAAAAACTACTCTTAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141215 AAATACCAGCAAAATATGAGTCATTTGGAAGAAAAACTACTCTTAACTAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2556 CAAGATTTCCAAAAATTTTGAGACTCGGTTGCAAGACATTGAGTCTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141265 CAAGATTTCCAAAAATTTTGAGACTCGGTTGCAAGACATTGAGTCTAAAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2606 TTACCCAGACGCTCATACCTTATTATATTTCAGTTAAAAAAGGCAGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141315 TTACCCAGACGCTCATACCTTATTATATTTCAGTTAAAAAAGGCAGTGTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2656 GTTACAAATGAGAGAGATCAGGCTCTTCAACTGCAAGTATTAAATTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141365 GTTACAAATGAGAGAGATCAGGCTCTTCAACTGCAAGTATTAAATTCCAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2706 ATTTAAGGCGTTGGAAGCAAAATCTATCCATCTTTCAATTAACTTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141415 ATTTAAGGCGTTGGAAGCAAAATCTATCCATCTTTCAATTAACTTCTTTT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2756 CGCTTAACAAAACTCTCCACGAAGTTTTAACAATGTGTCACAATGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141465 CGCTTAACAAAACTCTCCACGAAGTTTTAACAATGTGTCACAATGCTTCT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2806 ACAAGTGTGTCAGAACTGAATGCTACCATCCCTAAGTGGATAAAACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141515 ACAAGTGTGTCAGAACTGAATGCTACCATCCCTAAGTGGATAAAACATTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2856 CCTGCCAGATATTCAACTTCTTCAGAAAGGTCTAACAGAATTTGTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141565 CCTGCCAGATATTCAACTTCTTCAGAAAGGTCTAACAGAATTTGTGGAAC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2906 CAATAATTCAAATAAAAACTCAAGCTGCCCTATCTAATTTAACTTGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141615 CAATAATTCAAATAAAAACTCAAGCTGCCCTATCTAATTTAACTTGTTGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2956 ATAGATCGATCGTTGCCTGGTAGTCTGGCAAATGTTGTCAAGTCTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141665 ATAGATCGATCGTTGCCTGGTAGTCTGGCAAATGTTGTCAAGTCTCAGAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3006 GCAAGTAAAATCATTGCCAAAGAAAATTAACGCACTTAAGAAACCAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141715 GCAAGTAAAATCATTGCCAAAGAAAATTAACGCACTTAAGAAACCAACGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3056 TAAATCTTACCACAGTCCTGATAGGCCGGACTCAAAGAAACACGGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141765 TAAATCTTACCACAGTCCTGATAGGCCGGACTCAAAGAAACACGGACAAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3106 ATAATATATCCTG         AGGAGTATTCAAGCTGTAGTCGGCATCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 141815 ATAATATATCCTGGTA...CAGAGGAGTATTCAAGCTGTAGTCGGCATCC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3147 GTGCCAAAATGGGGGCACGTGCATAAATGGAAGAACTAGCTTTACCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156662 GTGCCAAAATGGGGGCACGTGCATAAATGGAAGAACTAGCTTTACCTGTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3197 CCTGCAGACATCCTTTTACTGGTGACAACTGCACTATCAAGCTTGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156712 CCTGCAGACATCCTTTTACTGGTGACAACTGCACTATCAAGCTTGTGGAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3247 GAAAATGCTTTAGCTCCAG         ATTTTTCCAAAGGATCTTACAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 156762 GAAAATGCTTTAGCTCCAGGTA...CAGATTTTTCCAAAGGATCTTACAG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3288 ATATGCACCCATGGTGGCATTTTTTGCATCTCATACGTATGGAATGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158048 ATATGCACCCATGGTGGCATTTTTTGCATCTCATACGTATGGAATGACTA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3338 TACCTGGTCCTATCCTGTTTAATAACTTGGATGTCAATTATGGAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158098 TACCTGGTCCTATCCTGTTTAATAACTTGGATGTCAATTATGGAGCTTCA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3388 TATACCCCAAGAACTGGAAAATTTAGAATTCCGTATCTTGGGGTATATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 158148 TATACCCCAAGAACTGGAAAATTTAGAATTCCGTATCTTGGAGTATATGT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3438 TTTCAAGTACACCATCGAGTCATTTAGTGCTCATATTTCTGGATTTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158198 TTTCAAGTACACCATCGAGTCATTTAGTGCTCATATTTCTGGATTTTTAG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3488 TGGTTGATGGAATAGACAAGCTTGCATTTGAGTCTGAAAATATTAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158248 TGGTTGATGGAATAGACAAGCTTGCATTTGAGTCTGAAAATATTAACAGT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3538 GAAATACACTGTGATAGGGTTTTAACTGGGGATGCCTTATTAGAATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158298 GAAATACACTGTGATAGGGTTTTAACTGGGGATGCCTTATTAGAATTAAA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3588 TTATGGGCAGGAAGTCTGGTTACGACTTGCAAAAGGAACAATTCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158348 TTATGGGCAGGAAGTCTGGTTACGACTTGCAAAAGGAACAATTCCAGCCA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3638 AGTTTCCCCCTGTTACTACATTTAGTGGCTATTTATTATATCGTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158398 AGTTTCCCCCTGTTACTACATTTAGTGGCTATTTATTATATCGTACA