Result of SIM4 for
pF1KB5610
seq1 = pF1KB5610.tfa, 3036 bp
seq2 = pF1KB5610/gi568815596f_186490339.tfa (gi568815596f:186490339_186777289), 286951 bp
>pF1KB5610 3036
>gi568815596f:186490339_186777289 (Chr2)
1-185 (100001-100185) 100% ->
186-316 (111683-111813) 100% ->
317-408 (132001-132092) 100% ->
409-523 (135135-135249) 100% ->
524-649 (145744-145869) 100% ->
650-694 (146727-146771) 100% ->
695-738 (147939-147982) 100% ->
739-795 (148071-148127) 100% ->
796-848 (150577-150629) 100% ->
849-1051 (151048-151250) 100% ->
1052-1243 (156348-156539) 100% ->
1244-1289 (159502-159547) 100% ->
1290-1397 (161644-161751) 100% ->
1398-1456 (164312-164370) 100% ->
1457-1611 (165909-166063) 100% ->
1612-1749 (168700-168837) 100% ->
1750-1817 (173430-173497) 100% ->
1818-1965 (174156-174303) 100% ->
1966-2058 (174788-174880) 100% ->
2059-2138 (176366-176445) 100% ->
2139-2219 (176812-176892) 100% ->
2220-2325 (177333-177438) 99% ->
2326-2484 (178424-178582) 100% ->
2485-2598 (179363-179476) 100% ->
2599-2712 (185266-185379) 100% ->
2713-2820 (185482-185589) 100% ->
2821-2943 (186475-186597) 100% ->
2944-3036 (186859-186951) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCTTTTCCGCCGCGGCGACGGCTGCGCCTCGGTCCCCGCGGCCTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCTTTTCCGCCGCGGCGACGGCTGCGCCTCGGTCCCCGCGGCCTCCC
50 . : . : . : . : . :
51 GCTTCTTCTCTCGGGACTCCTGCTACCTCTGTGCCGCGCCTTCAACCTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCTTCTTCTCTCGGGACTCCTGCTACCTCTGTGCCGCGCCTTCAACCTAG
100 . : . : . : . : . :
101 ACGTGGACAGTCCTGCCGAGTACTCTGGCCCCGAGGGAAGTTACTTCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ACGTGGACAGTCCTGCCGAGTACTCTGGCCCCGAGGGAAGTTACTTCGGC
150 . : . : . : . : . :
151 TTCGCCGTGGATTTCTTCGTGCCCAGCGCGTCTTC CCGGAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
100151 TTCGCCGTGGATTTCTTCGTGCCCAGCGCGTCTTCGTA...TAGCCGGAT
200 . : . : . : . : . :
192 GTTTCTTCTCGTGGGAGCTCCCAAAGCAAACACCACCCAGCCTGGGATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111689 GTTTCTTCTCGTGGGAGCTCCCAAAGCAAACACCACCCAGCCTGGGATTG
250 . : . : . : . : . :
242 TGGAAGGAGGGCAGGTCCTCAAATGTGACTGGTCTTCTACCCGCCGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111739 TGGAAGGAGGGCAGGTCCTCAAATGTGACTGGTCTTCTACCCGCCGGTGC
300 . : . : . : . : . :
292 CAGCCAATTGAATTTGATGCAACAG GCAATAGAGATTATGC
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
111789 CAGCCAATTGAATTTGATGCAACAGGTA...TAGGCAATAGAGATTATGC
350 . : . : . : . : . :
333 CAAGGATGATCCATTGGAATTTAAGTCCCATCAGTGGTTTGGAGCATCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132017 CAAGGATGATCCATTGGAATTTAAGTCCCATCAGTGGTTTGGAGCATCTG
400 . : . : . : . : . :
383 TGAGGTCGAAACAGGATAAAATTTTG GCCTGTGCCCCATTG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
132067 TGAGGTCGAAACAGGATAAAATTTTGGTG...TAGGCCTGTGCCCCATTG
450 . : . : . : . : . :
424 TACCATTGGAGAACTGAGATGAAACAGGAGCGAGAGCCTGTTGGAACATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135150 TACCATTGGAGAACTGAGATGAAACAGGAGCGAGAGCCTGTTGGAACATG
500 . : . : . : . : . :
474 CTTTCTTCAAGATGGAACAAAGACTGTTGAGTATGCTCCATGTAGATCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135200 CTTTCTTCAAGATGGAACAAAGACTGTTGAGTATGCTCCATGTAGATCAC
550 . : . : . : . : . :
524 GTCAGCTTATTTCGGATCAAGTGGCAGAAATCGTATCTAAA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135250 GTA...TAGGTCAGCTTATTTCGGATCAAGTGGCAGAAATCGTATCTAAA
600 . : . : . : . : . :
565 TACGACCCCAATGTTTACAGCATCAAGTATAATAACCAATTAGCAACTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145785 TACGACCCCAATGTTTACAGCATCAAGTATAATAACCAATTAGCAACTCG
650 . : . : . : . : . :
615 GACTGCACAAGCTATTTTTGATGACAGCTATTTGG GTTATT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
145835 GACTGCACAAGCTATTTTTGATGACAGCTATTTGGGTA...TAGGTTATT
700 . : . : . : . : . :
656 CTGTGGCTGTCGGAGATTTCAATGGTGATGGCATAGATG AC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
146733 CTGTGGCTGTCGGAGATTTCAATGGTGATGGCATAGATGGTA...CAGAC
750 . : . : . : . : . :
697 TTTGTTTCAGGAGTTCCAAGAGCAGCAAGGACTTTGGGAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
147941 TTTGTTTCAGGAGTTCCAAGAGCAGCAAGGACTTTGGGAATGGTA...CA
800 . : . : . : . : . :
739 GTTTATATTTATGATGGGAAGAACATGTCCTCCTTATACAATTTTACTG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148070 GGTTTATATTTATGATGGGAAGAACATGTCCTCCTTATACAATTTTACTG
850 . : . : . : . : . :
788 GCGAGCAG ATGGCTGCATATTTCGGATTTTCTGTAGCTGCC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
148120 GCGAGCAGGTA...CAGATGGCTGCATATTTCGGATTTTCTGTAGCTGCC
900 . : . : . : . : . :
829 ACTGACATTAATGGAGATGA TTATGCAGATGTGTTTATTGG
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
150610 ACTGACATTAATGGAGATGAGTA...TAGTTATGCAGATGTGTTTATTGG
950 . : . : . : . : . :
870 AGCACCTCTCTTCATGGATCGTGGCTCTGATGGCAAACTCCAAGAGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151069 AGCACCTCTCTTCATGGATCGTGGCTCTGATGGCAAACTCCAAGAGGTGG
1000 . : . : . : . : . :
920 GGCAGGTCTCAGTGTCTCTACAGAGAGCTTCAGGAGACTTCCAGACGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151119 GGCAGGTCTCAGTGTCTCTACAGAGAGCTTCAGGAGACTTCCAGACGACA
1050 . : . : . : . : . :
970 AAGCTGAATGGATTTGAGGTCTTTGCACGGTTTGGCAGTGCCATAGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151169 AAGCTGAATGGATTTGAGGTCTTTGCACGGTTTGGCAGTGCCATAGCTCC
1100 . : . : . : . : . :
1020 TTTGGGAGATCTGGACCAGGATGGTTTCAATG ATATTGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
151219 TTTGGGAGATCTGGACCAGGATGGTTTCAATGGTA...CAGATATTGCAA
1150 . : . : . : . : . :
1061 TTGCTGCTCCATATGGGGGTGAAGATAAAAAAGGAATTGTTTATATCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156357 TTGCTGCTCCATATGGGGGTGAAGATAAAAAAGGAATTGTTTATATCTTC
1200 . : . : . : . : . :
1111 AATGGAAGATCAACAGGCTTGAACGCAGTCCCATCTCAAATCCTTGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156407 AATGGAAGATCAACAGGCTTGAACGCAGTCCCATCTCAAATCCTTGAAGG
1250 . : . : . : . : . :
1161 GCAGTGGGCTGCTCGAAGCATGCCACCAAGCTTTGGCTATTCAATGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156457 GCAGTGGGCTGCTCGAAGCATGCCACCAAGCTTTGGCTATTCAATGAAAG
1300 . : . : . : . : . :
1211 GAGCCACAGATATAGACAAAAATGGATATCCAG ACTTAATT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
156507 GAGCCACAGATATAGACAAAAATGGATATCCAGGTG...AAGACTTAATT
1350 . : . : . : . : . :
1252 GTAGGAGCTTTTGGTGTAGATCGAGCTATCTTATACAG GGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
159510 GTAGGAGCTTTTGGTGTAGATCGAGCTATCTTATACAGGTG...TAGGGC
1400 . : . : . : . : . :
1293 CAGACCAGTTATCACTGTAAATGCTGGTCTTGAAGTGTACCCTAGCATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161647 CAGACCAGTTATCACTGTAAATGCTGGTCTTGAAGTGTACCCTAGCATTT
1450 . : . : . : . : . :
1343 TAAATCAAGACAATAAAACCTGCTCACTGCCTGGAACAGCTCTCAAAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161697 TAAATCAAGACAATAAAACCTGCTCACTGCCTGGAACAGCTCTCAAAGTT
1500 . : . : . : . : . :
1393 TCCTG TTTTAATGTTAGGTTCTGCTTAAAGGCAGATGGCAA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161747 TCCTGGTA...CAGTTTTAATGTTAGGTTCTGCTTAAAGGCAGATGGCAA
1550 . : . : . : . : . :
1434 AGGAGTACTTCCCAGGAAACTTA ATTTCCAGGTGGAACTTC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
164348 AGGAGTACTTCCCAGGAAACTTAGTA...TAGATTTCCAGGTGGAACTTC
1600 . : . : . : . : . :
1475 TTTTGGATAAACTCAAGCAAAAGGGAGCAATTCGACGAGCACTGTTTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165927 TTTTGGATAAACTCAAGCAAAAGGGAGCAATTCGACGAGCACTGTTTCTC
1650 . : . : . : . : . :
1525 TACAGCAGGTCCCCAAGTCACTCCAAGAACATGACTATTTCAAGGGGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165977 TACAGCAGGTCCCCAAGTCACTCCAAGAACATGACTATTTCAAGGGGGGG
1700 . : . : . : . : . :
1575 ACTGATGCAGTGTGAGGAATTGATAGCGTATCTGCGG GATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
166027 ACTGATGCAGTGTGAGGAATTGATAGCGTATCTGCGGGTA...TAGGATG
1750 . : . : . : . : . :
1616 AATCTGAATTTAGAGACAAACTCACTCCAATTACTATTTTTATGGAATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168704 AATCTGAATTTAGAGACAAACTCACTCCAATTACTATTTTTATGGAATAT
1800 . : . : . : . : . :
1666 CGGTTGGATTATAGAACAGCTGCTGATACAACAGGCTTGCAACCCATTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168754 CGGTTGGATTATAGAACAGCTGCTGATACAACAGGCTTGCAACCCATTCT
1850 . : . : . : . : . :
1716 TAACCAGTTCACGCCTGCTAACATTAGTCGACAG GCTCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
168804 TAACCAGTTCACGCCTGCTAACATTAGTCGACAGGTA...TAGGCTCACA
1900 . : . : . : . : . :
1757 TTCTACTTGACTGTGGTGAAGACAATGTCTGTAAACCCAAGCTGGAAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173437 TTCTACTTGACTGTGGTGAAGACAATGTCTGTAAACCCAAGCTGGAAGTT
1950 . : . : . : . : . :
1807 TCTGTAGATAG TGATCAAAAGAAGATCTATATTGGGGATGA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
173487 TCTGTAGATAGGTA...TAGTGATCAAAAGAAGATCTATATTGGGGATGA
2000 . : . : . : . : . :
1848 CAACCCTCTGACATTGATTGTTAAGGCTCAGAATCAAGGAGAAGGTGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174186 CAACCCTCTGACATTGATTGTTAAGGCTCAGAATCAAGGAGAAGGTGCCT
2050 . : . : . : . : . :
1898 ACGAAGCTGAGCTCATCGTTTCCATTCCACTGCAGGCTGATTTCATCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174236 ACGAAGCTGAGCTCATCGTTTCCATTCCACTGCAGGCTGATTTCATCGGG
2100 . : . : . : . : . :
1948 GTTGTCCGAAACAATGAA GCCTTAGCAAGACTTTCCTGTGC
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
174286 GTTGTCCGAAACAATGAAGTA...AAGGCCTTAGCAAGACTTTCCTGTGC
2150 . : . : . : . : . :
1989 ATTTAAGACAGAAAACCAAACTCGCCAGGTGGTATGTGACCTTGGAAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174811 ATTTAAGACAGAAAACCAAACTCGCCAGGTGGTATGTGACCTTGGAAACC
2200 . : . : . : . : . :
2039 CAATGAAGGCTGGAACTCAA CTCTTAGCTGGTCTTCGTTTC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
174861 CAATGAAGGCTGGAACTCAAGTA...TAGCTCTTAGCTGGTCTTCGTTTC
2250 . : . : . : . : . :
2080 AGTGTGCACCAGCAGTCAGAGATGGATACTTCTGTGAAATTTGACTTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176387 AGTGTGCACCAGCAGTCAGAGATGGATACTTCTGTGAAATTTGACTTACA
2300 . : . : . : . : . :
2130 AATCCAAAG CTCAAATCTATTTGACAAAGTAAGCCCAGTTG
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
176437 AATCCAAAGGTA...CAGCTCAAATCTATTTGACAAAGTAAGCCCAGTTG
2350 . : . : . : . : . :
2171 TATCTCACAAAGTTGATCTTGCTGTTTTAGCTGCAGTTGAGATAAGAGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
176844 TATCTCACAAAGTTGATCTTGCTGTTTTAGCTGCAGTTGAGATAAGAGGG
2400 . : . : . : . : . :
2220 AGTCTCGAGTCCTGATCATATCTTTCTTCCGATTCCAAACTG
>>...>>>||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
176894 TC...TAGAGTCTCGAGTCCTGATCATGTCTTTCTTCCGATTCCAAACTG
2450 . : . : . : . : . :
2262 GGAGCACAAGGAGAACCCTGAGACTGAAGAAGATGTTGGGCCAGTTGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177375 GGAGCACAAGGAGAACCCTGAGACTGAAGAAGATGTTGGGCCAGTTGTTC
2500 . : . : . : . : . :
2312 AGCACATCTATGAG CTGAGAAACAATGGTCCAAGTTCATTC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
177425 AGCACATCTATGAGGTT...TAGCTGAGAAACAATGGTCCAAGTTCATTC
2550 . : . : . : . : . :
2353 AGCAAGGCAATGCTCCATCTTCAGTGGCCTTACAAATATAATAATAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178451 AGCAAGGCAATGCTCCATCTTCAGTGGCCTTACAAATATAATAATAACAC
2600 . : . : . : . : . :
2403 TCTGTTGTATATCCTTCATTATGATATTGATGGACCAATGAACTGCACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178501 TCTGTTGTATATCCTTCATTATGATATTGATGGACCAATGAACTGCACTT
2650 . : . : . : . : . :
2453 CAGATATGGAGATCAACCCTTTGAGAATTAAG ATCTCATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
178551 CAGATATGGAGATCAACCCTTTGAGAATTAAGGTA...TAGATCTCATCT
2700 . : . : . : . : . :
2494 TTGCAAACAACTGAAAAGAATGACACGGTTGCCGGGCAAGGTGAGCGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
179372 TTGCAAACAACTGAAAAGAATGACACGGTTGCCGGGCAAGGTGAGCGGGA
2750 . : . : . : . : . :
2544 CCATCTCATCACTAAGCGGGATCTTGCCCTCAGTGAAGGAGATATTCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
179422 CCATCTCATCACTAAGCGGGATCTTGCCCTCAGTGAAGGAGATATTCACA
2800 . : . : . : . : . :
2594 CTTTG GGTTGTGGAGTTGCTCAGTGCTTGAAGATTGTCTGC
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
179472 CTTTGGTA...CAGGGTTGTGGAGTTGCTCAGTGCTTGAAGATTGTCTGC
2850 . : . : . : . : . :
2635 CAAGTTGGGAGATTAGACAGAGGAAAGAGTGCAATCTTGTACGTAAAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185302 CAAGTTGGGAGATTAGACAGAGGAAAGAGTGCAATCTTGTACGTAAAGTC
2900 . : . : . : . : . :
2685 ATTACTGTGGACTGAGACTTTTATGAAT AAAGAAAATCAGA
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
185352 ATTACTGTGGACTGAGACTTTTATGAATGTA...CAGAAAGAAAATCAGA
2950 . : . : . : . : . :
2726 ATCATTCCTATTCTCTGAAGTCGTCTGCTTCATTTAATGTCATAGAGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185495 ATCATTCCTATTCTCTGAAGTCGTCTGCTTCATTTAATGTCATAGAGTTT
3000 . : . : . : . : . :
2776 CCTTATAAGAATCTTCCAATTGAGGATATCACCAACTCCACATTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
185545 CCTTATAAGAATCTTCCAATTGAGGATATCACCAACTCCACATTGGTA..
3050 . : . : . : . : . :
2821 GTTACCACTAATGTCACCTGGGGCATTCAGCCAGCGCCCATGCCTG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185595 .TAGGTTACCACTAATGTCACCTGGGGCATTCAGCCAGCGCCCATGCCTG
3100 . : . : . : . : . :
2867 TGCCTGTGTGGGTGATCATTTTAGCAGTTCTAGCAGGATTGTTGCTACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186521 TGCCTGTGTGGGTGATCATTTTAGCAGTTCTAGCAGGATTGTTGCTACTG
3150 . : . : . : . : . :
2917 GCTGTTTTGGTATTTGTAATGTACAGG ATGGGCTTTTTTAA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
186571 GCTGTTTTGGTATTTGTAATGTACAGGGTA...CAGATGGGCTTTTTTAA
3200 . : . : . : . : . :
2958 ACGGGTCCGGCCACCTCAAGAAGAACAAGAAAGGGAGCAGCTTCAACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186873 ACGGGTCCGGCCACCTCAAGAAGAACAAGAAAGGGAGCAGCTTCAACCTC
3250 . : . : .
3008 ATGAAAATGGTGAAGGAAACTCAGAAACT
|||||||||||||||||||||||||||||
186923 ATGAAAATGGTGAAGGAAACTCAGAAACT