seq1 = pF1KB5605.tfa, 1725 bp
seq2 = pF1KB5605/gi568815578r_22947780.tfa (gi568815578r:22947780_23149504), 201725 bp

>pF1KB5605 1725
>gi568815578r:22947780_23149504 (Chr20)

(complement)

1-1725  (100001-101725)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTGGGGTCCTGGTCCTTGGCGCGCTGGCCCTGGCCGGCCTGGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTGGGGTCCTGGTCCTTGGCGCGCTGGCCCTGGCCGGCCTGGGGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGCACCCGCAGAGCCGCAGCCGGGTGGCAGCCAGTGCGTCGAGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCGCACCCGCAGAGCCGCAGCCGGGTGGCAGCCAGTGCGTCGAGCACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGCTTCGCGCTCTACCCGGGCCCCGCGACCTTCCTCAATGCCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGCTTCGCGCTCTACCCGGGCCCCGCGACCTTCCTCAATGCCAGTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTGCGACGGACTGCGGGGCCACCTAATGACAGTGCGCTCCTCGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCTGCGACGGACTGCGGGGCCACCTAATGACAGTGCGCTCCTCGGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCCGATGTCATTTCCTTGCTACTGAACGGCGACGGCGGCGTTGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCCGATGTCATTTCCTTGCTACTGAACGGCGACGGCGGCGTTGGCCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCGCCTCTGGATCGGCCTGCAGCTGCCACCCGGCTGCGGCGACCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCGCCTCTGGATCGGCCTGCAGCTGCCACCCGGCTGCGGCGACCCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCCTCGGGCCCCTGCGCGGCTTCCAGTGGGTTACGGGAGACAACAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCCTCGGGCCCCTGCGCGGCTTCCAGTGGGTTACGGGAGACAACAACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCTATAGCAGGTGGGCACGGCTCGACCTCAATGGGGCTCCCCTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCTATAGCAGGTGGGCACGGCTCGACCTCAATGGGGCTCCCCTCTGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCCGTTGTGCGTCGCTGTCTCCGCTGCTGAGGCCACTGTGCCCAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCCGTTGTGCGTCGCTGTCTCCGCTGCTGAGGCCACTGTGCCCAGCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCGATCTGGGAGGAGCAGCAGTGCGAAGTGAAGGCCGATGGCTTCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCGATCTGGGAGGAGCAGCAGTGCGAAGTGAAGGCCGATGGCTTCCTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGAGTTCCACTTCCCAGCCACCTGCAGGCCACTGGCTGTGGAGCCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGAGTTCCACTTCCCAGCCACCTGCAGGCCACTGGCTGTGGAGCCCGGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGCGGCTGCCGCCGTCTCGATCACCTACGGCACCCCGTTCGCGGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGCGGCTGCCGCCGTCTCGATCACCTACGGCACCCCGTTCGCGGCCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGAGCGGACTTCCAGGCGCTGCCGGTGGGCAGCTCCGCCGCGGTGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGAGCGGACTTCCAGGCGCTGCCGGTGGGCAGCTCCGCCGCGGTGGCTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTCGGCTTACAGCTAATGTGCACCGCGCCGCCCGGAGCGGTCCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTCGGCTTACAGCTAATGTGCACCGCGCCGCCCGGAGCGGTCCAGGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACTGGGCCAGGGAGGCGCCGGGCGCTTGGGACTGCAGCGTGGAGAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACTGGGCCAGGGAGGCGCCGGGCGCTTGGGACTGCAGCGTGGAGAACGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCTGCGAGCACGCGTGCAATGCGATCCCTGGGGCTCCCCGCTGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCTGCGAGCACGCGTGCAATGCGATCCCTGGGGCTCCCCGCTGCCAGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCAGCCGGCGCCGCCCTGCAGGCAGACGGGCGCTCCTGCACCGCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCCAGCCGGCGCCGCCCTGCAGGCAGACGGGCGCTCCTGCACCGCATCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGACGCAGTCCTGCAACGACCTCTGCGAGCACTTCTGCGTTCCCAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CGACGCAGTCCTGCAACGACCTCTGCGAGCACTTCTGCGTTCCCAACCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GACCAGCCGGGCTCCTACTCGTGCATGTGCGAGACCGGCTACCGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GACCAGCCGGGCTCCTACTCGTGCATGTGCGAGACCGGCTACCGGCTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGCCGACCAACACCGGTGCGAGGACGTGGATGACTGCATACTGGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGCCGACCAACACCGGTGCGAGGACGTGGATGACTGCATACTGGAGCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GTCCGTGTCCGCAGCGCTGTGTCAACACACAGGGTGGCTTCGAGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GTCCGTGTCCGCAGCGCTGTGTCAACACACAGGGTGGCTTCGAGTGCCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TGCTACCCTAACTACGACCTGGTGGACGGCGAGTGTGTGGAGCCCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TGCTACCCTAACTACGACCTGGTGGACGGCGAGTGTGTGGAGCCCGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCCGTGCTTCAGAGCCAACTGCGAGTACCAGTGCCAGCCCCTGAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCCGTGCTTCAGAGCCAACTGCGAGTACCAGTGCCAGCCCCTGAACCAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTAGCTACCTCTGCGTCTGCGCCGAGGGCTTCGCGCCCATTCCCCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTAGCTACCTCTGCGTCTGCGCCGAGGGCTTCGCGCCCATTCCCCACGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCGCACAGGTGCCAGATGTTTTGCAACCAGACTGCCTGTCCAGCCGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCGCACAGGTGCCAGATGTTTTGCAACCAGACTGCCTGTCCAGCCGACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CGACCCCAACACCCAGGCTAGCTGTGAGTGCCCTGAAGGCTACATCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CGACCCCAACACCCAGGCTAGCTGTGAGTGCCCTGAAGGCTACATCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACGACGGTTTCATCTGCACGGACATCGACGAGTGCGAAAACGGCGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACGACGGTTTCATCTGCACGGACATCGACGAGTGCGAAAACGGCGGCTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TGCTCCGGGGTGTGCCACAACCTCCCCGGTACCTTCGAGTGCATCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TGCTCCGGGGTGTGCCACAACCTCCCCGGTACCTTCGAGTGCATCTGCGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GCCCGACTCGGCCCTTGCCCGCCACATTGGCACCGACTGTGACTCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCCCGACTCGGCCCTTGCCCGCCACATTGGCACCGACTGTGACTCCGGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGGTGGACGGTGGCGACAGCGGCTCTGGCGAGCCCCCGCCCAGCCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGGTGGACGGTGGCGACAGCGGCTCTGGCGAGCCCCCGCCCAGCCCGACG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CCCGGCTCCACCTTGACTCCTCCGGCCGTGGGGCTCGTGCATTCGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CCCGGCTCCACCTTGACTCCTCCGGCCGTGGGGCTCGTGCATTCGGGCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GCTCATAGGCATCTCCATCGCGAGCCTGTGCCTGGTGGTGGCGCTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GCTCATAGGCATCTCCATCGCGAGCCTGTGCCTGGTGGTGGCGCTTTTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CGCTCCTCTGCCACCTGCGCAAGAAGCAGGGCGCCGCCAGGGCCAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CGCTCCTCTGCCACCTGCGCAAGAAGCAGGGCGCCGCCAGGGCCAAGATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GAGTACAAGTGCGCGGCCCCTTCCAAGGAGGTAGTGCTGCAGCACGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GAGTACAAGTGCGCGGCCCCTTCCAAGGAGGTAGTGCTGCAGCACGTGCG

   1700     .    :    .    :    .
   1701 GACCGAGCGGACGCCGCAGAGACTC
        |||||||||||||||||||||||||
 101701 GACCGAGCGGACGCCGCAGAGACTC