seq1 = pF1KB5599.tfa, 2796 bp
seq2 = pF1KB5599/gi568815597r_184594066.tfa (gi568815597r:184594066_184854646), 260581 bp

>pF1KB5599 2796
>gi568815597r:184594066_184854646 (Chr1)

(complement)

1-158  (100001-100158)   100% ->
159-204  (105055-105100)   100% ->
205-305  (116936-117036)   100% ->
306-345  (117583-117622)   100% ->
346-458  (120004-120116)   100% ->
459-612  (121657-121810)   100% ->
613-747  (128258-128392)   100% ->
748-853  (130791-130896)   100% ->
854-951  (133261-133358)   100% ->
952-1077  (135079-135204)   100% ->
1078-1161  (135402-135485)   100% ->
1162-1245  (137024-137107)   100% ->
1246-1370  (137635-137759)   100% ->
1371-1536  (142049-142214)   100% ->
1537-1691  (142770-142924)   100% ->
1692-1845  (144100-144253)   100% ->
1846-2037  (146303-146494)   100% ->
2038-2203  (147839-148004)   100% ->
2204-2389  (151651-151836)   100% ->
2390-2796  (160175-160581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGAAGCCGGCGGCCGGGGCTGTGGGTCCCCGGTTCCCCAGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGAAGCCGGCGGCCGGGGCTGTGGGTCCCCGGTTCCCCAGCGAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGATGGAGACTAGTGGCGGCGACGGCCGCGTTCTGCCTGGTGTCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGATGGAGACTAGTGGCGGCGACGGCCGCGTTCTGCCTGGTGTCGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCCGTGTGGACGGCGGGGGCCGAGCCCATGAGTAGGGAGGAGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCCGTGTGGACGGCGGGGGCCGAGCCCATGAGTAGGGAGGAGAAACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCTTGG         GAATCAAGTACTGGAAATGTTTGATCATGCTTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGCTTGGGTA...TAGGAATCAAGTACTGGAAATGTTTGATCATGCTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGTAACTATATG         GAACATGCTTACCCTGCTGATGAACTCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105088 TGGTAACTATATGGTA...CAGGAACATGCTTACCCTGCTGATGAACTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCCTTTAACCTGTAGAGGTCGAGTTAGAGGCCAAGAGCCAAGTCGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116964 TGCCTTTAACCTGTAGAGGTCGAGTTAGAGGCCAAGAGCCAAGTCGCGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACGTTGATGATGCCTTGGGAAA         ATTTTCTCTGACACTGAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 117014 GACGTTGATGATGCCTTGGGAAAGTG...TAGATTTTCTCTGACACTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGATTCTTTGGACACTCTTGTG         GTTTTAAATAAAACTAAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 117601 TGATTCTTTGGACACTCTTGTGGTA...CAGGTTTTAAATAAAACTAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AATTTGAAGATGCAGTGAGAAAAGTTTTAAGAGATGTTAATTTAGATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120023 AATTTGAAGATGCAGTGAGAAAAGTTTTAAGAGATGTTAATTTAGATAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GATGTAGTCGTATCAGTCTTTGAAACAAACATCAGAGTTCTTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 120073 GATGTAGTCGTATCAGTCTTTGAAACAAACATCAGAGTTCTTGGGTA...

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    459    GGGTCTTTTGGGTGGGCACTCCCTGGCAATCATGCTGAAAGAAAAAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121654 TAGGGGTCTTTTGGGTGGGCACTCCCTGGCAATCATGCTGAAAGAAAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTGAATATATGCAGTGGTACAATGATGAACTTCTCCAAATGGCAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121704 GTGAATATATGCAGTGGTACAATGATGAACTTCTCCAAATGGCAAAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTAGGTTACAAACTTTTACCGGCTTTCAACACTACCAGTGGCCTTCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121754 TTAGGTTACAAACTTTTACCGGCTTTCAACACTACCAGTGGCCTTCCTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCCAAGA         ATTAATTTAAAGTTTGGCATCAGAAAACCAGAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121804 TCCAAGAGTA...CAGATTAATTTAAAGTTTGGCATCAGAAAACCAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTCGGACAGGAACTGAGACAGATACCTGTACAGCTTGTGCAGGTACCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128292 CTCGGACAGGAACTGAGACAGATACCTGTACAGCTTGTGCAGGTACCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATCCTTGAATTTGCTGCTTTAAGTCGATTCACAGGAGCAACAATATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128342 ATCCTTGAATTTGCTGCTTTAAGTCGATTCACAGGAGCAACAATATTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 G         GAATATGCCAGAAAAGCTCTTGATTTTCTCTGGGAAAAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128392 GGTT...CAGGAATATGCCAGAAAAGCTCTTGATTTTCTCTGGGAAAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GACAGCGAAGTAGTAATTTAGTGGGCGTGACTATAAATATTCATACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130831 GACAGCGAAGTAGTAATTTAGTGGGCGTGACTATAAATATTCATACTGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GATTGGGTACGAAAAG         ATAGTGGAGTTGGAGCAGGGATTGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 130881 GATTGGGTACGAAAAGGTA...TAGATAGTGGAGTTGGAGCAGGGATTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TTCATATTATGAATATCTGTTGAAAGCCTATGTCTTGCTTGGAGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133286 TTCATATTATGAATATCTGTTGAAAGCCTATGTCTTGCTTGGAGATGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GTTTTCTGGAAAGATTTAACACA         CACTATGATGCCATAATG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 133336 GTTTTCTGGAAAGATTTAACACAGTA...TAGCACTATGATGCCATAATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AGGTATATTAGCCAGCCACCTCTTCTACTTGATGTGCATATCCACAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135097 AGGTATATTAGCCAGCCACCTCTTCTACTTGATGTGCATATCCACAAACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AATGCTGAATGCTCGGACTTGGATGGATGCTTTGCTTGCCTTCTTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135147 AATGCTGAATGCTCGGACTTGGATGGATGCTTTGCTTGCCTTCTTCCCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCTTGCAG         GTGTTAAAGGGGGATATTAGACCTGCTATTGAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 135197 GCTTGCAGGTA...TAGGTGTTAAAGGGGGATATTAGACCTGCTATTGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 ACTCATGAAATGTTATATCAGGTGATTAAAAAACACAATTTTCTACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135435 ACTCATGAAATGTTATATCAGGTGATTAAAAAACACAATTTTCTACCAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 G         GCATTTACCACAGATTTCAGAGTACACTGGGCTCAACATC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135485 GGTA...CAGGCATTTACCACAGATTTCAGAGTACACTGGGCTCAACATC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CTTTAAGGCCAGAATTTGCAGAAAGTACCTACTTCTTATATAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 137064 CTTTAAGGCCAGAATTTGCAGAAAGTACCTACTTCTTATATAAAGTA...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1246    GCTACAGGAGATCCTTACTACCTTGAAGTAGGGAAGACACTTATTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137632 TAGGCTACAGGAGATCCTTACTACCTTGAAGTAGGGAAGACACTTATTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 AAATTTAAATAAATATGCTAGAGTGCCTTGCGGATTTGCTGCCATGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137682 AAATTTAAATAAATATGCTAGAGTGCCTTGCGGATTTGCTGCCATGAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ATGTTCGTACTGGAAGTCATGAGGACAG         AATGGATTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 137732 ATGTTCGTACTGGAAGTCATGAGGACAGGTA...TAGAATGGATTCTTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 TTCTTGGCTGAAATGTTTAAATATCTTTACCTGTTATTTGCTGATAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142062 TTCTTGGCTGAAATGTTTAAATATCTTTACCTGTTATTTGCTGATAAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AGACATTATTTTTGACATAGAAGATTACATCTTTACAACAGAAGCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142112 AGACATTATTTTTGACATAGAAGATTACATCTTTACAACAGAAGCTCATC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TGTTACCTCTTTGGCTCTCTACTACAAATCAAAGCATCTCTAAAAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142162 TGTTACCTCTTTGGCTCTCTACTACAAATCAAAGCATCTCTAAAAAGAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ACA         ACCTCGGAATATACAGAACTGGATGACAGTAACTTCGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142212 ACAGTG...TAGACCTCGGAATATACAGAACTGGATGACAGTAACTTCGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TTGGACTTGTCCAAATACTCAGATCCTCTTTCCTAATGACCCATTGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142808 TTGGACTTGTCCAAATACTCAGATCCTCTTTCCTAATGACCCATTGTATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CTCAAAGTATTCGTGAGCCCTTGAAAAATGTGGTGGATAAGAGCTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142858 CTCAAAGTATTCGTGAGCCCTTGAAAAATGTGGTGGATAAGAGCTGTCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 AGAGGCATCATCAGAGT         AGAGGAGAGTTTCAGGAGTGGAGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 142908 AGAGGCATCATCAGAGTGTA...CAGAGAGGAGAGTTTCAGGAGTGGAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 TAAACCCCCTCTGAGAGCCAGAGATTTCATGGCCACTAACCCTGAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144124 TAAACCCCCTCTGAGAGCCAGAGATTTCATGGCCACTAACCCTGAGCATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TAGAAATCCTGAAGAAGATGGGGGTGAGTTTGATTCACCTCAAAGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144174 TAGAAATCCTGAAGAAGATGGGGGTGAGTTTGATTCACCTCAAAGATGGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AGAGTCCAGTTGGTCCAACATGCAATCCAA         GCTGCTAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 144224 AGAGTCCAGTTGGTCCAACATGCAATCCAAGTA...TAGGCTGCTAGTTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 AATCGACGCTGAAGATGGGTTGAGGTTCATGCAGGAGATGATTGAATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146314 AATCGACGCTGAAGATGGGTTGAGGTTCATGCAGGAGATGATTGAATTGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CAAGTCAGCAACAAAAAGAACAGCAGCTGCCTCCACGAGCTGTACAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146364 CAAGTCAGCAACAAAAAGAACAGCAGCTGCCTCCACGAGCTGTACAAATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GTTTCCCACCCATTTTTTGGCAGGGTAGTATTGACTGCTGGACCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146414 GTTTCCCACCCATTTTTTGGCAGGGTAGTATTGACTGCTGGACCAGCTCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 GTTTGGGCTGGATCTGTCTAAACATAAAGAG         ACAAGAGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 146464 GTTTGGGCTGGATCTGTCTAAACATAAAGAGGTA...CAGACAAGAGGAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 TTGTTGCAAGCAGTAAACCATCCAATGGTTGTTCAGAGCTTACTAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147849 TTGTTGCAAGCAGTAAACCATCCAATGGTTGTTCAGAGCTTACTAACCCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAGGCAGTGATGGGAAAAATCGCACTGATACAAAGAGGACAGTGCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147899 GAGGCAGTGATGGGAAAAATCGCACTGATACAAAGAGGACAGTGCATGTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TGCAGAAAAGGCACGCAACATCCAGAATGCTGGAGCCATTGGTGGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147949 TGCAGAAAAGGCACGCAACATCCAGAATGCTGGAGCCATTGGTGGCATTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TTATTG         ATGACAATGAGGGGAGCAGCAGTGATACTGCCCCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147999 TTATTGGTA...TAGATGACAATGAGGGGAGCAGCAGTGATACTGCCCCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 CTGTTCCAGATGGCAGGTGATGGAAAGGATACAGATGACATCAAGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151686 CTGTTCCAGATGGCAGGTGATGGAAAGGATACAGATGACATCAAGATCCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 CATGCTGTTCTTATTCAGCAAAGAAGGAAGTATCATACTGGATGCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151736 CATGCTGTTCTTATTCAGCAAAGAAGGAAGTATCATACTGGATGCCATCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 GGGAATATGAGGAGGTAGAAGTGCTCCTCTCTGATAAAGCAAAAGATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151786 GGGAATATGAGGAGGTAGAAGTGCTCCTCTCTGATAAAGCAAAAGATCGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 G         ATCCTGAAATGGAAAATGAAGAACAACCATCCTCTGAAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151836 GGTA...CAGATCCTGAAATGGAAAATGAAGAACAACCATCCTCTGAAAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 TGATTCTCAGAATCAGAGTGGTGAACAGATTTCATCAAGTTCTCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160215 TGATTCTCAGAATCAGAGTGGTGAACAGATTTCATCAAGTTCTCAGGAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 TTGATTTGGTTGATCAAGAGTCTTCTGAGGAAAATTCTCTAAATTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160265 TTGATTTGGTTGATCAAGAGTCTTCTGAGGAAAATTCTCTAAATTCTCAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CCAGAATCATTATCTCTAGCAGATATGGACAATGCTGCAAGCATTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160315 CCAGAATCATTATCTCTAGCAGATATGGACAATGCTGCAAGCATTTCCCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 TTCTGAACAGACTTCTAATCCCACAGAAAACCATGAGACTACAAATCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160365 TTCTGAACAGACTTCTAATCCCACAGAAAACCATGAGACTACAAATCTTA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 ATGGTGAATGTACAGATTTAGATAACCAGCTTCAAGAACAATCAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160415 ATGGTGAATGTACAGATTTAGATAACCAGCTTCAAGAACAATCAGAAACT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 GAGGAAGATTCCAATCCTAATGTTAGCTGGGGTAAAAAGGTCCAGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160465 GAGGAAGATTCCAATCCTAATGTTAGCTGGGGTAAAAAGGTCCAGCCTAT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 AGACTCCATATTAGCAGACTGGAATGAAGATATAGAAGCATTTGAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160515 AGACTCCATATTAGCAGACTGGAATGAAGATATAGAAGCATTTGAAATGA

   2950     .    :    .
   2780 TGGAGAAGGATGAGCTA
        |||||||||||||||||
 160565 TGGAGAAGGATGAGCTA