seq1 = pF1KB5597.tfa, 1386 bp
seq2 = pF1KB5597/gi568815586r_49458646.tfa (gi568815586r:49458646_49666217), 207572 bp

>pF1KB5597 1386
>gi568815586r:49458646_49666217 (Chr12)

(complement)

9-149  (100001-100141)   100% ->
150-288  (100551-100689)   100% ->
289-447  (101323-101481)   100% ->
448-557  (101628-101737)   100% ->
558-666  (102672-102780)   100% ->
667-805  (103079-103217)   100% ->
806-881  (105848-105923)   100% ->
882-910  (106251-106279)   100% ->
911-1003  (106397-106489)   100% ->
1004-1086  (106683-106765)   100% ->
1087-1174  (106917-107004)   100% ->
1175-1302  (107248-107375)   100% ->
1303-1386  (107489-107572)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      9 AGATTCTCAGGGGCTGCTAGATTCATCCCTGATGGCATCAGGCACTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 AGATTCTCAGGGGCTGCTAGATTCATCCCTGATGGCATCAGGCACTGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     59 GCCGCTCAGAGGATGAGGAGTCACTGGCAGGGCAGAAGCGAGCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCTCAGAGGATGAGGAGTCACTGGCAGGGCAGAAGCGAGCCTCCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    109 CAGGCCTTGGGCACCATCCCTAAACGGAGAAGCTCCTCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100101 CAGGCCTTGGGCACCATCCCTAAACGGAGAAGCTCCTCCAGGTA...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    150 GTTCATCAAGAGGAAGAAGTTCGATGATGAGCTGGTGGAGAGCAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTTCATCAAGAGGAAGAAGTTCGATGATGAGCTGGTGGAGAGCAGCCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200 CAAAATCTTCTACCCGGGCAAAGGGGGCCAGTGGGGTGGAACCAGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAAAATCTTCTACCCGGGCAAAGGGGGCCAGTGGGGTGGAACCAGGGCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    250 TGTTCGGGGAGTGAACCCTCCTCCAGTGAGAAGAAGAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100651 TGTTCGGGGAGTGAACCCTCCTCCAGTGAGAAGAAGAAGGTG...CAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291 ATCCAAAGCCCCCAGCACTCCTGTGCCACCCAGCCCAGCCCCAGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101325 ATCCAAAGCCCCCAGCACTCCTGTGCCACCCAGCCCAGCCCCAGCCCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341 GACTCACCAAGCGTGTGAAGAAGAGTAAACAGCCACTTCAGGTGACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101375 GACTCACCAAGCGTGTGAAGAAGAGTAAACAGCCACTTCAGGTGACCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391 GATCTGGGCCGCTGGAAGCCTGCAGATGACCTCCTGCTCATAAATGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101425 GATCTGGGCCGCTGGAAGCCTGCAGATGACCTCCTGCTCATAAATGCTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    441 GTTGCAG         ACCAACGACCTGACCTCCGTCCACCTGGGCGTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101475 GTTGCAGGTA...CAGACCAACGACCTGACCTCCGTCCACCTGGGCGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482 AATTCAGCTGCCGCTTCACCCTTCGGGAGGTCCAGGAGCGTTGGTACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101662 AATTCAGCTGCCGCTTCACCCTTCGGGAGGTCCAGGAGCGTTGGTACGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    532 CTGCTCTACGATCCTGTCATCTCCAA         GTTGGCCTGTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101712 CTGCTCTACGATCCTGTCATCTCCAAGTG...CAGGTTGGCCTGTCAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    573 CATGAGGCAGCTGCACCCAGAGGCTATTGCAGCCATCCAGAGCAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102687 CATGAGGCAGCTGCACCCAGAGGCTATTGCAGCCATCCAGAGCAAGGCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    623 TGTTTAGCAAGGCTGAGGAGCAGCTGCTGAGCAAAGTGGGATCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102737 TGTTTAGCAAGGCTGAGGAGCAGCTGCTGAGCAAAGTGGGATCGGTA...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    667    ACCAGCCAGCCCACCTTGGAGACCTTCCAGGACCTGCTGCACAGACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103076 TAGACCAGCCAGCCCACCTTGGAGACCTTCCAGGACCTGCTGCACAGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    714 CCCTGATGCCTTCTACCTGGCCCGTACCGCGAAGGCCCTGCAGGCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103126 CCCTGATGCCTTCTACCTGGCCCGTACCGCGAAGGCCCTGCAGGCCCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    764 GGCAGCTCATGAAGCAGTATTACCTGCTGGAGGACCAGACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103176 GGCAGCTCATGAAGCAGTATTACCTGCTGGAGGACCAGACAGGTA...CA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806  TGCAGCCGCTGCCCAAAGGGGACCAAGTGCTGAACTTCTCTGATGCAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105847 GTGCAGCCGCTGCCCAAAGGGGACCAAGTGCTGAACTTCTCTGATGCAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    855 GGACCTGATTGATGACAGTAAGCTCAA         GGACATGCGAGATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105897 GGACCTGATTGATGACAGTAAGCTCAAGTG...CAGGGACATGCGAGATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    896 AGGTCCTGGAACATG         AGCTGATGGTGGCTGACCGGCGCCAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106265 AGGTCCTGGAACATGGTA...CAGAGCTGATGGTGGCTGACCGGCGCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    937 AAGCGAGAGATTCGGCAGCTGGAACAGGAACTGCATAAGTGGCAGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106423 AAGCGAGAGATTCGGCAGCTGGAACAGGAACTGCATAAGTGGCAGGTGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    987 AGTGGACAGCATCACAG         GCATGAGCTCTCCGGACTTCGACA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106473 AGTGGACAGCATCACAGGTG...CAGGCATGAGCTCTCCGGACTTCGACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1028 ACCAGACACTGGCAGTGCTGCGGGGCCGCATGGTGCGGTACCTGATGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106707 ACCAGACACTGGCAGTGCTGCGGGGCCGCATGGTGCGGTACCTGATGCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1078 TCGCGTGAG         ATCACCCTGGGCAGAGCAACCAAGGATAACCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106757 TCGCGTGAGGTG...CAGATCACCCTGGGCAGAGCAACCAAGGATAACCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1119 GATTGATGTGGACCTGTCTCTGGAGGGTCCGGCCTGGAAGATATCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106949 GATTGATGTGGACCTGTCTCTGGAGGGTCCGGCCTGGAAGATATCCCGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1169 AACAAG         GTGTCATCAAGCTGAAGAACAACGGTGATTTCTTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106999 AACAAGGTA...CAGGTGTCATCAAGCTGAAGAACAACGGTGATTTCTTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1210 ATTGCCAATGAGGGTCGACGGCCCATCTACATCGATGGACGGCCGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107283 ATTGCCAATGAGGGTCGACGGCCCATCTACATCGATGGACGGCCGGTGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1260 CTGTGGCTCCAAATGGCGCCTCAGCAACAACTCTGTGGTGGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 107333 CTGTGGCTCCAAATGGCGCCTCAGCAACAACTCTGTGGTGGAGGTG...C

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1303   ATCGCCAGCCTGCGATTCGTCTTCCTTATCAACCAGGACCTCATTGCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107487 AGATCGCCAGCCTGCGATTCGTCTTCCTTATCAACCAGGACCTCATTGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .
   1351 CTCATCAGGGCTGAGGCTGCCAAGATCACACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107537 CTCATCAGGGCTGAGGCTGCCAAGATCACACCACAG