seq1 = pF1KB5576.tfa, 492 bp
seq2 = pF1KB5576/gi568815592f_36584102.tfa (gi568815592f:36584102_36785797), 201696 bp

>pF1KB5576 492
>gi568815592f:36584102_36785797 (Chr6)

1-445  (100001-100445)   99% ->
446-492  (101650-101696)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGAACCGGCTGGGGATGTCCGTCAGAACCCATGCGGCAGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGAACCGGCTGGGGATGTCCGTCAGAACCCATGCGGCAGCAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCGCCGCCTCTTCGGCCCAGTGGACAGCGACCAGCTGAGACGCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
 100051 CTGCCGCCGCCTCTTCGGCCCAGTGGACAGCGAGCAGCTGAGCCGCGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGATGCGCTAATGGCGGGCTGCATCCAGGAGGCCCGTGAGCGATGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGATGCGCTAATGGCGGGCTGCATCCAGGAGGCCCGTGAGCGATGGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGACTTTGTCACCGAGACACCACTGGAGGGTGACTTCGCCTGGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCGACTTTGTCACCGAGACACCACTGGAGGGTGACTTCGCCTGGGAGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGCGGGGCCTTGGCCTGCCCAAGCTCTACCTTCCCACGGGGCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTGCGGGGCCTTGGCCTGCCCAAGCTCTACCTTCCCACGGGGCCCCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGGCCGGGATGAGTTGGGAGGAGGCAGGCGGCCTGGCACCTCACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGGCCGGGATGAGTTGGGAGGAGGCAGGCGGCCTGGCACCTCACCTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTGCAGGGGACAGCAGAGGAAGACCATGTGGACCTGTCACTGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTGCAGGGGACAGCAGAGGAAGACCATGTGGACCTGTCACTGTCTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TACCCTTGTGCCTCGCTCAGGGGAGCAGGCTGAAGGGTCCCCAGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TACCCTTGTGCCTCGCTCAGGGGAGCAGGCTGAAGGGTCCCCAGGTGGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGGAGACTCTCAGGGTCGAAAACGGCGGCAGACCAGCATGACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100401 CTGGAGACTCTCAGGGTCGAAAACGGCGGCAGACCAGCATGACAGGTG..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    446     ATTTCTACCACTCCAAACGCCGGCTGATCTTCTCCAAGAGGAAGCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 .CAGATTTCTACCACTCCAAACGCCGGCTGATCTTCTCCAAGAGGAAGCC

    500 
    492 C
        |
 101696 C