seq1 = pF1KB5569.tfa, 1407 bp
seq2 = pF1KB5569/gi568815587r_102690415.tfa (gi568815587r:102690415_102898092), 207678 bp

>pF1KB5569 1407
>gi568815587r:102690415_102898092 (Chr11)

(complement)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-350  (100593-100837)   100% ->
351-499  (100931-101079)   100% ->
500-625  (101304-101429)   100% ->
626-781  (102486-102641)   99% ->
782-899  (102802-102919)   100% ->
900-1033  (105355-105488)   100% ->
1034-1196  (106598-106760)   100% ->
1197-1300  (107287-107390)   100% ->
1301-1407  (107572-107678)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACAGCTTTCCTCCACTGCTGCTGCTGCTGTTCTGGGGTGTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACAGCTTTCCTCCACTGCTGCTGCTGCTGTTCTGGGGTGTGGTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCACAGCTTCCCAGCGACTCTAGAAACACAAGAGCAAGATGTGGACTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCACAGCTTCCCAGCGACTCTAGAAACACAAGAGCAAGATGTGGACTTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCAG         AAATACCTGGAAAAATACTACAACCTGAAGAATGAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCAGGTA...CAGAAATACCTGGAAAAATACTACAACCTGAAGAATGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAGGCAAGTTGAAAAGCGGAGAAATAGTGGCCCAGTGGTTGAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100629 GGGAGGCAAGTTGAAAAGCGGAGAAATAGTGGCCCAGTGGTTGAAAAATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGCAAATGCAGGAATTCTTTGGGCTGAAAGTGACTGGGAAACCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100679 GAAGCAAATGCAGGAATTCTTTGGGCTGAAAGTGACTGGGAAACCAGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGAAACCCTGAAGGTGATGAAGCAGCCCAGATGTGGAGTGCCTGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100729 CTGAAACCCTGAAGGTGATGAAGCAGCCCAGATGTGGAGTGCCTGATGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTCAGTTTGTCCTCACTGAGGGGAACCCTCGCTGGGAGCAAACACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100779 GCTCAGTTTGTCCTCACTGAGGGGAACCCTCGCTGGGAGCAAACACATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACCTACAG         GATTGAAAATTACACGCCAGATTTGCCAAGAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100829 GACCTACAGGTA...AAGGATTGAAAATTACACGCCAGATTTGCCAAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAGATGTGGACCATGCCATTGAGAAAGCCTTCCAACTCTGGAGTAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100963 CAGATGTGGACCATGCCATTGAGAAAGCCTTCCAACTCTGGAGTAATGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACACCTCTGACATTCACCAAGGTCTCTGAGGGTCAAGCAGACATCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101013 ACACCTCTGACATTCACCAAGGTCTCTGAGGGTCAAGCAGACATCATGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATCTTTTGTCAGGGGAG         ATCATCGGGACAACTCTCCTTTTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101063 ATCTTTTGTCAGGGGAGGTA...CAGATCATCGGGACAACTCTCCTTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGGACCTGGAGGAAATCTTGCTCATGCTTTTCAACCAGGCCCAGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101328 ATGGACCTGGAGGAAATCTTGCTCATGCTTTTCAACCAGGCCCAGGTATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGAGGGGATGCTCATTTTGATGAAGATGAAAGGTGGACCAACAATTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101378 GGAGGGGATGCTCATTTTGATGAAGATGAAAGGTGGACCAACAATTTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AG         AGTACAACTTACATCGTGTTGCGGCTCATGAACTCGGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 101428 AGGTA...TAGAGTACAACTTACATCGTGTTGCAGCTCATGAACTCGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATTCTCTTGGACTCTCCCATTCTACTGATATCGGGGCTTTGATGTACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102525 ATTCTCTTGGACTCTCCCATTCTACTGATATCGGGGCTTTGATGTACCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGCTACACCTTCAGTGGTGATGTTCAGCTAGCTCAGGATGACATTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102575 AGCTACACCTTCAGTGGTGATGTTCAGCTAGCTCAGGATGACATTGATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CATCCAAGCCATATATG         GACGTTCCCAAAATCCTGTCCAGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102625 CATCCAAGCCATATATGGTG...TAGGACGTTCCCAAAATCCTGTCCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCATCGGCCCACAAACCCCAAAAGCGTGTGACAGTAAGCTAACCTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102826 CCATCGGCCCACAAACCCCAAAAGCGTGTGACAGTAAGCTAACCTTTGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCTATAACTACGATTCGGGGAGAAGTGATGTTCTTTAAAGACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102876 GCTATAACTACGATTCGGGGAGAAGTGATGTTCTTTAAAGACAGGTA...

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    900    ATTCTACATGCGCACAAATCCCTTCTACCCGGAAGTTGAGCTCAATT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105352 CAGATTCTACATGCGCACAAATCCCTTCTACCCGGAAGTTGAGCTCAATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCATTTCTGTTTTCTGGCCACAACTGCCAAATGGGCTTGAAGCTGCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105402 TCATTTCTGTTTTCTGGCCACAACTGCCAAATGGGCTTGAAGCTGCTTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAATTTGCCGACAGAGATGAAGTCCGGTTTTTCAAAG         GGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105452 GAATTTGCCGACAGAGATGAAGTCCGGTTTTTCAAAGGTA...CAGGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TAAGTACTGGGCTGTTCAGGGACAGAATGTGCTACACGGATACCCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106602 TAAGTACTGGGCTGTTCAGGGACAGAATGTGCTACACGGATACCCCAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACATCTACAGCTCCTTTGGCTTCCCTAGAACTGTGAAGCATATCGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106652 ACATCTACAGCTCCTTTGGCTTCCCTAGAACTGTGAAGCATATCGATGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCTCTTTCTGAGGAAAACACTGGAAAAACCTACTTCTTTGTTGCTAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106702 GCTCTTTCTGAGGAAAACACTGGAAAAACCTACTTCTTTGTTGCTAACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 ATACTGGAG         GTATGATGAATATAAACGATCTATGGATCCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106752 ATACTGGAGGTA...CAGGTATGATGAATATAAACGATCTATGGATCCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTTATCCCAAAATGATAGCACATGACTTTCCTGGAATTGGCCACAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107319 GTTATCCCAAAATGATAGCACATGACTTTCCTGGAATTGGCCACAAAGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GATGCAGTTTTCATGAAAGATG         GATTTTTCTATTTCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 107369 GATGCAGTTTTCATGAAAGATGGTA...TAGGATTTTTCTATTTCTTTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGGAACAAGACAATACAAATTTGATCCTAAAACGAAGAGAATTTTGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107591 TGGAACAAGACAATACAAATTTGATCCTAAAACGAAGAGAATTTTGACTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .
   1370 TCCAGAAAGCTAATAGCTGGTTCAACTGCAGGAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107641 TCCAGAAAGCTAATAGCTGGTTCAACTGCAGGAAAAAT