seq1 = pF1KB5567.tfa, 2016 bp
seq2 = pF1KB5567/gi568815589r_123025600.tfa (gi568815589r:123025600_123279228), 253629 bp

>pF1KB5567 2016
>gi568815589r:123025600_123279228 (Chr9)

(complement)

1-224  (100000-100222)   99% ->
225-390  (105387-105552)   100% ->
391-535  (109183-109327)   100% ->
536-627  (118161-118252)   100% ->
628-723  (118767-118862)   100% ->
724-835  (120022-120133)   100% ->
836-933  (120800-120897)   100% ->
934-1045  (121106-121217)   99% ->
1046-1138  (131359-131451)   100% ->
1139-1338  (132175-132374)   100% ->
1339-1497  (139542-139700)   100% ->
1498-1632  (142714-142848)   100% ->
1633-1773  (143048-143188)   100% ->
1774-1897  (146261-146384)   100% ->
1898-1942  (150971-151015)   100% ->
1943-2016  (153556-153629)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGATCTATTCGATCTTTTGCTAATGATGATCGCCATGTTATGGTGAA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GAGATCTATTCGATCTTTTGCTAATGATGATCGCCATGTTATGGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACATTCAACAATCTATCCATCTCCGGAGGAACTTGAAGCTGTTCAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 ACATTCAACAATCTATCCATCTCCGGAGGAACTTGAAGCTGTTCAGAATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTATCTACTGTTGAATGTGCTCTTAAACATGTCTCAGATTGGTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 TGGTATCTACTGTTGAATGTGCTCTTAAACATGTCTCAGATTGGTTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAACAAATAAAGGCACAAAAACAGAGGGTGAGACAGAAGTGAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 GAAACAAATAAAGGCACAAAAACAGAGGGTGAGACAGAAGTGAAGAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGGCCGGAGAAAACTATTCCAA         GGATCAAGGTGGTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100199 TGAGGCCGGAGAAAACTATTCCAAGTG...TAGGGATCAAGGTGGTCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATTGTGTGGTGTAATGAGGATTGGCCTGGTTGCAAAAGGCTTGCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105404 CATTGTGTGGTGTAATGAGGATTGGCCTGGTTGCAAAAGGCTTGCTGATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGATGATATGGACTTGGAGCTGGTTTTAATGTGCAAAGACAAACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105454 AAAGATGATATGGACTTGGAGCTGGTTTTAATGTGCAAAGACAAACCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGAGACCCTGTTAAATACAGTCAAAGATAATCTTCCTATTCAGATTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105504 AGAGACCCTGTTAAATACAGTCAAAGATAATCTTCCTATTCAGATTCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391         AAACTCACAGAAGAGAAATATCAAGTGGAACAATGTGTAAAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105554 TG...CAGAAACTCACAGAAGAGAAATATCAAGTGGAACAATGTGTAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGGCATCTATTATAATTCGGAATACAAAAGAGCCCACGCTAACTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109225 GAGGCATCTATTATAATTCGGAATACAAAAGAGCCCACGCTAACTTTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGTGATACTTACCTCACCTCTAATTAGGGACGAATTGGAGAAGAAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109275 GGTGATACTTACCTCACCTCTAATTAGGGACGAATTGGAGAAGAAGGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAG         AAAATGTTTCGATGAAAGATCCTCCGGACTTATTGGAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109325 GAGGTA...TAGAAAATGTTTCGATGAAAGATCCTCCGGACTTATTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGGCAGAAATGCCTGAACGCCTTGGCGTCTCTTCGACATGCCAAATGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118199 AGGCAGAAATGCCTGAACGCCTTGGCGTCTCTTCGACATGCCAAATGGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCAG         GCAAGGGCAAATGGATTAAAATCATGTGTAATTGTCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118249 TCAGGTT...TAGGCAAGGGCAAATGGATTAAAATCATGTGTAATTGTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCGCATTCTGCGTGATTTGTGCAACAGAGTCCCCACATGGGCACCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118804 TCCGCATTCTGCGTGATTTGTGCAACAGAGTCCCCACATGGGCACCATTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAAGGATGG         CCACTAGAACTTATATGTGAAAAGTCTATAGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 118854 AAAGGATGGGTA...TAGCCACTAGAACTTATATGTGAAAAGTCTATAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TACTTGTAATAGACCTTTGGGCGCTGGGGAGGCCTTGAGACGAGTAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120054 TACTTGTAATAGACCTTTGGGCGCTGGGGAGGCCTTGAGACGAGTAATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGTGTTTGGCATCTGGAATACTACTTCCTG         GGGGTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 120104 AGTGTTTGGCATCTGGAATACTACTTCCTGGTA...AAGGGGGTCCTGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTTCATGATCCTTGTGAGCGAGACCCAACAGATGCTCTGAGCTATATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120811 CTTCATGATCCTTGTGAGCGAGACCCAACAGATGCTCTGAGCTATATGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CATCCAGCAAAAAGAAGATATTACCCACAGTGCACAG         CATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 120861 CATCCAGCAAAAAGAAGATATTACCCACAGTGCACAGGTA...TAGCATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CACTCAGACTATCAGCCTTTGGTCAGATTTACAAAGTGCTGGAGATGGAC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 121110 CACTCAGACTATCAGCCTTTGGCCAGATTTACAAAGTGCTGGAGATGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCCCTTCCATCTAGTAAGCCTTTTCAGAAGTATTCCTGGTCAGTTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121160 CCCCTTCCATCTAGTAAGCCTTTTCAGAAGTATTCCTGGTCAGTTACTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TAAAGAAG         GTGCTGGGTCTTCAGCTCTAAAGAGGCCATTTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 121210 TAAAGAAGGTG...TAGGTGCTGGGTCTTCAGCTCTAAAGAGGCCATTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAGATGGATTAGGGGATGATAAAGACCCCAACAAGAAGATGAAACGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131392 AAGATGGATTAGGGGATGATAAAGACCCCAACAAGAAGATGAAACGAAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTAAGGAAAA         TTCTGGATAGTAAAGCAATAGACCTTATGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 131442 TTAAGGAAAAGTG...CAGTTCTGGATAGTAAAGCAATAGACCTTATGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGCACTAATGAGGCTAAATCAGATCAGGCCTGGGCTTCAGTATAAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132206 TGCACTAATGAGGCTAAATCAGATCAGGCCTGGGCTTCAGTATAAGCTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TATCTCAGTCTGGCCCCGTTCATGCCCCAGTCTTCACAATGTCTGTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132256 TATCTCAGTCTGGCCCCGTTCATGCCCCAGTCTTCACAATGTCTGTAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTGGATGGCACAACATATGAAGCCTCAGGACCATCCAAGAAAACAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132306 GTGGATGGCACAACATATGAAGCCTCAGGACCATCCAAGAAAACAGCAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACTTCACGTAGCGGTGAAG         GTATTGCAGGCAATGGGATATC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 132356 ACTTCACGTAGCGGTGAAGGTA...CAGGTATTGCAGGCAATGGGATATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CAACAGGCTTTGATGCAGATATTGAATGTATGAGTTCCGATGAAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139564 CAACAGGCTTTGATGCAGATATTGAATGTATGAGTTCCGATGAAAAATCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GATAATGAAAGTAAAAATGAAACAGTGTCTTCAAACTCAAGCAATAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139614 GATAATGAAAGTAAAAATGAAACAGTGTCTTCAAACTCAAGCAATAATAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TGGAAATTCTACAACTGAAACCTCCAGTACCTTAGAG         GTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 139664 TGGAAATTCTACAACTGAAACCTCCAGTACCTTAGAGGTA...TAGGTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GAACTCAGGGCCCTATCCTCACAGCAAGTGGCAAAAACCCTGTAATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142718 GAACTCAGGGCCCTATCCTCACAGCAAGTGGCAAAAACCCTGTAATGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTCAATGAAAAAAGAAGAGGTCTCAAGTATGAACTCATCTCAGAGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142768 CTCAATGAAAAAAGAAGAGGTCTCAAGTATGAACTCATCTCAGAGACTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TGGAAGCCATGACAAGCGCTTTGTAATGGAG         GTAGAAGTAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 142818 TGGAAGCCATGACAAGCGCTTTGTAATGGAGGTG...TAGGTAGAAGTAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 ATGGACAGAAATTCAGAGGCGCAGGTCCAAATAAGAAAGTGGCAAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143058 ATGGACAGAAATTCAGAGGCGCAGGTCCAAATAAGAAAGTGGCAAAGGCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AGTGCAGCTTTAGCTGCCTTGGAGAAACTGTTTTCTGGACCCAATGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143108 AGTGCAGCTTTAGCTGCCTTGGAGAAACTGTTTTCTGGACCCAATGCGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AAATAATAAGAAAAAGAAGATTATCCCTCAG         GCAAAGGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 143158 AAATAATAAGAAAAAGAAGATTATCCCTCAGGTA...CAGGCAAAGGGCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TTGTGAATACAGCTGTGTCTGCAGCAGTCCAAGCTGTTCGGGGCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146271 TTGTGAATACAGCTGTGTCTGCAGCAGTCCAAGCTGTTCGGGGCAGAGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 AGAGGAACTCTAACAAGGGGAGCTTTTGTTGGGGCGACAGCTGCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146321 AGAGGAACTCTAACAAGGGGAGCTTTTGTTGGGGCGACAGCTGCTCCTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CTACATAGCTCCAG         GCTATGGAACACCATATGGTTACAGCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 146371 CTACATAGCTCCAGGTA...TAGGCTATGGAACACCATATGGTTACAGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CAGCTGCCCCTGCCTATG         GTTTACCCAAGAGAATGGTTCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 150998 CAGCTGCCCCTGCCTATGGTA...TAGGTTTACCCAAGAGAATGGTTCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 TTACCCGTTATGAAATTTCCAACATATCCTGTTCCCCACTACTCATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153579 TTACCCGTTATGAAATTTCCAACATATCCTGTTCCCCACTACTCATTCTT

   2150 
   2016 T
        |
 153629 T