seq1 = pF1KB5556.tfa, 993 bp
seq2 = pF1KB5556/gi568815597r_58682078.tfa (gi568815597r:58682078_58883070), 200993 bp

>pF1KB5556 993
>gi568815597r:58682078_58883070 (Chr1)

(complement)

1-993  (100001-100993)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGCAAAGATGGAAACGACCTTCTATGACGATGCCCTCAACGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGCAAAGATGGAAACGACCTTCTATGACGATGCCCTCAACGCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCCTCCCGTCCGAGAGCGGACCTTATGGCTACAGTAACCCCAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCCTCCCGTCCGAGAGCGGACCTTATGGCTACAGTAACCCCAAGATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAAACAGAGCATGACCCTGAACCTGGCCGACCCAGTGGGGAGCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAAACAGAGCATGACCCTGAACCTGGCCGACCCAGTGGGGAGCCTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGCACCTCCGCGCCAAGAACTCGGACCTCCTCACCTCGCCCGACGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGCACCTCCGCGCCAAGAACTCGGACCTCCTCACCTCGCCCGACGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCTCAAGCTGGCGTCGCCCGAGCTGGAGCGCCTGATAATCCAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCTCAAGCTGGCGTCGCCCGAGCTGGAGCGCCTGATAATCCAGTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAACGGGCACATCACCACCACGCCGACCCCCACCCAGTTCCTGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAACGGGCACATCACCACCACGCCGACCCCCACCCAGTTCCTGTGCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGAACGTGACAGATGAGCAGGAGGGCTTCGCCGAGGGCTTCGTGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGAACGTGACAGATGAGCAGGAGGGCTTCGCCGAGGGCTTCGTGCGCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGGCCGAACTGCACAGCCAGAACACGCTGCCCAGCGTCACGTCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTGGCCGAACTGCACAGCCAGAACACGCTGCCCAGCGTCACGTCGGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGCAGCCGGTCAACGGGGCAGGCATGGTGGCTCCCGCGGTAGCCTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGCAGCCGGTCAACGGGGCAGGCATGGTGGCTCCCGCGGTAGCCTCGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGGGGGCAGCGGCAGCGGCGGCTTCAGCGCCAGCCTGCACAGCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGGGGGCAGCGGCAGCGGCGGCTTCAGCGCCAGCCTGCACAGCGAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCGGTCTACGCAAACCTCAGCAACTTCAACCCAGGCGCGCTGAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCGGTCTACGCAAACCTCAGCAACTTCAACCCAGGCGCGCTGAGCAGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCGGCGGGGCGCCCTCCTACGGCGCGGCCGGCCTGGCCTTTCCCGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCGGCGGGGCGCCCTCCTACGGCGCGGCCGGCCTGGCCTTTCCCGCGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCACCACCTGCCCCAGCAGATGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCACCACCTGCCCCAGCAGATGCCCGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCAGCACCCGCGGCTGCAGGCCCTGAAGGAGGAGCCTCAGACAGTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCAGCACCCGCGGCTGCAGGCCCTGAAGGAGGAGCCTCAGACAGTGCCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGATGCCCGGCGAGACACCGCCCCTGTCCCCCATCGACATGGAGTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGATGCCCGGCGAGACACCGCCCCTGTCCCCCATCGACATGGAGTCCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGCGGATCAAGGCGGAGAGGAAGCGCATGAGGAACCGCATCGCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGCGGATCAAGGCGGAGAGGAAGCGCATGAGGAACCGCATCGCTGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAGTGCCGAAAAAGGAAGCTGGAGAGAATCGCCCGGCTGGAGGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAGTGCCGAAAAAGGAAGCTGGAGAGAATCGCCCGGCTGGAGGAAAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAAAACCTTGAAAGCTCAGAACTCGGAGCTGGCGTCCACGGCCAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAAAACCTTGAAAGCTCAGAACTCGGAGCTGGCGTCCACGGCCAACATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTCAGGGAACAGGTGGCACAGCTTAAACAGAAAGTCATGAACCACGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTCAGGGAACAGGTGGCACAGCTTAAACAGAAAGTCATGAACCACGTTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAGTGGGTGCCAACTCATGCTAACGCAGCAGTTGCAAACATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAGTGGGTGCCAACTCATGCTAACGCAGCAGTTGCAAACATTT