seq1 = pF1KB5530.tfa, 360 bp
seq2 = pF1KB5530/gi568815588f_70304402.tfa (gi568815588f:70304402_70520100), 215699 bp

>pF1KB5530 360
>gi568815588f:70304402_70520100 (Chr10)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-331  (115513-115698)   99% ->
332-360  (117315-117343)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTCGTCAGCCGGCAGCGGCCACCAGCCCAGCCAGAGCCGCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTCGTCAGCCGGCAGCGGCCACCAGCCCAGCCAGAGCCGCGCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCACCCGCACCGTGGCCATCAGCGACGCCGCGCAGCTACCTCATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCACCCGCACCGTGGCCATCAGCGACGCCGCGCAGCTACCTCATGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTGCACCACGCCCGGGGGGACGCTCTTCTCCACCACACCGGGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 ATTGCACCACGCCCGGGGGGACGCTCTTCTCCACCACACCGGGAGGTG..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     GAACTCGAATCATTTATGACAGAAAGTTTCTGTTGGATCGTCGCAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .CAGGAACTCGAATCATTTATGACAGAAAGTTTCTGTTGGATCGTCGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCTCCCATGGCTCAGACCCCACCCTGCCATCTGCCCAATATCCCAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 115559 TTCTCCCATGGCTCAGACCCCACCCTGCCACCTGCCCAATATCCCAGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACTAGCCCTGGCACCTTAATTGAAGACTCCAAAGTAGAAGTAAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115609 TCACTAGCCCTGGCACCTTAATTGAAGACTCCAAAGTAGAAGTAAACAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGAACAACTTGAACAATCACGACAGGAAACATGCAGTTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 115659 TTGAACAACTTGAACAATCACGACAGGAAACATGCAGTTGGTA...TAGG

    350     .    :    .    :    .
    333 GGATGATGCTCAGTTCGAGATGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 117316 GGATGATGCTCAGTTCGAGATGGACATC