seq1 = pF1KB5508.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KB5508/gi568815579f_47616613.tfa (gi568815579f:47616613_47841429), 224817 bp

>pF1KB5508 1629
>gi568815579f:47616613_47841429 (Chr19)

1-404  (100001-100404)   100% ->
405-502  (101897-101994)   100% ->
503-915  (109200-109612)   100% ->
916-1080  (119757-119921)   100% ->
1081-1629  (124269-124817)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAGCTGGCTGAAGCGGGGCGGGGCACGGGGCCAGCAGCCCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCAGCTGGCTGAAGCGGGGCGGGGCACGGGGCCAGCAGCCCGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCCGCACGGTGACCTCGGCCCTCAAGGAGCTGTACCGCACGAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCCGCACGGTGACCTCGGCCCTCAAGGAGCTGTACCGCACGAAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCGCTGGAGGAGCACTACCGCTTTGGGGCCTTCCACTCGCCGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCGCTGGAGGAGCACTACCGCTTTGGGGCCTTCCACTCGCCGGCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGACGCAGACTTCGACGGCAAGCCCATGGTGCTGGTGGCCGGCCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGACGCAGACTTCGACGGCAAGCCCATGGTGCTGGTGGCCGGCCAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCACGGGCAAGACCAGCTTCATCCAGTACCTGCTGGAGCAGGAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCACGGGCAAGACCAGCTTCATCCAGTACCTGCTGGAGCAGGAGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGGCTCCCGCGTGGGGCCTGAGCCCACCACCGACTGCTTTGTGGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGGCTCCCGCGTGGGGCCTGAGCCCACCACCGACTGCTTTGTGGCCGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGCACGGGGACACTGAGGGCACCGTGCCCGGCAACGCCCTCGTCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGCACGGGGACACTGAGGGCACCGTGCCCGGCAACGCCCTCGTCGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCGGACAAGCCCTTCCGCAAACTCAACCCTTTCGGAAACACCTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCGGACAAGCCCTTCCGCAAACTCAACCCTTTCGGAAACACCTTCCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACAG         GTTCATGTGTGCCCAGCTCCCTAATCAGGTCCTGGAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACAGGTG...CAGGTTCATGTGTGCCCAGCTCCCTAATCAGGTCCTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGCATCAGCATCATCGACACCCCGGGTATCCTGTCGGGTGCCAAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101934 AGCATCAGCATCATCGACACCCCGGGTATCCTGTCGGGTGCCAAGCAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGTGAGCCGCG         GCTACGACTTCCCGGCCGTGCTGCGCTGGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101984 AGTGAGCCGCGGTG...CAGGCTACGACTTCCCGGCCGTGCTGCGCTGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCGCGGAGCGCGTGGACCTCATCATCCTGCTCTTTGATGCGCACAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109230 TCGCGGAGCGCGTGGACCTCATCATCCTGCTCTTTGATGCGCACAAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGATCTCGGACGAGTTCTCAGAGGCCATCGGCGCGTTGCGGGGCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109280 GAGATCTCGGACGAGTTCTCAGAGGCCATCGGCGCGTTGCGGGGCCATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGACAAGATCCGCGTGGTGCTCAACAAGGCCGACATGGTGGAGACGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109330 GGACAAGATCCGCGTGGTGCTCAACAAGGCCGACATGGTGGAGACGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCTGATGCGCGTCTACGGCGCGCTCATGTGGGCGCTGGGCAAGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109380 AGCTGATGCGCGTCTACGGCGCGCTCATGTGGGCGCTGGGCAAGGTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GGCACGCCCGAGGTGCTGCGCGTCTACATCGGCTCCTTCTGGTCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109430 GGCACGCCCGAGGTGCTGCGCGTCTACATCGGCTCCTTCTGGTCCCAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCTCCTCGTGCCCGACAACCGGCGCCTCTTCGAGCTGGAGGAGCAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109480 CCTCCTCGTGCCCGACAACCGGCGCCTCTTCGAGCTGGAGGAGCAGGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TCTTCCGCGACATCCAGGGCCTGCCCCGGCACGCAGCCTTGCGCAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109530 TCTTCCGCGACATCCAGGGCCTGCCCCGGCACGCAGCCTTGCGCAAGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AACGACCTGGTGAAGAGGGCCCGGCTGGTGCGA         GTTCACGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109580 AACGACCTGGTGAAGAGGGCCCGGCTGGTGCGAGTG...CAGGTTCACGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TTACATCATCAGCTACCTGAAGAAGGAGATGCCCTCTGTGTTTGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119765 TTACATCATCAGCTACCTGAAGAAGGAGATGCCCTCTGTGTTTGGGAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGAACAAGAAGAAGCAGCTGATCCTCAAACTGCCCGTCATCTTTGCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119815 AGAACAAGAAGAAGCAGCTGATCCTCAAACTGCCCGTCATCTTTGCGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 ATTCAGCTGGAACATCACATCTCCCCTGGGGACTTTCCTGATTGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119865 ATTCAGCTGGAACATCACATCTCCCCTGGGGACTTTCCTGATTGCCAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 AATGCAG         GAGCTGCTGATGGCGCACGACTTCACCAAGTTTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119915 AATGCAGGTG...CAGGAGCTGCTGATGGCGCACGACTTCACCAAGTTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 ACTCGCTGAAGCCGAAGCTGCTGGAGGCACTGGACGAGATGCTGACGCAC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 124303 ACTCGCTGAAGCCGAAGCTGCTAGAGGCACTGGACGAGATGCTGACGCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GACATCGCCAAGCTCATGCCCCTGCTGCGGCAGGAGGAGCTGGAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124353 GACATCGCCAAGCTCATGCCCCTGCTGCGGCAGGAGGAGCTGGAGAGCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CGAGGTGGGCGTGCAGGGGGGCGCTTTTGAGGGCACCCACATGGGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124403 CGAGGTGGGCGTGCAGGGGGGCGCTTTTGAGGGCACCCACATGGGCCCGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TTGTGGAGCGGGGACCTGACGAGGCCATGGAGGACGGCGAGGAGGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124453 TTGTGGAGCGGGGACCTGACGAGGCCATGGAGGACGGCGAGGAGGGCTCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GACGACGAGGCCGAGTGGGTGGTGACCAAGGACAAGTCCAAATACGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124503 GACGACGAGGCCGAGTGGGTGGTGACCAAGGACAAGTCCAAATACGACGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GATCTTCTACAACCTGGCGCCTGCCGACGGCAAGCTGAGCGGCTCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124553 GATCTTCTACAACCTGGCGCCTGCCGACGGCAAGCTGAGCGGCTCCAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CCAAGACCTGGATGGTGGGGACCAAGCTCCCCAACTCAGTGCTGGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124603 CCAAGACCTGGATGGTGGGGACCAAGCTCCCCAACTCAGTGCTGGGGCGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 ATCTGGAAGCTCAGCGATGTGGACCGCGACGGCATGCTGGATGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 124653 ATCTGGAAGCTCAGCGATGTGGACCGCGACGGCATGCTGGATGATGAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 GTTCGCGCTGGCCAGCCACCTCATCGAGGCCAAGCTGGAAGGCCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124703 GTTCGCGCTGGCCAGCCACCTCATCGAGGCCAAGCTGGAAGGCCACGGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 TGCCCGCCAACCTGCCCCGTCGCCTGGTGCCACCCTCCAAGCGACGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124753 TGCCCGCCAACCTGCCCCGTCGCCTGGTGCCACCCTCCAAGCGACGCCAC

   1650     .    :    .
   1615 AAGGGCTCCGCCGAG
        |||||||||||||||
 124803 AAGGGCTCCGCCGAG