seq1 = pF1KB5482.tfa, 735 bp
seq2 = pF1KB5482/gi568815575r_138532853.tfa (gi568815575r:138532853_138811003), 278151 bp

>pF1KB5482 735
>gi568815575r:138532853_138811003 (ChrX)

(complement)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-298  (102076-102186)   100% ->
299-402  (107917-108020)   100% ->
403-601  (175349-175547)   100% ->
602-735  (178018-178151)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCTATCGCCAGCTCGCTCATCCGTCAGAAGAGGCAAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCTATCGCCAGCTCGCTCATCCGTCAGAAGAGGCAAGCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGCGCGAGAAATCCAACGCCTGCAAGTGTGTCAGCAGCCCCAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGCGCGAGAAATCCAACGCCTGCAAGTGTGTCAGCAGCCCCAGCAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAGACCAGCTGCGACAAAAACAAGTTAAATGTCTTTTCCCGGGTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAGACCAGCTGCGACAAAAACAAGTTAAATGTCTTTTCCCGGGTCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTTCGGCTCCAAGAAGAGGCGCAGAAGAAGACCAG         AGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 CTCTTCGGCTCCAAGAAGAGGCGCAGAAGAAGACCAGGTC...CAGAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAGCTTAAGGGTATAGTTACCAAGCTATACAGCCGACAAGGCTACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102080 TCAGCTTAAGGGTATAGTTACCAAGCTATACAGCCGACAAGGCTACCACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCAGCTGCAGGCGGATGGAACCATTGATGGCACCAAAGATGAGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102130 TGCAGCTGCAGGCGGATGGAACCATTGATGGCACCAAAGATGAGGACAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACTTACA         CTCTGTTTAACCTCATCCCTGTGGGTCTGCGAGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102180 ACTTACAGTA...CAGCTCTGTTTAACCTCATCCCTGTGGGTCTGCGAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGGCTATCCAAGGAGTTCAAACCAAGCTGTACTTGGCAATGAACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107951 GGTGGCTATCCAAGGAGTTCAAACCAAGCTGTACTTGGCAATGAACAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGGATACTTGTACACCTCG         GAACTTTTCACACCTGAGTGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 108001 AGGGATACTTGTACACCTCGGTA...CAGGAACTTTTCACACCTGAGTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAATTCAAAGAATCAGTGTTTGAAAATTATTATGTGACATATTCATCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175370 AAATTCAAAGAATCAGTGTTTGAAAATTATTATGTGACATATTCATCAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATATACCGTCAGCAGCAGTCAGGCCGAGGGTGGTATCTGGGTCTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175420 GATATACCGTCAGCAGCAGTCAGGCCGAGGGTGGTATCTGGGTCTGAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGAAGGAGAGATCATGAAAGGCAACCATGTGAAGAAGAACAAGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175470 AAGAAGGAGAGATCATGAAAGGCAACCATGTGAAGAAGAACAAGCCTGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCTCATTTTCTGCCTAAACCACTGAAAG         TGGCCATGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 175520 GCTCATTTTCTGCCTAAACCACTGAAAGGTA...CAGTGGCCATGTACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAGCCATCACTGCACGATCTCACGGAGTTCTCCCGATCTGGAAGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178031 GGAGCCATCACTGCACGATCTCACGGAGTTCTCCCGATCTGGAAGCGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCCCAACCAAGAGCAGAAGTGTCTCTGGCGTGCTGAACGGAGGCAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178081 CCCCAACCAAGAGCAGAAGTGTCTCTGGCGTGCTGAACGGAGGCAAATCC

    750     .    :    .    :
    715 ATGAGCCACAATGAATCAACG
        |||||||||||||||||||||
 178131 ATGAGCCACAATGAATCAACG