seq1 = pF1KB5467.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KB5467/gi568815579r_48538888.tfa (gi568815579r:48538888_48745632), 206745 bp

>pF1KB5467 984
>gi568815579r:48538888_48745632 (Chr19)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-142  (100156-100230)   100% ->
143-285  (101064-101206)   100% ->
286-471  (105353-105538)   100% ->
472-567  (105750-105845)   100% ->
568-640  (106012-106084)   100% ->
641-795  (106174-106328)   100% ->
796-961  (106580-106745)   100% ->
962-984  (107489-107511)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGCTGCAGCTCGTCTGAGCGCCCCTCGAGCGCTGGTACTCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGCTGCAGCTCGTCTGAGCGCCCCTCGAGCGCTGGTACTCTGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCACTGGGGGCAGCAG         CTCACATCGGACCAGCACCTGACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCACTGGGGGCAGCAGGTA...CAGCTCACATCGGACCAGCACCTGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCGAGGACTGGTGGAGCTACAAGGATAATCTCCAGGGAAACTTCGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100180 CCGAGGACTGGTGGAGCTACAAGGATAATCTCCAGGGAAACTTCGTGCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 G         GGCCTCCTTTCTGGGGCCTGGTGAATGCAGCGTGGAGTCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100230 GGTG...CAGGGCCTCCTTTCTGGGGCCTGGTGAATGCAGCGTGGAGTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTGTGCTGTGGGGAAGCGGCAGAGCCCCGTGGATGTGGAGCTGAAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101104 GTGTGCTGTGGGGAAGCGGCAGAGCCCCGTGGATGTGGAGCTGAAGAGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCTTTATGACCCCTTTCTGCCCCCATTAAGGCTCAGCACTGGAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101154 TTCTTTATGACCCCTTTCTGCCCCCATTAAGGCTCAGCACTGGAGGAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAG         CTCCGGGGAACCTTGTACAACACCGGCCGACATGTCTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101204 AAGGTA...CAGCTCCGGGGAACCTTGTACAACACCGGCCGACATGTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTTCCTGCCTGCACCCCGACCTGTGGTCAATGTGTCTGGAGGTCCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105391 CTTCCTGCCTGCACCCCGACCTGTGGTCAATGTGTCTGGAGGTCCCCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTTACAGCCACCGACTCAGTGAACTGCGGCTGCTGTTTGGAGCTCGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105441 TTTACAGCCACCGACTCAGTGAACTGCGGCTGCTGTTTGGAGCTCGCGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGAGCCGGCTCGGAACATCAGATCAACCACCAGGGCTTCTCTGCTGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105491 GGAGCCGGCTCGGAACATCAGATCAACCACCAGGGCTTCTCTGCTGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472        GTGCAGCTCATTCACTTCAACCAGGAACTCTACGGGAATTTCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105541 A...CAGGTGCAGCTCATTCACTTCAACCAGGAACTCTACGGGAATTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCGCTGCCTCCCGCGGCCCCAATGGCCTGGCCATTCTCAGCCTCTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105793 GCGCTGCCTCCCGCGGCCCCAATGGCCTGGCCATTCTCAGCCTCTTTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAC         GTTGCCAGTACCTCTAACCCATTCCTCAGTCGCCTCCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105843 AACGTG...CAGGTTGCCAGTACCTCTAACCCATTCCTCAGTCGCCTCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TAACCGCGACACCATCACTCGCATCTCCTACAAGA         ATGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106050 TAACCGCGACACCATCACTCGCATCTCCTACAAGAGTA...CAGATGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCTACTTTCTTCAAGACCTGAGCCTGGAGCTCCTGTTCCCTGAATCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106180 CCTACTTTCTTCAAGACCTGAGCCTGGAGCTCCTGTTCCCTGAATCCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGCTTCATCACCTATCAGGGCTCTCTCAGCACCCCGCCCTGCTCCGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106230 GGCTTCATCACCTATCAGGGCTCTCTCAGCACCCCGCCCTGCTCCGAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGTCACCTGGATCCTCATTGACCGGGCCCTCAATATCACCTCCCTTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106280 TGTCACCTGGATCCTCATTGACCGGGCCCTCAATATCACCTCCCTTCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    796         ATGCACTCCCTGAGACTCCTGAGCCAGAATCCTCCATCTCAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106330 TG...CAGATGCACTCCCTGAGACTCCTGAGCCAGAATCCTCCATCTCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATCTTCCAGAGCCTCAGCGGTAACAGCCGGCCCCTGCAGCCCTTGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106622 ATCTTCCAGAGCCTCAGCGGTAACAGCCGGCCCCTGCAGCCCTTGGCCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAGGGCACTGAGGGGCAACAGGGACCCCCGGCACCCCGAGAGGCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106672 CAGGGCACTGAGGGGCAACAGGGACCCCCGGCACCCCGAGAGGCGCTGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GAGGCCCCAACTACCGCCTGCATG         TGGATGGTGTCCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 106722 GAGGCCCCAACTACCGCCTGCATGGTA...CAGTGGATGGTGTCCCCCAT

   1050     .
    979 GGTCGC
        ||||||
 107506 GGTCGC