seq1 = pF1KB5463.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KB5463/gi568815591r_73600410.tfa (gi568815591r:73600410_73809123), 208714 bp

>pF1KB5463 864
>gi568815591r:73600410_73809123 (Chr7)

(complement)

1-30  (89493-89522)   100% ->
31-108  (100002-100079)   100% ->
109-208  (100436-100535)   100% ->
209-283  (103900-103974)   100% ->
284-357  (104701-104774)   100% ->
358-466  (104868-104976)   100% ->
467-540  (105296-105369)   100% ->
541-678  (106142-106279)   100% ->
679-789  (108284-108394)   100% ->
790-864  (108640-108714)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGACCGAACCCAGGAGCTCCGCACG         GCCAAGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  89493 ATGAAGGACCGAACCCAGGAGCTCCGCACGGTG...CAGGCCAAGGACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CGATGATGATGATGATGTCGCTGTCACCGTGGACCGAGACCGCTTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 CGATGATGATGATGATGTCGCTGTCACCGTGGACCGAGACCGCTTCATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGAGTTCTTTGAGCAG         GTGGAGGAGATTCGAGGCTTCATT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100063 ATGAGTTCTTTGAGCAGGTG...CAGGTGGAGGAGATTCGAGGCTTCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GACAAGATCGCAGAGAACGTGGAGGAGGTGAAGCGGAAGCACAGTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100460 GACAAGATCGCAGAGAACGTGGAGGAGGTGAAGCGGAAGCACAGTGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTGGCATCCCCCAACCCCGATGAGA         AGACGAAGGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100510 CCTGGCATCCCCCAACCCCGATGAGAGTG...CAGAGACGAAGGAGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGGAAGAACTCATGTCCGACATAAAGAAGACAGCAAACAAAGTTCGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103915 TGGAAGAACTCATGTCCGACATAAAGAAGACAGCAAACAAAGTTCGTTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGTTAAAGA         GCATCGAGCAGTCCATCGAGCAAGAGGAAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103965 AAGTTAAAGAGTG...CAGGCATCGAGCAGTCCATCGAGCAAGAGGAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CCTGAACCGCTCCTCCGCTGACCTGAGGATCCGGAAGACACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104732 CCTGAACCGCTCCTCCGCTGACCTGAGGATCCGGAAGACACAGGTG...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    358   CACTCCACGCTGTCCAGAAAGTTTGTGGAGGTCATGTCGGAGTACAAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104866 AGCACTCCACGCTGTCCAGAAAGTTTGTGGAGGTCATGTCGGAGTACAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GCCACGCAGTCCGACTACCGCGAGCGCTGCAAAGGCCGCATCCAGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104916 GCCACGCAGTCCGACTACCGCGAGCGCTGCAAAGGCCGCATCCAGAGGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCTGGAGATCA         CCGGCAGGACCACGACCAGTGAGGAGCTGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104966 GCTGGAGATCAGTG...CAGCCGGCAGGACCACGACCAGTGAGGAGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AGGACATGCTGGAGAGTGGGAACCCCGCCATCTTTGCCTCTGGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 105326 AGGACATGCTGGAGAGTGGGAACCCCGCCATCTTTGCCTCTGGGGTG...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    541    ATCATCATGGACTCCAGCATCTCGAAGCAGGCTCTGAGCGAGATTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106139 CAGATCATCATGGACTCCAGCATCTCGAAGCAGGCTCTGAGCGAGATTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GACGCGGCACAGTGAGATCATCAAGCTGGAGAACAGCATCCGTGAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106189 GACGCGGCACAGTGAGATCATCAAGCTGGAGAACAGCATCCGTGAGCTAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ACGACATGTTCATGGACATGGCCATGCTCGTGGAGAGCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 106239 ACGACATGTTCATGGACATGGCCATGCTCGTGGAGAGCCAGGTG...CAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GGAGAGATGATTGACAGGATCGAGTACAATGTGGAACACGCGGTAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108284 GGAGAGATGATTGACAGGATCGAGTACAATGTGGAACACGCGGTAGACTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGTGGAGAGGGCCGTGTCTGACACCAAGAAGGCCGTCAAGTACCAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108334 TGTGGAGAGGGCCGTGTCTGACACCAAGAAGGCCGTCAAGTACCAGAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AGGCGCGCCGG         AAGAAAATCATGATCATCATCTGCTGTGTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 108384 AGGCGCGCCGGGTC...CAGAAGAAAATCATGATCATCATCTGCTGTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    820 ATCCTGGGCATCGTCATCGCCTCCACTGTTGGGGGCATCTTCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108670 ATCCTGGGCATCGTCATCGCCTCCACTGTTGGGGGCATCTTCGCC